| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 缩略词 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-42页 |
| 1 微生物基因组学 | 第16-20页 |
| 1.1 微生物基因组学发展现状 | 第16-17页 |
| 1.2 微生物比较基因组学 | 第17-19页 |
| 1.3 沙雷氏菌基因组研究现状 | 第19-20页 |
| 2 生物防治相关研究 | 第20-25页 |
| 2.1 微生物生防机制 | 第20-24页 |
| 2.2 粘质沙雷氏菌属生物防治研究 | 第24-25页 |
| 3 Ⅵ型分泌系统(T6SS)研究现状 | 第25-33页 |
| 3.1 T6SS研究概述 | 第25-26页 |
| 3.2 T6SS蛋白组分简介 | 第26-28页 |
| 3.3 T6SS的运行机制 | 第28-29页 |
| 3.4 T6SS的功能 | 第29-30页 |
| 3.5 T6SS的调控 | 第30-32页 |
| 3.6 沙雷氏菌中T6SS研究进展 | 第32-33页 |
| 4 研究目的和意义 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-42页 |
| 第二章 粘质沙雷氏菌FS14全基因组测序和比较基因组学分析及其生防相关因子分析 | 第42-90页 |
| 引言 | 第42页 |
| 1 材料和方法 | 第42-49页 |
| 1.1 材料 | 第42-44页 |
| 1.2 方法 | 第44-49页 |
| 2 结果与讨论 | 第49-83页 |
| 2.1 粘质沙雷氏菌FS14对植物病原菌的拮抗实验 | 第49-52页 |
| 2.2 粘质沙雷氏菌FS14菌株的全基因组测序 | 第52-58页 |
| 2.3 进化分析 | 第58-59页 |
| 2.4 比较基因组学分析 | 第59-67页 |
| 2.5 粘质沙雷氏菌FS14拮抗作用相关基因 | 第67-83页 |
| 3 本章小结 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-90页 |
| 第三章 Ⅵ型分泌系统翻译后调控蛋白的表达、纯化和结晶 | 第90-112页 |
| 引言 | 第90-91页 |
| 1 材料和方法 | 第91-99页 |
| 1.1 材料 | 第91-92页 |
| 1.2 实验方法 | 第92-99页 |
| 2 结果 | 第99-110页 |
| 2.1 目的基因表达载体的构建 | 第99-101页 |
| 2.2 PppA、Fha、PpkA、PpkAN和PpkAC蛋白的小量诱导表达 | 第101-102页 |
| 2.3 PppA、Fha、PpkAN和PpkAC蛋白的纯化 | 第102-104页 |
| 2.4 PpkAN的结晶条件筛选和优化 | 第104-105页 |
| 2.5 PpkAN与ADP、ATP和AMP-PCP的共结晶 | 第105-106页 |
| 2.6 PppA的结晶条件筛选 | 第106-107页 |
| 2.7 Fha蛋白的结晶条件筛选 | 第107-109页 |
| 2.8 晶体衍射 | 第109页 |
| 2.9 PpkAC蛋白核酸酶活性测定 | 第109-110页 |
| 3 讨论 | 第110页 |
| 参考文献 | 第110-112页 |
| 第四章 Ⅵ型分泌系统免疫蛋白Rap2c的表达、纯化和结晶 | 第112-128页 |
| 引言 | 第112页 |
| 1 材料和方法 | 第112-116页 |
| 1.1 材料 | 第112-113页 |
| 1.2 实验方法 | 第113-116页 |
| 2 结果 | 第116-124页 |
| 2.1 rap2c基因表达质粒的构建 | 第116-117页 |
| 2.2 Rap2c的小量诱导表达 | 第117-118页 |
| 2.3 Rap2c的纯化 | 第118-119页 |
| 2.4 Rap2c的结晶条件筛选 | 第119-120页 |
| 2.5 Rap2c的结晶条件的优化 | 第120-121页 |
| 2.6 Rap2c蛋白native晶体的数据收集和分析 | 第121页 |
| 2.7 Rap2c三级结构模拟 | 第121-124页 |
| 3 讨论 | 第124-125页 |
| 参考文献 | 第125-128页 |
| 全文总结 | 第128-130页 |
| 博士论文创新点 | 第130-132页 |
| 附录 | 第132-144页 |
| 1 附图和附表 | 第132-142页 |
| 2 主要溶液的配制 | 第142-144页 |
| 2.1 SDS-PAGE电泳缓冲液 | 第142-143页 |
| 2.2 蛋白纯化缓冲液 | 第143页 |
| 2.3 DNA电泳缓冲液(50×TAE) | 第143-144页 |
| 发表论文 | 第144-146页 |
| 致谢 | 第146页 |
