| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-30页 |
| ·植物小RNA的生物合成与作用机理 | 第13-15页 |
| ·microRNA(miRNA)及其他小RNA的生物合成 | 第13-15页 |
| ·miRNA作用机理 | 第15页 |
| ·植物miRNA的生物学功能 | 第15-20页 |
| ·miRNA参与植物组织器官发育的调控 | 第15-17页 |
| ·miRNA参与植物对非生物胁迫响应的调控 | 第17-20页 |
| ·miRNA与干旱胁迫 | 第17-18页 |
| ·miRNA与低磷胁迫 | 第18-19页 |
| ·miRNA与淹水胁迫 | 第19-20页 |
| ·Argonaute蛋白是小RNA行使功能必需的蛋白因子 | 第20-26页 |
| ·Argonaute蛋白的结构与重要性 | 第20-21页 |
| ·拟南芥Argonaute蛋白的主要生物功能与作用机理 | 第21-24页 |
| ·AGO蛋白参与调控配子发育 | 第24-26页 |
| ·玉米中的miRNA和Argonaute蛋白的研究进展 | 第26-28页 |
| ·玉米中的miRNA | 第26-27页 |
| ·miRNA在玉米不同组织器官中的表达差异 | 第26-27页 |
| ·玉米生殖发育相关miRNA | 第27页 |
| ·玉米Argonaute蛋白的研究进展 | 第27-28页 |
| ·Argonaute蛋白结合的小RNA及其靶基因的研究方法 | 第28-29页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第29-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-39页 |
| ·试验材料、处理和取样方法 | 第30-31页 |
| ·试验材料 | 第30页 |
| ·淹水处理 | 第30页 |
| ·组织样本处理 | 第30-31页 |
| ·小RNA测序及数据分析 | 第31页 |
| ·降解组测序和数据处理 | 第31-32页 |
| ·QPCR对miRNA靶基因的验证 | 第32页 |
| ·玉米基因组中ZmAGO蛋白编码基因的生物信息学分析 | 第32-33页 |
| ·鉴定玉米基因组中ZmAGO基因家族成员 | 第32-33页 |
| ·序列比对和系统进化分析 | 第33页 |
| ·ZmAGO蛋白编码基因的时空表达分析 | 第33-34页 |
| ·半定量RT-PCR分析玉米AGO基因家族成员的表达模式 | 第33-34页 |
| ·QPCR分析玉米AGO基因家族成员的表达模式 | 第34页 |
| ·ZmAGO蛋白编码基因的全长cDNA克隆 | 第34-35页 |
| ·ZmAGO18a蛋白的亚细胞定位和原核表达 | 第35-36页 |
| ·ZmAGO18a基因的mRNA原位杂交、蛋白免疫组化 | 第36-38页 |
| ·杂交探针和抗体制备 | 第36-37页 |
| ·石蜡切片 | 第37页 |
| ·mRNA荧光原位杂交 | 第37页 |
| ·蛋白荧光免疫组化 | 第37-38页 |
| ·玉米Knob重复序列的甲基化分析 | 第38-39页 |
| ·甲基化分析引物的设计 | 第38页 |
| ·基因组DNA的提取和重亚硫酸氢盐修饰 | 第38页 |
| ·甲基化PCR产物测序和分析 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-77页 |
| ·RNA的质量与完整性检测 | 第39页 |
| ·玉米冠根中miRNAs的鉴定 | 第39-43页 |
| ·玉米长期淹水胁迫下冠根响应的miRNAs | 第43-48页 |
| ·两个自交系对长期淹水的响应 | 第43-44页 |
| ·玉米冠根中淹水胁迫响应的miRNA | 第44-48页 |
| ·淹水响应的miRNAs基因启动子共有的顺式作用元件 | 第48页 |
| ·淹水胁迫响应miRNAs的靶基因鉴定与验证 | 第48-52页 |
| ·玉米基因组中Argonaute蛋白家族成员的预测和分析 | 第52-61页 |
| ·玉米Argonaute基因的生物信息学预测及其cDNA克隆 | 第52-57页 |
| ·玉米Argonaute基因的系统进化分析 | 第57-58页 |
| ·玉米Argonaute蛋白PIWI结构域的保守性 | 第58-61页 |
| ·玉米中17个ZmAGOs基因存在不同的表达模式 | 第61-65页 |
| ·ZmAGOs在玉米各类根系组织中的表达 | 第61-62页 |
| ·ZmAGOs在玉米繁殖器官和组织中的表达 | 第62-65页 |
| ·ZmAGO18a在玉米雄花穗发育进程中的表达 | 第65-75页 |
| ·玉米雄花穗减数分裂期ZmAGO18a的时空表达 | 第65-72页 |
| ·ZmAGO18a编码产物的亚细胞定位和原核表达 | 第72-73页 |
| ·Knob-repeat DNA甲基化分析 | 第73-75页 |
| ·玉米雄穗中microRNA的表达及ZmAG018a蛋白结合的小RNA | 第75-77页 |
| 4 讨论 | 第77-87页 |
| ·玉米冠根中鉴定到的新miRNAs | 第77-78页 |
| ·玉米淹水胁迫下冠根响应的miRNAs | 第78-79页 |
| ·淹水胁迫下miRNAs介导冠根发育的调控网络 | 第79-80页 |
| ·玉米、水稻和拟南芥中AGO蛋白的保守性和差异性 | 第80-81页 |
| ·玉米中AGO基因的时空表达模式 | 第81-83页 |
| ·玉米中ZmAGO18a可能的作用机理 | 第83-87页 |
| 参考文献 | 第87-96页 |
| 附录A | 第96-129页 |
| 附录B | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130页 |
