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基于NetworkX的复杂网络特征实现及其在生物网络中的应用

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 引言第11-17页
    1.1 复杂网络第11-12页
    1.2 复杂网络特征及其应用第12-13页
    1.3 国内外研究现状第13-15页
    1.4 论文的主要工作及组织结构第15-17页
第二章 基本概念和相关技术第17-24页
    2.1 图的基本概念第17-18页
    2.2 复杂网络模型第18-21页
        2.2.1 规则网络第18页
        2.2.2 ER随机网络第18页
        2.2.3 WS模型第18-19页
        2.2.4 无尺度网络第19-20页
        2.2.5 社团结构网络第20页
        2.2.6 地理模型第20-21页
    2.3 NetworkX第21-23页
    2.4 本章小结第23-24页
第三章 复杂网络特征第24-36页
    3.1 距离相关的特征度量第24-26页
        3.1.1 平均测地距离第24-25页
        3.1.2 整体效率第25页
        3.1.3 调和平均值第25页
        3.1.4 脆弱性和最大脆弱性第25-26页
    3.2 聚类和环第26-28页
        3.2.1 三角形和连接三元组第26-27页
        3.2.2 聚类系数第27页
        3.2.3 环系数第27-28页
        3.2.4 富人俱乐部系系数第28页
    3.3 度分布和度相关性第28-29页
        3.3.1 最大度和最近邻平均度第29页
    3.4 熵第29-31页
        3.4.1 度分布的熵和剩余度分布的熵第29-30页
        3.4.2 搜索信息、访问信息和隐含信息第30-31页
    3.5 中心性特征第31-32页
        3.5.1 介数中心性第31-32页
        3.5.2 网络的中心点优势第32页
    3.6 谱测度第32-33页
        3.6.1 谱密度第32页
        3.6.2 l阶矩第32-33页
    3.7 社区的识别和特征度量第33-34页
        3.7.1 边的聚类系数第33-34页
    3.8 其它特征度量第34-35页
        3.8.1 边的相互作用第34-35页
        3.8.2 匹配指数第35页
    3.9 本章小结第35-36页
第四章 复杂网络特征实现第36-48页
    4.1 引言第36页
    4.2 复杂网络特征实现第36-45页
        4.2.1 复杂网络数据预处理和构建第36-39页
        4.2.2 复杂网络特征实现第39-45页
    4.3 复杂网络特征在NetworkX中集成第45-47页
    4.4 本章小结第47-48页
第五章 基于NetworkX的复杂生物网络分析第48-63页
    5.1 复杂生物网络第49-50页
    5.2 基于NetworkX的复杂网络可视化第50-52页
    5.3 复杂生物网络整体特征第52-54页
    5.4 复杂生物网络局部特征第54-62页
        5.4.1 节点度分布第54-55页
        5.4.2 脆弱性散点图第55-56页
        5.4.3 脆弱性概率分布图第56-57页
        5.4.4 介数中心性散点图第57-58页
        5.4.5 富人俱乐部系数散点图第58-59页
        5.4.6 聚类系数散点图第59-60页
        5.4.7 最近邻平均度散点图第60-61页
        5.4.8 访问信息散点图第61-62页
    5.5 本章小结第62-63页
总结与展望第63-65页
参考文献第65-71页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第71-72页
致谢第72-73页
附录1 复杂网络特征第73-76页
附录2 其它复杂网络特征实现流程图和代码第76-90页
附表第90页

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