| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-19页 |
| ·肠道菌群的介绍和功能的阐述 | 第10-11页 |
| ·肥胖与肠道菌群的关联研究 | 第11-13页 |
| ·腹脂率对肉鸡生产性能的影响 | 第13-14页 |
| ·鸡肠道菌群的研究进展 | 第14-16页 |
| ·鸡肠道微生物与宿主代谢作用 | 第14页 |
| ·影响鸡肠道微生物的因素 | 第14-16页 |
| ·宏基因组学和生物信息学助力肠道菌群研究 | 第16-18页 |
| ·本研究的目的意义 | 第18-19页 |
| 2 材料和方法 | 第19-24页 |
| ·材料 | 第19-21页 |
| ·样品来源 | 第19-20页 |
| ·本研究采用的试剂盒及常用试剂 | 第20页 |
| ·仪器设备 | 第20-21页 |
| ·试验方法 | 第21-24页 |
| ·粪便样品采集及保存 | 第21页 |
| ·粪便中细菌宏基因组DNA的提取 | 第21页 |
| ·细菌16S rRNA V1-V3可变区扩增 | 第21-22页 |
| ·PCR产物纯化、平衡及测序 | 第22页 |
| ·高质量序列的提取 | 第22页 |
| ·基于16S rRNA高通量测序结果的生物信息学处理 | 第22-23页 |
| ·肠道菌群Whole-genome-shotgun(Metagenomic)序列测定 | 第23页 |
| ·Whole-genome-shotgun序列生物信息学分析 | 第23-24页 |
| ·数据的统计分析及图表绘制 | 第24页 |
| ·核酸序列登录号 | 第24页 |
| 3 结果与讨论 | 第24-49页 |
| ·16S rDNA与Whole-genome-shotgun高通量序列测定信息 | 第24-27页 |
| ·白羽肉鸡肠道核心菌群构成及其功能代谢研究 | 第27-30页 |
| ·高腹脂和低腹脂系肉鸡肠道菌群构成差异分析 | 第30-41页 |
| ·高腹脂和低腹脂系肉鸡肠道菌群α多样性比较 | 第30-31页 |
| ·高腹脂和低腹脂系肉鸡肠道菌群群落结构比较 | 第31-35页 |
| ·基于门属水平的高腹脂和低腹脂系肉鸡肠道细菌构成的研究 | 第35-37页 |
| ·基于Whole-genome-shotgun测序结果的菌种水平差异分析 | 第37-41页 |
| ·高腹脂和低腹脂系肉鸡肠道菌群功能及代谢通路差异分析 | 第41-48页 |
| ·基于功能单元和代谢通路单元的结构性差异分析 | 第41-42页 |
| ·直系同源基因簇(COG)差异分析 | 第42-44页 |
| ·肠道菌群代谢通路差异分析 | 第44-47页 |
| ·肠道菌群短链脂肪酸代谢分析 | 第47-48页 |
| ·肠道菌群物种和功能一致性分析 | 第48页 |
| ·不同物种肥胖模型肠道菌群比较分析 | 第48-49页 |
| 4 结论 | 第49-50页 |
| 5 本论文的主要创新点 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |
