| 致谢 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| 英文摘要 | 第7-10页 |
| 本研究的创新之处 | 第10-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-25页 |
| 1 节旋藻及其分类学研究进展 | 第14-17页 |
| ·节旋藻概述 | 第14-15页 |
| ·节旋藻分类学研究进展 | 第15-17页 |
| 2 系统发育基因组学及其主要分析方法 | 第17-25页 |
| ·系统发育基因组学 | 第17-18页 |
| ·系统发育基因组学分析方法 | 第18-23页 |
| ·单基因序列分析法 | 第18-19页 |
| ·多基因序列分析法 | 第19-21页 |
| ·全基因组分析法 | 第21-22页 |
| ·超级树分析法 | 第22-23页 |
| ·数据处理方法 | 第23-25页 |
| ·距离法 | 第23页 |
| ·最大简约法 | 第23-24页 |
| ·极大似然法 | 第24页 |
| ·贝叶斯法 | 第24-25页 |
| 第二章 基于16S rRNA的节旋藻与螺旋藻分类学地位研究 | 第25-39页 |
| 1 材料与方法 | 第25-26页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·培养条件 | 第25页 |
| ·试剂与仪器 | 第25-26页 |
| ·节旋藻基因组DNA的提取及电泳检测 | 第26页 |
| ·PCR引物设计与扩增 | 第26页 |
| ·PCR产物的克隆及测序 | 第26页 |
| ·序列分析、系统发生树构建 | 第26页 |
| 2 结果与讨论 | 第26-38页 |
| ·节旋藻基因组DNA的提取 | 第26-27页 |
| ·节旋藻和螺旋藻16S rRNA基因序列长度和GC含量的比较 | 第27-29页 |
| ·节旋藻和螺旋藻16S rRNA基因序列的相似性分析 | 第29页 |
| ·节旋藻和螺旋藻分类学地位研究 | 第29-35页 |
| ·Sp-12中16S rRNA基因序列的特异性分析 | 第35-38页 |
| 3 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 钝顶节旋藻品系间的亲缘关系研究 | 第39-55页 |
| 1 材料与方法 | 第39-40页 |
| ·材料 | 第39页 |
| ·PCR引物设计与扩增 | 第39页 |
| ·PCR产物的克隆及测序 | 第39-40页 |
| ·序列分析及系统发生树构建 | 第40页 |
| 2 结果与讨论 | 第40-54页 |
| ·基于16S rRNA基因序列的系统发生树(子树)构建 | 第40-43页 |
| ·16S rRNA的基因长度和差异位点数比较 | 第40页 |
| ·基于16S rRNA基因序列的节旋藻品系间遗传距离分析 | 第40-42页 |
| ·基于16S rRNA基因序列的系统发生树构建 | 第42-43页 |
| ·基于16S-23S rRNA ITS的系统发生树(子树)构建 | 第43-47页 |
| ·16S-23S rRNA ITS的基本结构及差异位点数比较 | 第43-45页 |
| ·基于16S-23S rRNA ITS的节旋藻品系间遗传距离分析 | 第45页 |
| ·基于16S-23S rRNA ITS的系统发生树构建 | 第45-47页 |
| ·基于cpcHID操纵子序列的系统发生树(子树)构建 | 第47-50页 |
| ·cpcHID操纵子的基本结构和差异位点数比较 | 第47页 |
| ·基于cpcHID操纵子序列的节旋藻品系间遗传距离分析 | 第47-49页 |
| ·基于cpcHID操纵子的系统发生树构建 | 第49-50页 |
| ·超级树法构建的钝顶节旋藻品系间的亲缘关系树 | 第50页 |
| ·超级矩阵法构建的钝顶节旋藻品系间的亲缘关系树 | 第50-54页 |
| ·串联序列的长度和差异位点数比较 | 第50-51页 |
| ·串联序列的遗传距离分析 | 第51页 |
| ·超级矩阵法构建的系统发生树 | 第51-54页 |
| 3 小结 | 第54-55页 |
| 第四章 节旋藻生产性状优劣评价的若干分子标记 | 第55-65页 |
| 1 材料和方法 | 第55-57页 |
| ·材料 | 第55页 |
| ·节旋藻总DNA提取及电泳检测 | 第55-56页 |
| ·16S-23S rRNA ITS扩增和分析 | 第56-57页 |
| ·cpcI基因序列的扩增和分析 | 第57页 |
| 2 结果与讨论 | 第57-63页 |
| ·16S-23S rRNA ITS中用作生产性状优劣评价的分子标记 | 第57-60页 |
| ·CpcI中用作生产性状优劣评价的分子标记 | 第60-61页 |
| ·RAPD扩增特异性条带作为生产性状优劣评价标记 | 第61-62页 |
| ·利用exDNA评价生产性状的优劣 | 第62-63页 |
| 3 小结 | 第63-65页 |
| 主要参考文献 | 第65-76页 |
| 研究生期间参与发表的论文 | 第76页 |
