| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-19页 |
| 第一章 引言 | 第19-55页 |
| ·植物突变体的产生方式及机制 | 第19-23页 |
| ·自发突变 | 第19页 |
| ·化学诱变 | 第19-20页 |
| ·生物手段 | 第20-22页 |
| ·转座子标签法 | 第20-21页 |
| ·T-DNA插入 | 第21-22页 |
| ·物理手段 | 第22-23页 |
| ·重离子束辐射育种介绍 | 第23-34页 |
| ·重离子束物理学优势 | 第23-24页 |
| ·重离子束生物学优势 | 第24-26页 |
| ·重离子束辐照植物的诱变效应 | 第26-28页 |
| ·重离子束辐照育种研究进展 | 第28-34页 |
| ·突变体研究技术 | 第34-46页 |
| ·图位克隆 | 第34-36页 |
| ·图位克隆原理 | 第34-35页 |
| ·拟南芥图位克隆基本路线 | 第35-36页 |
| ·高通量测序 | 第36-41页 |
| ·测序技术的发展 | 第36-38页 |
| ·全基因组重测序技术 | 第38-41页 |
| ·TILLING技术 | 第41-43页 |
| ·TILLING技术原理及基本步骤 | 第41-42页 |
| ·TILLING技术的发展及研究进展 | 第42-43页 |
| ·表型组学 | 第43-46页 |
| ·拟南芥突变体研究进展 | 第46-52页 |
| ·拟南芥作为模式植物的特征 | 第46-48页 |
| ·植物学特征 | 第46-47页 |
| ·遗传分析特征 | 第47-48页 |
| ·拟南芥突变表型分类筛选研究进展 | 第48-52页 |
| ·植物抗性的产生及分子机制 | 第52-53页 |
| ·研究意义 | 第53-55页 |
| 第二章 材料和方法 | 第55-70页 |
| ·实验材料 | 第55页 |
| ·拟南芥材料 | 第55页 |
| ·试剂 | 第55页 |
| ·实验方法 | 第55-69页 |
| ·辐照实验 | 第55-56页 |
| ·当代生物学效应测定 | 第56页 |
| ·碳离子束辐照拟南芥突变体筛选 | 第56-57页 |
| ·突变体表型分析及数据统计 | 第57-60页 |
| ·叶片下表皮细胞印记观察 | 第57-58页 |
| ·叶片亚细胞结构观察 | 第58页 |
| ·叶片细胞结构半薄切片观察 | 第58-59页 |
| ·花粉活力测定 | 第59-60页 |
| ·果荚及种子发育检测 | 第60页 |
| ·叶绿素荧光参数测定 | 第60页 |
| ·基因组重测序 | 第60-62页 |
| ·DNA提取-试剂盒法 | 第60-61页 |
| ·测序及信息分析 | 第61-62页 |
| ·基因图位克隆 | 第62-65页 |
| ·定位群体构建 | 第62页 |
| ·基因定位 | 第62-65页 |
| ·植物材料的Na Cl、ABA及干旱处理 | 第65页 |
| ·植物体内游离脯氨酸含量的测定 | 第65-67页 |
| ·标准曲线的绘制 | 第65-66页 |
| ·样品的测定 | 第66-67页 |
| ·荧光定量PCR | 第67-69页 |
| ·引物设计 | 第67页 |
| ·RNA的提取 | 第67-68页 |
| ·第一链cDNA的合成 | 第68-69页 |
| ·荧光定量反应 | 第69页 |
| ·实验数据统计分析 | 第69-70页 |
| 第三章 碳离子束辐照对拟南芥的当代效应研究及突变筛选 | 第70-82页 |
| ·不同参数的碳离子束辐照对拟南芥M1代存活率的影响 | 第70页 |
| ·不同参数的碳离子束辐照对拟南芥M1代根长及下胚轴的影响 | 第70-73页 |
| ·不同参数的碳离子束辐照对拟南芥M1代株高的影响 | 第73页 |
| ·不同参数的碳离子束辐照对拟南芥M1代育性的影响 | 第73-74页 |
| ·突变体筛选 | 第74页 |
| ·突变表型分类统计 | 第74-77页 |
| ·碳离子束辐照诱变对M2植株群体的表型多效性 | 第77-78页 |
| ·讨论 | 第78-82页 |
| ·碳离子束辐照对拟南芥具有明显的当代效应 | 第78-80页 |
| ·拟南芥M2群体表型变异丰富 | 第80-82页 |
| 第四章 碳离子束辐照诱变获取的拟南芥突变体 | 第82-124页 |
| ·突变体#197表型量化统计分析 | 第82-84页 |
| ·#197叶片表型变异分析 | 第84-89页 |
| ·#197莲座叶的形态结构变异 | 第84-87页 |
| ·#197莲座叶叶绿素荧光检测 | 第87-89页 |
| ·#197育性相关变异分析 | 第89-91页 |
| ·碳离子束辐照对#197基因组水平的诱变效应 | 第91-106页 |
| ·#197的DNA质量检测及文库构建 | 第91-93页 |
| ·Illumina测序clean date基本信息 | 第93-94页 |
| ·与参考基因组比对 | 第94-95页 |
| ·变异检测 | 第95-104页 |
| ·SNP和小Indel检测 | 第95-96页 |
| ·SNP和In Del在基因组的空间分布 | 第96-101页 |
| ·CNV和SV分析 | 第101-104页 |
| ·GO注释 | 第104-106页 |
| ·#197基因图位克隆 | 第106-110页 |
| ·#197的遗传分析 | 第106页 |
| ·#197图位克隆粗定位与精细定位 | 第106-108页 |
| ·#197图位克隆与基因组重测序关联分析 | 第108-110页 |
| ·#197突变体对氯化钠及干旱处理敏感性初步研究 | 第110-117页 |
| ·#197突变体对NaCl及干旱胁迫的表型及生理指标分析 | 第110-113页 |
| ·#197突变体对NaCl胁迫的表型敏感性鉴定 | 第110-113页 |
| ·#197突变体对干旱胁迫的表型敏感性鉴定 | 第113页 |
| ·胁迫响应基因的表达水平检测 | 第113-117页 |
| ·盐胁迫响应基因的表达水平检测 | 第114-116页 |
| ·干旱胁迫响应基因表达水平检测 | 第116-117页 |
| ·讨论 | 第117-124页 |
| ·#197表型发生明显变异 | 第117-118页 |
| ·碳离子束辐照诱发的突变影响了 | 第118-119页 |
| ·碳离子束辐照诱发了 | 第119-121页 |
| ·碳离子束辐照诱发的突变影响了 | 第121-124页 |
| 第五章 结论与展望 | 第124-127页 |
| ·结论 | 第124-125页 |
| ·进一步的工作方向 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-147页 |
| 附录一 缩略词表 | 第147-150页 |
| 附录二 在读期间发表文章 | 第150-151页 |
| 附录三 个人简历 | 第151页 |
