水稻蛋白质磷酸化位点预测工具Meta-Server的构建
| 缩略语表 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-16页 |
| ·国内外研究现状 | 第11-15页 |
| ·蛋白质磷酸化位点数据库 | 第11-12页 |
| ·蛋白质磷酸化位点预测工具 | 第12-15页 |
| ·存在的问题与本课题研究思路 | 第15-16页 |
| 2 材料和方法 | 第16-31页 |
| ·技术路线 | 第16-17页 |
| ·技术平台 | 第17页 |
| ·训练数据的收集与整理 | 第17-18页 |
| ·评价指标 | 第18-19页 |
| ·蛋白质磷酸化位点预测工具的选择 | 第19-25页 |
| ·磷酸化位点预测工具NetPhos 2.0 | 第20页 |
| ·磷酸化位点预测工具NetPhosK | 第20-21页 |
| ·磷酸化位点预测工具KinasePhos | 第21-22页 |
| ·磷酸化位点预测工具KinasePhos 2.0 | 第22页 |
| ·磷酸化位点预测工具Scansite | 第22-23页 |
| ·磷酸化位点预测工具DISPHOS | 第23-24页 |
| ·磷酸化位点预测工具PredPhospho | 第24-25页 |
| ·数据的统计分析 | 第25-26页 |
| ·预测工具集成的方法 | 第26-31页 |
| ·未加权表决法，减数加权表决法和加权表决法 | 第26-27页 |
| ·限制性网格搜索法 | 第27-29页 |
| ·基于网格的随机数加权法 | 第29-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-50页 |
| ·数据正负样本集的生成 | 第31页 |
| ·子工具的预测效果 | 第31-39页 |
| ·NetPhos 2.0 | 第31-32页 |
| ·NetPhosk 1.0 | 第32-33页 |
| ·KinasePhos | 第33-34页 |
| ·DISPHOS | 第34-35页 |
| ·Scansite | 第35-36页 |
| ·PredPhospho | 第36-37页 |
| ·Kinasephos2.0 | 第37-38页 |
| ·各工具的预测效果比较 | 第38-39页 |
| ·Meta 工具的预测效果 | 第39-46页 |
| ·未加权表决法，加权表决法，减数加权表决法 | 第39-41页 |
| ·限制性网格搜索法与随机数加权法 | 第41-43页 |
| ·集成工具的ROC 分析 | 第43-46页 |
| ·测试数据集评价 | 第46页 |
| ·网站构建 | 第46-50页 |
| ·数据的预测过程 | 第46-47页 |
| ·用户使用说明 | 第47-50页 |
| 4 讨论 | 第50-52页 |
| ·各子工具的预测效果存在差异 | 第50页 |
| ·集成工具的预测效果得到显著提高 | 第50-52页 |
| ·未加权表决法、加权表决法和减数加权表决法 | 第50-51页 |
| ·PhosphoRice 预测性能 | 第51-52页 |
| REFERENCES | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
