| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-34页 |
| ·蛋白分子的淀粉样聚集 | 第12-23页 |
| ·淀粉样聚集的机制 | 第13-15页 |
| ·蛋白质分子淀粉样聚集相关疾病及危害 | 第15-17页 |
| ·Amyloid-β聚集问题简述 | 第17-20页 |
| ·hIAPP聚集问题简述 | 第20-23页 |
| ·淀粉样蛋白分子聚集问题的研究历史与进展 | 第23-32页 |
| ·淀粉样蛋白分子聚集问题的实验研究历史及进展 | 第23-27页 |
| ·淀粉样蛋白分子聚集问题的模拟研究历史及进展 | 第27-32页 |
| ·研究目的及内容 | 第32-34页 |
| 第二章 分子模拟研究方法简介 | 第34-44页 |
| ·分子模拟简介 | 第36-41页 |
| ·全原子分子动力学方法 | 第36-37页 |
| ·副本交换分子动力学 | 第37-39页 |
| ·Generalized Born模型 | 第39-41页 |
| ·蛋白构象分析方法 | 第41-44页 |
| ·聚类分析方法 | 第41-42页 |
| ·蛋白质分子二级结构分析 | 第42-44页 |
| 第三章 Amyloid β聚集的模板效应研究 | 第44-72页 |
| ·蛋白质聚集的模板效应 | 第46-49页 |
| ·研究Aβ模板效应的模拟体系 | 第49-52页 |
| ·模板对Aβ自由链构象分布的影响 | 第52-58页 |
| ·模板对自由链二级结构倾向性的影响 | 第52-55页 |
| ·利用Cluster分析方法研究构象分布变化 | 第55-58页 |
| ·模板对Aβ自由链内部相互作用的调控 | 第58-61页 |
| ·模板对自由链内部相互作用网络的影响 | 第58-59页 |
| ·模板对自由链自由能的影响 | 第59-61页 |
| ·自由链与模板的相互作用分析 | 第61-65页 |
| ·模板效应的序列相关性 | 第65-69页 |
| ·本章小结 | 第69-72页 |
| 第四章 Amyloid-β N端电荷对构象调控作用的研究 | 第72-84页 |
| ·电荷相关作用对Aβ聚集的调控 | 第73-76页 |
| ·模拟体系 | 第76-78页 |
| ·Aβ N端无规部分对构象的调控 | 第78-79页 |
| ·电荷状态对Aβ内部相互作用的影响 | 第79-82页 |
| ·本章小结 | 第82-84页 |
| 第五章 结论与展望 | 第84-88页 |
| 参考文献 | 第88-102页 |
| 图片列表 | 第102-104页 |
| 已发表和待发表文章 | 第104-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |