| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| 1.1 引言 | 第13页 |
| 1.2 豆科植物根瘤内微生物 | 第13-15页 |
| 1.2.1 根瘤 | 第13-14页 |
| 1.2.2 根瘤内微生物群落构成 | 第14-15页 |
| 1.3 植物根际微生物生态 | 第15-18页 |
| 1.3.1 根际微生物 | 第15-16页 |
| 1.3.2 影响根际微生物的因素 | 第16-18页 |
| 1.3.3 根际微生物群落的多维性 | 第18页 |
| 1.4 根际微生物与植物生长 | 第18-23页 |
| 1.4.1 植物与微生物的地下相互作用 | 第18-20页 |
| 1.4.2 地上与地下的相互作用 | 第20-21页 |
| 1.4.3 根际对地球生物化学循环的影响 | 第21-23页 |
| 1.5 测序技术与微生物群落生态 | 第23-28页 |
| 1.5.1 高通量测序技术 | 第23-25页 |
| 1.5.2 三代测序技术 | 第25-26页 |
| 1.5.3 高通量测序技术在植物相关微生物群落研究中的应用 | 第26-28页 |
| 1.6 微生物群落的网络分析 | 第28-29页 |
| 1.7 本研究立题依据和研究意义 | 第29-32页 |
| 第二章 豆科植物根瘤内生菌的多样性及其与环境因子的相互作用 | 第32-52页 |
| 2.1 引言 | 第32页 |
| 2.2 试验方法 | 第32-35页 |
| 2.2.1 土壤样品采集 | 第32-33页 |
| 2.2.2 植物种植 | 第33页 |
| 2.2.3 取样方法 | 第33-34页 |
| 2.2.4 样品准备和总DNA提取 | 第34-35页 |
| 2.2.5 16S rRNA测序和分析 | 第35页 |
| 2.2.6 数据分析 | 第35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-49页 |
| 2.3.1 土壤理化性质 | 第35-36页 |
| 2.3.2 测序质量及alpha多样性分析 | 第36-38页 |
| 2.3.3 根瘤内生菌的组成 | 第38-42页 |
| 2.3.4 环境因子对根瘤内生菌的影响 | 第42-45页 |
| 2.3.5 根瘤内生菌在属水平随环境因子的变化 | 第45-49页 |
| 2.4 讨论 | 第49-52页 |
| 2.4.1 根瘤内生菌的构成 | 第49-50页 |
| 2.4.2 根瘤菌和非共生根瘤内生菌群落与环境因子的关系 | 第50-52页 |
| 第三章 豆科植物根瘤内生菌的富集过程 | 第52-69页 |
| 3.1 引言 | 第52页 |
| 3.2 试验方法 | 第52-53页 |
| 3.2.1 样品准备和总DNA提取 | 第52-53页 |
| 3.2.2 16S rRNA测序以及数据分析 | 第53页 |
| 3.3 结果与分析 | 第53-65页 |
| 3.3.1 微生物群落的alpha多样性对环境因子的响应 | 第53-58页 |
| 3.3.2 微生物群落组成对于环境因子的响应 | 第58-63页 |
| 3.3.3 不同根际部位微生物群落的变化 | 第63-65页 |
| 3.3.4 不同根际部位微生物群落的共发生网络 | 第65页 |
| 3.4 讨论 | 第65-69页 |
| 第四章 豆科植物根际促生菌与土壤因子的关系 | 第69-96页 |
| 4.1 引言 | 第69-70页 |
| 4.2 试验方法 | 第70-71页 |
| 4.2.1 取样策略以及数据采集 | 第70页 |
| 4.2.2 数据分析 | 第70-71页 |
| 4.3 结果与分析 | 第71-91页 |
| 4.3.1 植物生长状况 | 第71-73页 |
| 4.3.2 根际微生物群落对环境因子的响应 | 第73-77页 |
| 4.3.3 属水平根际微生物对植物种类的响应 | 第77页 |
| 4.3.4 土壤因子对根际微生物的影响 | 第77-83页 |
| 4.3.5 植物生物量与环境因子的关系 | 第83-85页 |
| 4.3.6 根际微生物与植物生长的关系 | 第85-91页 |
| 4.4 讨论 | 第91-96页 |
| 4.4.1 根际微生物对植物生物量的影响 | 第92-94页 |
| 4.4.2 环境因子对根际微生物的影响 | 第94-96页 |
| 第五章 分根试验中植物长距离信号交流对豆科植物根际微生物群落结构的影响 | 第96-117页 |
| 5.1 引言 | 第96页 |
| 5.2 试验方法 | 第96-98页 |
| 5.2.1 土壤采集 | 第96页 |
| 5.2.2 植物种植以及样品收集 | 第96-97页 |
| 5.2.3 总DNA提取 | 第97-98页 |
| 5.2.4 测序及数据分析 | 第98页 |
| 5.3 结果与分析 | 第98-114页 |
| 5.3.1 根际微生物群落的主要构成及alpha多样性分析 | 第98-105页 |
| 5.3.2 土壤类型和种植方式对根际微生物群落结构的影响 | 第105-107页 |
| 5.3.3 分根试验中根际微生物群落的变化 | 第107-110页 |
| 5.3.4 种植方式对氮循环相关微生物丰度的影响 | 第110-114页 |
| 5.4 讨论 | 第114-117页 |
| 5.4.1 分根试验引起根际微生物群落结构的变化 | 第114-115页 |
| 5.4.2 趋同作用对根际微生物组成的影响 | 第115-117页 |
| 第六章 结论与创新点 | 第117-119页 |
| 6.1 结论 | 第117-118页 |
| 6.2 创新点 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-145页 |
| 附录 | 第145-147页 |
| 致谢 | 第147-148页 |
| 作者简介 | 第148页 |
