| 图目录 | 第1-7页 |
| 表目录 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| ·研究背景和研究目的 | 第11-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-15页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第15-17页 |
| 第二章 生物学医学实体间关系挖掘系统介绍 | 第17-35页 |
| ·基于基因的生物学医学文本挖掘系统概述 | 第17-19页 |
| ·基于文献的基因间关系挖掘系统介绍 | 第19-29页 |
| ·基因文献网络系统PubGene | 第19-21页 |
| ·iHOP | 第21-24页 |
| ·Chilibot | 第24-25页 |
| ·CoPub | 第25-27页 |
| ·NetCutter | 第27-28页 |
| ·FACTA/FACTA+ | 第28-29页 |
| ·国内基于文献的基因间相互关系挖掘系统的研究 | 第29-34页 |
| ·基于共现分析的生物学医学文本挖掘 | 第29-31页 |
| ·面向基因的文献组学中枢纽法则提出与应用 | 第31-32页 |
| ·基因交互作用与蛋白质相互作用关系挖掘 | 第32-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第三章 基因间相互关系挖掘系统关键技术研究 | 第35-61页 |
| ·基因间相互关系挖掘系统的关键技术概述 | 第35-39页 |
| ·文本数据的预处理 | 第36-37页 |
| ·生物学医学实体识别 | 第37-38页 |
| ·生物学医学实体之间相互关系抽取 | 第38页 |
| ·实体之间关系可视化 | 第38-39页 |
| ·基因间相互关系挖掘系统关键技术分析 | 第39-52页 |
| ·文本数据的选择与预处理 | 第39-42页 |
| ·基因名实体识别 | 第42-44页 |
| ·基于词典匹配的方法 | 第44-46页 |
| ·基于统计的机器学习方法 | 第46-47页 |
| ·词典与统计概率模型相结合识别基因名实体 | 第47-52页 |
| ·基因间相互关系信息抽取研究 | 第52-58页 |
| ·文本内基因间相互调控关系的类型 | 第52-53页 |
| ·相关动词的抽取与选择 | 第53-55页 |
| ·基于词性标注与模式匹配抽取基因间调控关系 | 第55-58页 |
| ·基因间相互关系可视化研究 | 第58-59页 |
| ·本章小结 | 第59-61页 |
| 第四章 基因间相互关系挖掘系统设计与实现 | 第61-79页 |
| ·基因间相互关系挖掘系统的总体设计与算法流程 | 第61-63页 |
| ·基因相互关系挖掘系统的核心模块设计 | 第63-70页 |
| ·文本的选择与预处理模块 | 第63-64页 |
| ·基因名实体的识别模块 | 第64-67页 |
| ·句子内基因间相互调控关系抽取模块 | 第67-68页 |
| ·文本内挖掘基因间调控关系可视化展示模块 | 第68-70页 |
| ·系统开发环境简介 | 第70页 |
| ·系统的实现 | 第70-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第五章 基于文本的基因间相互关系挖掘系统的运行与测评 | 第79-93页 |
| ·基于文本的基因间相互关系挖掘系统测评概述 | 第79-81页 |
| ·基因名实体识别测评 | 第81-84页 |
| ·测评数据集的选择 | 第81-82页 |
| ·基因名识别测评结果 | 第82-84页 |
| ·相关动词词性标注工具测评 | 第84-85页 |
| ·基因间相互关系抽取测评 | 第85-89页 |
| ·基因间相互关系抽取测评语料的构建 | 第85-86页 |
| ·测评结果比较与分析 | 第86-89页 |
| ·系统的运行结果 | 第89-93页 |
| ·系统挖掘实验方案 | 第89-90页 |
| ·系统挖掘运行结果 | 第90-93页 |
| 第六章 总结与展望 | 第93-97页 |
| ·所做的主要工作 | 第93-94页 |
| ·本文的创新之处 | 第94页 |
| ·存在的问题 | 第94页 |
| ·进一步的工作 | 第94-97页 |
| 参考文献 | 第97-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第105页 |