| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| ·生物冶金 | 第11-13页 |
| ·生物冶金简介 | 第11页 |
| ·生物冶金机理 | 第11-13页 |
| ·生物冶金浸矿细菌简介 | 第13页 |
| ·金属离子转运载体NRAMP家族 | 第13-15页 |
| ·二价金属阳离子的作用 | 第13-14页 |
| ·NRAMP家族简介 | 第14-15页 |
| ·RT-qPCR | 第15-18页 |
| ·RT-qPCR基本原理 | 第15-16页 |
| ·检测系统及荧光染料 | 第16页 |
| ·内参基因的确定 | 第16-17页 |
| ·qPCR技术的应用 | 第17-18页 |
| ·课题研究目的和研究内容 | 第18-19页 |
| ·依据和目的 | 第18页 |
| ·论文课题受资助情况 | 第18页 |
| ·论文的主要研究内容 | 第18-19页 |
| 第二章 At.ferrooxidans DC和DY15菌AFE_2126基因和AFE_2920基因的测序及分析 | 第19-41页 |
| ·引言 | 第19页 |
| ·实验材料和方法 | 第19-23页 |
| ·菌株和生长条件 | 第19-20页 |
| ·引物设计 | 第20页 |
| ·细菌基因组的提取 | 第20-21页 |
| ·PCR和测序 | 第21-23页 |
| ·生物信息学分析 | 第23页 |
| ·结果与分析 | 第23-40页 |
| ·PCR扩增产物鉴定 | 第23-24页 |
| ·At.ferrooxidans DC菌的AFE_2126 | 第24-26页 |
| ·At.ferrooxidans DC菌的AFE_2920 | 第26-29页 |
| ·At.ferrooxidans DY15菌的AFE_2126 | 第29-31页 |
| ·At.ferrooxidans DY15菌的AFE_2920 | 第31-34页 |
| ·AFE 2126基因比对 | 第34-36页 |
| ·AFE_2920基因比对 | 第36-38页 |
| ·NRAMP功能保守位点预测 | 第38-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第三章 候选内参基因的测序及分析 | 第41-52页 |
| ·引言 | 第41页 |
| ·实验材料和方法 | 第41-43页 |
| ·菌株和生长条件 | 第41页 |
| ·引物设计 | 第41-42页 |
| ·细菌基因组的提取 | 第42页 |
| ·PCR和测序 | 第42-43页 |
| ·结果和分析 | 第43-51页 |
| ·候选内参基因的性质描述 | 第43-44页 |
| ·候选基因测序结果及序列比对 | 第44-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 内参基因的评估和筛选 | 第52-68页 |
| ·引言 | 第52-53页 |
| ·实验材料和方法 | 第53-57页 |
| ·菌株和生长条件 | 第53页 |
| ·接种和收菌 | 第53页 |
| ·实时荧光定量PCR引物设计 | 第53-54页 |
| ·总RNA的提取 | 第54-55页 |
| ·RNA的完整性及浓度检测 | 第55页 |
| ·cDNA合成 | 第55-56页 |
| ·标准曲线样品的制备 | 第56页 |
| ·实时荧光定量PCR(qPCR) | 第56-57页 |
| ·内参基因的筛选方法 | 第57页 |
| ·结果与分析 | 第57-67页 |
| ·亚铁离子(Fe~(2+))浓度范围的选择 | 第57-58页 |
| ·RNA完整性和质量评估 | 第58页 |
| ·候选内参基因的熔解曲线和标准曲线 | 第58-66页 |
| ·内参基因的评估和筛选 | 第66-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第五章 At.ferrooxidans DC菌NRAMP家族基因的转录分析 | 第68-77页 |
| ·引言 | 第68页 |
| ·材料与方法 | 第68-71页 |
| ·菌株和培养条件 | 第68页 |
| ·接种和收菌 | 第68页 |
| ·引物的设计与检测 | 第68-69页 |
| ·总RNA的提取 | 第69页 |
| ·RNA的完整性及浓度检测 | 第69页 |
| ·cDNA合成 | 第69页 |
| ·标准曲线样品的制备 | 第69页 |
| ·实时荧光定量PCR(qPCR) | 第69-70页 |
| ·目标基因相对定量分析方法 | 第70-71页 |
| ·结果与分析 | 第71-76页 |
| ·目标基因的熔解曲线和标准曲线 | 第71-73页 |
| ·目标基因转录水平分析 | 第73-76页 |
| ·本章小结 | 第76-77页 |
| 第六章 结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-86页 |
| 附录 | 第86-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 研究成果 | 第89-90页 |
| 科研情况 | 第90页 |
