| 符号说明 | 第5-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第13-25页 |
| 1.1 银杏的价值及古树资源概况 | 第13-16页 |
| 1.2 国内外林木半同胞家系选择研究概述 | 第16-18页 |
| 1.3 银杏半同胞家系的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.3.1 银杏半同胞家系生长量相关研究 | 第18-19页 |
| 1.3.2 银杏半同胞家系生理生化研究 | 第19页 |
| 1.3.3 银杏半同胞家系分子标记研究 | 第19-20页 |
| 1.4 转录组技术应用 | 第20-24页 |
| 1.4.1 转录组技术背景 | 第21页 |
| 1.4.2 转录组技术在银杏中的应用 | 第21-22页 |
| 1.4.3 BSA技术在植物分子标记中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4.4 BSR技术应用 | 第23-24页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-38页 |
| 2.1 试验材料 | 第25-29页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1.1 银杏古树种子采集 | 第25页 |
| 2.1.1.2 银杏半同胞家系建立 | 第25-26页 |
| 2.1.2 试验地概况 | 第26-27页 |
| 2.1.3 主要试剂及仪器 | 第27页 |
| 2.1.4 生物信息分析的数据库及软件 | 第27-29页 |
| 2.2 主要技术路线 | 第29页 |
| 2.3 试验方法 | 第29-38页 |
| 2.3.1 生长量测定 | 第29-30页 |
| 2.3.1.1 古银杏种实(种子)采集及测定 | 第29-30页 |
| 2.3.1.2 银杏半同胞家系试验设计及资源圃建立 | 第30页 |
| 2.3.1.3 银杏半同胞家系生长指标调查 | 第30页 |
| 2.3.2 细胞染色体的分离及测量 | 第30-31页 |
| 2.3.3 银杏半同胞家系AFLP分析 | 第31-35页 |
| 2.3.3.1 银杏半同胞家系AFLP体系建立 | 第31-32页 |
| 2.3.3.2 DNA的提取和AFLP体系的建立 | 第32-35页 |
| 2.3.3.3 遗传多样性指标计算 | 第35页 |
| 2.3.4 银杏半同胞家系转录组分析 | 第35-38页 |
| 2.3.4.1 试材采集 | 第35-36页 |
| 2.3.4.2 银杏叶片RNA提取 | 第36页 |
| 2.3.4.3 cDNA文库构建和测序 | 第36-37页 |
| 2.3.4.4 Unigene功能注释 | 第37页 |
| 2.3.4.5 Unigene结构分析及BSR关联 | 第37页 |
| 2.3.4.6 差异基因表达分析 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-91页 |
| 3.1 银杏半同胞家系生长量分析 | 第38-61页 |
| 3.1.1 一年生银杏半同胞家系生长分析 | 第38-44页 |
| 3.1.1.1 一年生银杏半同胞家系生长指标分析 | 第38-40页 |
| 3.1.1.2 一年生银杏半同胞家系叶片生长指标分析 | 第40-42页 |
| 3.1.1.3 一年生银杏半同胞家系聚类分析 | 第42-43页 |
| 3.1.1.4 一年生银杏半同胞家系相关分析 | 第43-44页 |
| 3.1.1.5 一年生银杏半同胞家系综合评价 | 第44页 |
| 3.1.2 二年生银杏半同胞家系生长分析 | 第44-51页 |
| 3.1.2.1 二年生银杏半同胞家系生长指标分析 | 第44-46页 |
| 3.1.2.2 二年生银杏半同胞家系生长指标聚类分析 | 第46-47页 |
| 3.1.2.3 二年生银杏半同胞家系叶片生长指标分析 | 第47-51页 |
| 3.1.3 三年生银杏半同胞家系生长分析 | 第51-59页 |
| 3.1.3.1 三年生银杏半同胞家系生长指标分析 | 第51-53页 |
| 3.1.3.2 三年生银杏半同胞家系生长指标聚类分析 | 第53-55页 |
| 3.1.3.3 三年生银杏半同胞家系叶片生长指标分析 | 第55-58页 |
| 3.1.3.4 三年生银杏半同胞家系生长量主成分分析 | 第58-59页 |
| 3.1.4 银杏半同胞家系连年生长分析 | 第59-60页 |
| 3.1.5 银杏半同胞家系生长指标综合评价 | 第60-61页 |
| 3.2 银杏半同胞家系染色体分析 | 第61-67页 |
| 3.2.1 染色体倍性 | 第62页 |
| 3.2.2 核型分析 | 第62页 |
| 3.2.3 核型变异趋势分析 | 第62页 |
| 3.2.4 系统聚类分析 | 第62-67页 |
| 3.2.5 银杏半同胞家系核型分析综合评价 | 第67页 |
| 3.3 银杏半同胞家系AFLP分析 | 第67-72页 |
| 3.3.1 不同引物组合的的扩增结果 | 第67-68页 |
| 3.3.2 银杏半同胞家系遗传多样性 | 第68-69页 |
| 3.3.3 银杏半同胞家系遗传分化 | 第69-70页 |
| 3.3.4 银杏半同胞家系AFLP聚类分析 | 第70-72页 |
| 3.3.5 银杏半同胞家系变异趋势 | 第72页 |
| 3.4 银杏古树种实变异与分布 | 第72-79页 |
| 3.4.1 银杏古树种实定性分析 | 第72-76页 |
| 3.4.2 环境、地域与银杏种实形态变异 | 第76-77页 |
| 3.4.3 聚类分析 | 第77-78页 |
| 3.4.4 种子分布 | 第78-79页 |
| 3.5 银杏半同胞家系苗期综合选择 | 第79-81页 |
| 3.6 银杏半同胞家系高生长基因定位 | 第81-91页 |
| 3.6.1 银杏半同胞家系生长分析及样品采集 | 第81-82页 |
| 3.6.2 高通量测序分析 | 第82-85页 |
| 3.6.2.1 高通量测序mRNA序列长度及分布 | 第82-83页 |
| 3.6.2.2 转录组库质量评价 | 第83-85页 |
| 3.6.3 银杏半同胞家系差异基因(DEGs)表达分析 | 第85-86页 |
| 3.6.4 银杏半同胞家系差异基因(DEGs)功能注释 | 第86-89页 |
| 3.6.5 银杏半同胞家系SNP及BSR关联 | 第89-90页 |
| 3.6.6 关联基因与高生长性状表达 | 第90-91页 |
| 4 讨论 | 第91-98页 |
| 4.1 银杏半同胞家系苗期选择 | 第91-93页 |
| 4.2 银杏半同胞家系的遗传多样性与良种选择 | 第93-94页 |
| 4.3 银杏家系间的亲缘关系及种质分布特点 | 第94-96页 |
| 4.4 银杏半同胞家系高生长基因定位 | 第96-98页 |
| 5 结论 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-114页 |
| 附表 | 第114-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第117页 |
