| 致谢 | 第5-10页 |
| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-27页 |
| 1.1 多溴二苯醚的毒性 | 第15-18页 |
| 1.1.1 神经发育性毒性 | 第16-17页 |
| 1.1.2 内分泌干扰作用 | 第17-18页 |
| 1.1.3 潜在的致癌性 | 第18页 |
| 1.2 多溴二苯醚的污染现状 | 第18-19页 |
| 1.3 多溴二苯醚的理化处理方法 | 第19-21页 |
| 1.4 多溴二苯醚的生物修复 | 第21-25页 |
| 1.4.1 厌氧细菌脱溴 | 第21-23页 |
| 1.4.2 真菌降解 | 第23-24页 |
| 1.4.3 好氧细菌降解 | 第24-25页 |
| 1.5 本课题立题依据 | 第25-27页 |
| 第二章 二苯醚降解细菌分离及特性研究 | 第27-47页 |
| 2.1 前言 | 第27页 |
| 2.2 材料 | 第27-30页 |
| 2.2.1 样品来源 | 第27页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第27-28页 |
| 2.2.3 培养基和缓冲液 | 第28-30页 |
| 2.2.4 主要仪器和设备 | 第30页 |
| 2.3 方法 | 第30-32页 |
| 2.3.1 菌株富集、分离 | 第30-31页 |
| 2.3.2 菌株的形态及生理生化鉴定 | 第31页 |
| 2.3.3 降解菌株16S rDNA扩增 | 第31-32页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第32-46页 |
| 2.4.1 二苯醚检测条件的探索优化 | 第32-36页 |
| 2.4.2 二苯醚降解细菌富集筛选 | 第36-37页 |
| 2.4.3 C.basilensis WS对二苯醚及低溴代二苯醚的降解特性 | 第37-41页 |
| 2.4.4 C.basilensis WS降解二苯醚及低溴代二苯醚产物分析 | 第41-46页 |
| 2.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第三章 二苯醚降解菌株突变及降解基因的定位 | 第47-61页 |
| 3.1 前言 | 第47页 |
| 3.2 材料 | 第47-48页 |
| 3.2.1 主要菌株和培养基 | 第47-48页 |
| 3.3 方法 | 第48-53页 |
| 3.3.1 二苯醚降解率测定 | 第48页 |
| 3.3.2 突变库构建及突变筛选 | 第48-49页 |
| 3.3.3 染色体步移 | 第49-53页 |
| 3.3.4 基因组草图构建 | 第53页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第53-60页 |
| 3.4.1 转座子突变库构建条件摸索优化 | 第53-54页 |
| 3.4.2 突变株筛选及鉴定 | 第54-55页 |
| 3.4.3 基因组草图绘制 | 第55-56页 |
| 3.4.4 突变位点鉴定 | 第56-60页 |
| 3.5 本章小结 | 第60-61页 |
| 第四章 二苯醚降解基因功能及降解途径分析 | 第61-90页 |
| 4.1 前言 | 第61页 |
| 4.2 材料 | 第61-62页 |
| 4.3 方法 | 第62-64页 |
| 4.3.1 载体构建方法 | 第62-64页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第64-89页 |
| 4.4.1 功能基因克隆表达 | 第64-70页 |
| 4.4.2 BphA功能及产物鉴定 | 第70-78页 |
| 4.4.3 BphB功能及产物鉴定 | 第78-83页 |
| 4.4.4 BphC功能及产物鉴定 | 第83-87页 |
| 4.4.5 C.basilensis WS降解二苯醚途径分析 | 第87-89页 |
| 4.5 本章小结 | 第89-90页 |
| 第五章 C.basilensis的天然质粒研究及穿梭载体开发 | 第90-103页 |
| 5.1 前言 | 第90页 |
| 5.2 材料 | 第90-93页 |
| 5.3 方法 | 第93-95页 |
| 5.3.1 天然质粒pWS的提取及测序 | 第93页 |
| 5.3.2 穿梭载体pCB1-pCB4的构建 | 第93-94页 |
| 5.3.3 pCB5及其衍生载体的构建 | 第94页 |
| 5.3.4 质粒拷贝数测定 | 第94页 |
| 5.3.5 质粒稳定性测定 | 第94页 |
| 5.3.6 报告载体构建 | 第94-95页 |
| 5.3.7 β-半乳糖苷酶活性检测 | 第95页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第95-102页 |
| 5.4.1 天然质粒pWS的分离及分析 | 第95-96页 |
| 5.4.2 穿梭质粒构建及pWS的最小复制子研究 | 第96-99页 |
| 5.4.3 调整复制子以改变载体拷贝数 | 第99-101页 |
| 5.4.4 基于pCB5构建报告系统检测bph和dmp基因的转录水平 | 第101-102页 |
| 5.5 本章小结 | 第102-103页 |
| 第六章 C.basilensis WS启动子精准预测工具开发及应用 | 第103-115页 |
| 6.1 前言 | 第103-104页 |
| 6.2 方法 | 第104-106页 |
| 6.2.1 PWM预测启动子 | 第104页 |
| 6.2.2 基因组范围内基于PWM搜索启动子 | 第104页 |
| 6.2.3 基于序列比对的启动子方法 | 第104-105页 |
| 6.2.4 算法实现 | 第105-106页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第106-114页 |
| 6.3.1 PWM分析结果 | 第106-108页 |
| 6.3.2 通过序列比对推测大肠杆菌启动子 | 第108-111页 |
| 6.3.3 通过序列比对推测C.basilensis WS启动子 | 第111-114页 |
| 6.4 本章小结 | 第114-115页 |
| 第七章 结论与展望 | 第115-118页 |
| 5.1 结论 | 第115-116页 |
| 5.2 展望 | 第116-118页 |
| 附录1 | 第118-123页 |
| 参考文献 | 第123-129页 |
