| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-22页 |
| ·艾滋病与HIV概述 | 第10-14页 |
| ·艾滋病流行现状 | 第10页 |
| ·HIV-1 的结构及其生活周期 | 第10-14页 |
| ·以HIV-1 整合酶为靶点的抗艾滋病研究进展 | 第14-19页 |
| ·HIV-1 整合酶的结构 | 第14-16页 |
| ·HIV-1 整合酶的功能 | 第16-17页 |
| ·影响HIV-1 整合酶功能的因素 | 第17-18页 |
| ·HIV-1 整合酶抑制剂的研究进展 | 第18-19页 |
| ·二酮酸及其衍生物类抑制剂的耐药突变现状 | 第19-21页 |
| ·选题意义及研究内容概述 | 第21-22页 |
| 第2章 计算机模拟的原理和方法 | 第22-34页 |
| ·分子模拟的原理 | 第23-30页 |
| ·同源模建 | 第23页 |
| ·分子对接 | 第23-25页 |
| ·分子动力学模拟 | 第25-30页 |
| ·分子模拟的方法 | 第30-34页 |
| ·同源模建 | 第30-31页 |
| ·分子对接 | 第31页 |
| ·分子动力学模拟 | 第31-34页 |
| 第3章 全长HIV-1 整合酶模型的构建及突变导致活性改变和产生耐药的分子机理研究 | 第34-66页 |
| ·研究背景及意义 | 第34页 |
| ·材料与方法 | 第34-36页 |
| ·体系准备 | 第34页 |
| ·全长HIV-1 整合酶二聚体模型的构建与验证 | 第34-35页 |
| ·分子动力学模拟 | 第35-36页 |
| ·分子对接 | 第36页 |
| ·结果与讨论 | 第36-66页 |
| ·二聚体整合酶复合物模型的构建与评价 | 第36-39页 |
| ·突变导致整合酶活性变化的分子机理 | 第39-55页 |
| ·突变导致整合酶产生耐药性的分子机理 | 第55-66页 |
| 第4章 结论与展望 | 第66-68页 |
| ·结论 | 第66-67页 |
| ·展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 附录 DNA核苷酸序列索引 | 第74-76页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78页 |