| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 縮略词表 | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-39页 |
| ·转录组学及其在病毒与植物互作研究中的应用 | 第13-20页 |
| ·转录组学概述 | 第13-14页 |
| ·转录组学研究技术 | 第14-16页 |
| ·转录组测序在植物病毒研究中的应用 | 第16-20页 |
| ·蛋白组学及其在病毒与植物互作研究中的应用 | 第20-28页 |
| ·蛋白组学概述 | 第20页 |
| ·蛋白组学研究技术 | 第20-22页 |
| ·蛋白质组学在植物与病毒互作研究中的应用 | 第22-28页 |
| ·甜菜坏死黄脉病毒的研究进展 | 第28-38页 |
| ·甜菜坏死黄脉病毒概述 | 第28-36页 |
| ·甜菜坏死黄脉病毒株系分类 | 第36-38页 |
| ·本论文研究的目的及意义 | 第38-39页 |
| 第二章 材料与方法 | 第39-54页 |
| ·实验材料 | 第39-40页 |
| ·毒源和抗血清 | 第39页 |
| ·植物材料和培养条件 | 第39页 |
| ·菌种和载体 | 第39页 |
| ·侵染性克隆 | 第39-40页 |
| ·引物设计和序列测定 | 第40页 |
| ·酶和化学试剂 | 第40页 |
| ·试剂配制 | 第40-46页 |
| ·常用溶液和试剂 | 第40-41页 |
| ·具体实验所用溶液和试剂 | 第41-46页 |
| ·实验方法 | 第46-54页 |
| ·高温高压蒸汽灭菌 | 第46页 |
| ·λ/HindⅢ+EcoRⅠMarker的制备 | 第46页 |
| ·重组克隆的构建 | 第46-47页 |
| ·BNYVV接种寄主植物及检测 | 第47-49页 |
| ·PEG介导法转化本生烟原生质体 | 第49-50页 |
| ·农杆菌浸润法瞬时表达目的蛋白 | 第50-51页 |
| ·蛋白质双向电泳实验 | 第51-52页 |
| ·real-time PCR检测植物内源基因转录水平的表达差异 | 第52-54页 |
| 第三章 甜菜坏死黄脉病毒RNA5在不同寄主植物上系统侵染能力的比较研究 | 第54-69页 |
| ·RNA4和RNA5在不同寄主上系统侵染能力的比较 | 第54-58页 |
| ·RNA4和RNA5在不同寄主上系统侵染能力的检测 | 第54-56页 |
| ·RNA4和RNA5系统运动能力的比较 | 第56-58页 |
| ·RNA4和RNA5复制能力的比较 | 第58-62页 |
| ·BNYVV转染本生烟原生质体体系的建立及条件优化 | 第58-61页 |
| ·RNA4和RNA5在本生烟原生质体上复制积累量的比较 | 第61-62页 |
| ·RNA5的非翻译区对其在本生烟系统侵染不稳定的影响 | 第62-66页 |
| ·RNA4与RNA5重组病毒在不同寄主上系统侵染能力的比较 | 第63-65页 |
| ·RNA4与RNA5重组病毒在本生烟原生质体中复制积累量的比较 | 第65-66页 |
| ·小结与讨论 | 第66-69页 |
| ·RNA5的复制能力是系统侵染不稳定的关键原因 | 第66-67页 |
| ·RNA5的复制积累量主要与其非翻译区密切相关 | 第67-68页 |
| ·RNA5在不同寄主上复制积累量存在差异可能的原因 | 第68-69页 |
| 第四章 受甜菜坏死黄脉病毒侵染的本生烟的转录组测序及分析 | 第69-90页 |
| ·RNA4可加重BNYVV在本生烟上的症状 | 第69-71页 |
| ·BNYVV不同组分侵染本生烟的症状差异 | 第69页 |
| ·BNYVV不同组分侵染本生烟对病毒CP积累量的影响 | 第69-71页 |
| ·RNA4编码的p31蛋白在细胞内的定位 | 第71-75页 |
| ·p31蛋白融合RFP在植物细胞中的定位 | 第71-73页 |
| ·p31蛋白融合GFP在植物细胞中的定位 | 第73-74页 |
| ·p31和importinα在植物细胞核中存在互作 | 第74-75页 |
| ·本生烟转录组测序 | 第75-86页 |
| ·测序RNA样品的提取与检测 | 第75-76页 |
| ·转录组测序的拼接与注释 | 第76-80页 |
| ·转录组数据差异比较分析 | 第80-81页 |
| ·病害症状相关因子的筛选 | 第81-84页 |
| ·qPCR方法验证测序结果 | 第84-86页 |
| ·赤霉素喷施对RNA4产生症状的影响 | 第86-87页 |
| ·小结与讨论 | 第87-90页 |
| ·BN4侵染改变本生烟转录组表达可能的机制 | 第87-88页 |
| ·BN4对植物防御机制相关基因的影响 | 第88页 |
| ·BN4加重本生烟病害症状的原因分析 | 第88-90页 |
| 第五章 受甜菜坏死黄脉病毒侵染的大果甜菜的转录组和sRNA测序及分析 | 第90-111页 |
| ·BNYVV侵染大果甜菜的症状和分子检测 | 第90-91页 |
| ·大果甜菜转录组测序 | 第91-99页 |
| ·转录组测序的De novo拼接与注释 | 第91-94页 |
| ·大果甜菜的SSRs发掘 | 第94-95页 |
| ·转录组数据的差异比较分析 | 第95-96页 |
| ·qPCR方法验证测序 | 第96-99页 |
| ·受BNYVV侵染的大果甜菜的sRNAs高通量测序分析 | 第99-107页 |
| ·大果甜菜sRNAs高通量测序 | 第99页 |
| ·样品之间不同sRNAs的群体构成 | 第99-102页 |
| ·sRNA的长度分析 | 第102-104页 |
| ·viRNA正负义链的极性分布和5'端核苷酸偏好性 | 第104-106页 |
| ·viRNAs在病毒基因组上的分布 | 第106-107页 |
| ·小结与讨论 | 第107-111页 |
| ·BNYVV侵染对大果甜菜基因表达的影响 | 第107-109页 |
| ·BNYVV不同基因组RNA产生sRNA的表达特征 | 第109-111页 |
| 第六章 受甜菜坏死黄脉病毒侵染的本生烟差异蛋白质组学初步研究 | 第111-122页 |
| ·BNYVV不同组分侵染本生烟后叶片蛋白质双向电泳图谱分析 | 第111-114页 |
| ·本生烟叶片蛋白双向电泳条件的优化 | 第111-112页 |
| ·本生烟叶片蛋白双向电泳分析 | 第112-114页 |
| ·BNYVV不同组分侵染本生烟后叶片蛋白质组的差异分析 | 第114-118页 |
| ·差异表达蛋白点的筛选 | 第114-116页 |
| ·蛋白质点的质谱鉴定 | 第116-118页 |
| ·小结与讨论 | 第118-122页 |
| ·蛋白质双向电泳的条件优化 | 第118-119页 |
| ·BNYVV侵染后本生烟叶片组织蛋白质组差异的结果分析 | 第119-122页 |
| 第七章 结论与展望 | 第122-124页 |
| ·结论 | 第122页 |
| ·展望 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-141页 |
| 致谢 | 第141-143页 |
| 个人简介 | 第143-145页 |
| 附录Ⅰ：引物列表 | 第145-146页 |
| 附录Ⅱ：本生烟unigenes的代谢通路注释 | 第146-151页 |
| 附录Ⅲ：第四章qRT-PCR检测所用到的引物列表 | 第151-154页 |
| 附录Ⅳ：大果甜菜unigenes的代谢通路注释 | 第154-161页 |
| 附录Ⅴ：第五章qRT-PCR检测所用到的引物列表 | 第161-162页 |
