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胃癌相关环状RNA的鉴定及其诊断价值分析

摘要第4-7页
abstract第7-10页
引言第14-17页
1 研究内容和技术路线第17-20页
    1.1 研究内容第17-19页
        1.1.1 分析胃癌相关circRNA表达谱并对胃癌相关circRNA进行验证第17页
        1.1.2 分析基于染料法RT-ddPCR的绝对定量法在检测circRNA时的可行性第17页
        1.1.3 建立基于染料法的RT-ddPCR多重检测方法第17页
        1.1.4 检测hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 在组织和血浆中的表达水平第17-18页
        1.1.5 分析血浆中circRNA的来源第18页
        1.1.6 初步探索细胞中circRNA的表达规律第18页
        1.1.7 Hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 作为胃癌标志物的可行性分析第18页
        1.1.8 过表达hsa_circ_0001017 质粒的构建第18-19页
    1.2 技术路线第19-20页
2 材料与方法第20-36页
    2.1 材料第20-22页
        2.1.1 主要仪器第20-21页
        2.1.2 主要试剂第21-22页
        2.1.3 细胞株和载体第22页
    2.2 方法第22-36页
        2.2.1 病例资料第22-24页
        2.2.2 样本的采集与保存第24页
        2.2.3 样本总RNA的提取第24-25页
        2.2.4 PCR引物设计与合成第25-26页
        2.2.5 总RNA的逆转录第26-27页
        2.2.6 q RT-PCR检测组织和细胞样本来源的circRNA第27-28页
        2.2.7 RT-dd PCR检测血浆和细胞培养上清液中的circRNA拷贝数第28-29页
        2.2.8 细胞培养第29-31页
        2.2.9 过表达质粒的构建第31-34页
        2.2.10 瞬时转染过表达质粒第34-35页
        2.2.11 统计分析第35-36页
3 实验结果第36-71页
    3.1 胃癌相关circRNA表达谱的建立及候选circRNA的筛选第36-44页
        3.1.1 建立胃癌相关的组织circRNA表达谱第36-39页
        3.1.2 建立胃癌相关的血浆circRNA表达谱第39-41页
        3.1.3 构建circRNA-miRNA关联图第41-42页
        3.1.4 胃癌相关circRNA芯片的交集分析第42-44页
    3.2 组织circ RNA和血浆circ RNA的精确定量第44-46页
    3.3 血浆中GAPDH作为参照基因的可行性探讨第46-48页
    3.4 建立基于荧光染料法RT-dd PCR的多重circRNA检测方法第48-50页
    3.5 Hsa_circ_ 0001017、hsa_circ_0061276 和hsa_circ_0005556 在组织和血浆中的表达模式第50-55页
        3.5.1 Hsa_circ_ 0001017 和hsa_circ_0061276 在组织和血浆中的表达水平第50-51页
        3.5.2 分析不同circRNA表达模式下的样本分布情况第51-53页
        3.5.3 Hsa_circ_0005556 在组织中的表达水平第53-55页
    3.6 血浆中circRNA的来源分析第55-57页
        3.6.1 组织 -血浆中circRNA的表达水平关联性第55-56页
        3.6.2 细胞培养上清液实验探究血浆circRNA的来源第56-57页
    3.7 分析hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 与宿主基因的关联第57-59页
    3.8 分析hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 与胃癌患者临床病理因素之间的关系第59-63页
    3.9 联合ROC曲线检测hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 作为胃癌标志物的诊断效率第63-65页
    3.10 血浆中hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 表达水平作为预后指标的分析第65-69页
        3.10.1 通过生存曲线分析对患者进行预后评估第65-67页
        3.10.2 分析hsa_circ_0001017 和hsa_circ_0061276 作为预后独立预测因子的可行性第67-69页
    3.11 过表达载体的构建第69-71页
        3.11.1 Hsa_circ_0001017 过表达载体的构建第69-70页
        3.11.2 Hsa_circ_0001017 过表达载体在细胞内上调水平的检测第70-71页
4 全文小结第71-72页
讨论第72-75页
参考文献第75-80页
在学 研究成果第80-82页
附录A 缩略词第82-84页
附录B 综述 肿瘤循环标志物:外泌体中的 circ RNA第84-92页
    参考文献第89-92页
致谢第92页

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