轮烷稳定构象与穿梭过程的理论模拟研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 综述 | 第12-36页 |
| 第一节 引言 | 第12-13页 |
| 第二节 轮烷类分子的特点 | 第13-15页 |
| 第三节 轮烷类分子在药物载体中的应用 | 第15-19页 |
| ·准轮烷在药物运载中的应用 | 第15-17页 |
| ·轮烷在药物运载中的应用 | 第17-19页 |
| 第四节 理论模拟方法 | 第19-24页 |
| ·格点链Monte Carlo方法 | 第20页 |
| ·分子力学 | 第20-21页 |
| ·分子动力学 | 第21-22页 |
| ·自由能计算 | 第22-24页 |
| 第五节 理论模拟方法在轮烷研究中的应用 | 第24-26页 |
| ·分子动力学模拟对轮烷构象的研究 | 第25页 |
| ·分子动力学模拟结合自由能计算对轮烷穿梭的研究 | 第25-26页 |
| 第六节 本论文的选题 | 第26-28页 |
| 参考文献 | 第28-36页 |
| 第二章 分子项链的稳定构象研究 | 第36-50页 |
| 第一节 引言 | 第36-38页 |
| 第二节 理论和方法 | 第38-40页 |
| ·体系构建 | 第38页 |
| ·模拟参数 | 第38页 |
| ·自由能计算参数 | 第38-39页 |
| ·格点链Monte Carlo模拟 | 第39-40页 |
| 第三节 结果与讨论 | 第40-46页 |
| ·自由能曲线分析 | 第40-41页 |
| ·准[3]轮烷形成过程的驱动力分析 | 第41-43页 |
| ·格点链模型的有效性验证 | 第43-45页 |
| ·准[3]轮烷向准[n]轮烷的扩展 | 第45-46页 |
| 第四节 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 第三章 轮烷穿梭的分子模拟研究 | 第50-67页 |
| 第一节 引言 | 第50-51页 |
| 第二节 理论和方法 | 第51-52页 |
| ·体系构建 | 第51页 |
| ·模拟参数 | 第51-52页 |
| ·自由能计算参数 | 第52页 |
| 第三节 结果与讨论 | 第52-62页 |
| ·缺失参数的优化 | 第52-59页 |
| ·自由能曲线分析 | 第59-60页 |
| ·轮烷穿梭的驱动力分析 | 第60-62页 |
| 第四节 结论 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-67页 |
| 第四章 温度和溶剂驱动穿梭的机理研究 | 第67-81页 |
| 第一节 引言 | 第67-68页 |
| 第二节 理论和方法 | 第68-70页 |
| ·体系构建 | 第68页 |
| ·模拟参数 | 第68-69页 |
| ·自由能计算参数 | 第69-70页 |
| 第三节 结果与讨论 | 第70-77页 |
| ·反应坐标的合理性分析 | 第70-71页 |
| ·自由能曲线分析 | 第71-72页 |
| ·轮烷穿梭的驱动力分析 | 第72-77页 |
| 第四节 结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-81页 |
| 第五章 自由能微扰计算中数据后处理插件的开发 | 第81-101页 |
| 第一节 引言 | 第81-82页 |
| 第二节 理论基础 | 第82-88页 |
| ·自由能微扰方法的理论框架 | 第82-83页 |
| ·双向模拟 | 第83-85页 |
| ·自由能微扰计算中的误差分析 | 第85-87页 |
| ·焓变和熵变的计算 | 第87页 |
| ·概率分布的数值模拟 | 第87-88页 |
| 第三节 实现细节 | 第88页 |
| 第四节 应用举例 | 第88-94页 |
| ·分窗口策略的优化 | 第88-90页 |
| ·自由能微扰计算中误差的减小 | 第90-92页 |
| ·焓变和熵变的计算 | 第92-93页 |
| ·概率分布的数值模拟 | 第93-94页 |
| 第五节 结论与展望 | 第94-96页 |
| 参考文献 | 第96-101页 |
| 参考文献 | 第101-120页 |
| 致谢 | 第120-121页 |
| 附录 | 第121-124页 |
| 个人简历 | 第124页 |
