目录 | 第1-7页 |
图表索引 | 第7-9页 |
英文缩略词 | 第9-10页 |
中文摘要 | 第10-12页 |
英文摘要 | 第12-15页 |
第一章 以基因组DNA改变鉴别非浸润性与浸润性膀胱癌的研究 | 第15-62页 |
导论(含文献综述) | 第15-25页 |
1 膀胱癌的分子遗传学异常 | 第16-18页 |
2 非浸润性和浸润性膀胱癌的临床处理及其存在的问题 | 第18-19页 |
3 以分子标志物区分两类膀胱癌的研究进展 | 第19-20页 |
4 微阵列比较基因组杂交及其所用芯片的分类 | 第20-24页 |
5 课题研究目的和基本策略 | 第24-25页 |
材料与方法 | 第25-33页 |
一、实验材料 | 第25-29页 |
1 膀胱癌患者及其新鲜肿瘤组织 | 第25-27页 |
2 主要试剂 | 第27-28页 |
3 主要仪器 | 第28-29页 |
4 主要分析软件 | 第29页 |
二、实验方法 | 第29-33页 |
1 新鲜肿瘤组织基因组DNA提取 | 第29页 |
2 微阵列比较基因组杂交 | 第29-31页 |
3 杂交后芯片的数据分析 | 第31-32页 |
4 实时定量PCR——array CGH分析结果的验证 | 第32-33页 |
结果 | 第33-55页 |
1 array CGH技术在本实验室的建立与稳定 | 第33-34页 |
2 膀胱癌组织的array CGH分析 | 第34-38页 |
·获得高质量基因组DNA | 第34-35页 |
·酶切gDNA | 第35-36页 |
·gDNA的标记、纯化以及与基因芯片杂交 | 第36-37页 |
·杂交后芯片的扫描 | 第37页 |
·杂交后芯片数据的提取 | 第37-38页 |
3 膀胱癌组织的array CGH实验数据的分析 | 第38-52页 |
·芯片的质量控制 | 第38-40页 |
·膀胱癌组织array CGH的数据分析 | 第40-52页 |
4 膀胱癌组织的array CGH分析结果的初步验证 | 第52-55页 |
讨论 | 第55-61页 |
1 array CGH技术平台的建立与应用 | 第55-58页 |
·array CGH技术稳定性的评估 | 第55页 |
·被测组织样品的质量要求 | 第55-56页 |
·实验操作中的质量控制 | 第56页 |
·界定"异常"阈值 | 第56-57页 |
·Smoother处理对实验结果的影响 | 第57-58页 |
2 膀胱癌基因组DNA的改变 | 第58-60页 |
·膀胱癌基因组DNA改变的概况 | 第58页 |
·9号染色体的缺失 | 第58-59页 |
·非浸润性与浸润性膀胱癌基因组DNA发生变化的差异区域 | 第59-60页 |
3 审视与展望 | 第60-61页 |
小结 | 第61-62页 |
第二章 HSPC300异常表达对非小细胞肺癌转移潜能影响的研究 | 第62-114页 |
导论(含文献综述) | 第62-70页 |
1 粘附分子与肿瘤转移 | 第63-64页 |
2 蛋白酶相关的分子与肿瘤转移 | 第64-65页 |
3 细胞凋亡相关的分子与肿瘤转移 | 第65-66页 |
4 细胞运动迁移相关的分子与肿瘤转移 | 第66-67页 |
5 其他与肿瘤转移相关的基因 | 第67-69页 |
6 课题基本研究内容及策略 | 第69-70页 |
材料与方法 | 第70-87页 |
一、实验材料 | 第70-77页 |
1 肺癌患者及其石蜡包埋组织样品 | 第70页 |
2 肺癌细胞系 | 第70页 |
3 菌株及质粒载体 | 第70-71页 |
4 引物序列 | 第71页 |
5 化学合成的siRNA和慢病毒包装的siRNA | 第71-72页 |
6 抗体 | 第72页 |
7 主要试剂(盒) | 第72-73页 |
8 其他主要试剂 | 第73-76页 |
9 主要仪器 | 第76-77页 |
二、实验方法 | 第77-87页 |
1 分子生物学方法 | 第77-83页 |
2 细胞生物学方法 | 第83-86页 |
3 统计学分析 | 第86-87页 |
结果 | 第87-101页 |
1 HSPC300在肺癌组织和细胞系中的表达 | 第87-89页 |
·HSPC300蛋白在肺癌组织中的表达 | 第87-89页 |
·HSPC300 mRNA在肺癌细胞系中的表达 | 第89页 |
2 PG细胞中的HSPC300基因沉默 | 第89-91页 |
·HSPC300基因RNAi序列的设计以及有效siRNA序列的筛选 | 第89-90页 |
·以siRNA沉默HSPC300基因的鉴定 | 第90-91页 |
3 HSPC300基因沉默对PG细胞表型的影响 | 第91-94页 |
·HSPC300基因沉默对细胞形态的影响 | 第91-92页 |
·HSPC300基因沉默对PG细胞迁移/浸润能力的影响 | 第92-93页 |
·HSPC300基因沉默对F-actin的影响 | 第93-94页 |
4 HSPC300调节PG细胞迁移的分子机制 | 第94-99页 |
·外源表达HSPC300-MYC | 第94-96页 |
·HSPC300与WAVE1/WAVE2的相互作用 | 第96-97页 |
·HSPC300对WAVE1/WAVE2丰度的影响 | 第97-99页 |
5 沉默WAVE1/WAVE2对F-actin分布的影响 | 第99-101页 |
·WAVE1/WAVE2 siRNA的筛选 | 第99页 |
·WAVE2基因沉默后F-actin在细胞内的分布发生改变 | 第99-101页 |
讨论 | 第101-113页 |
1 HSPC300蛋白在肺鳞癌中的表达情况及其临床意义 | 第102页 |
2 HSPC300对肺癌细胞迁移及浸润能力的影响 | 第102-104页 |
3 HSPC300对肌动蛋白聚合的调节 | 第104-105页 |
4 HSPC300调节肺癌细胞迁移的分子机制 | 第105-113页 |
小结 | 第113-114页 |
参考文献 | 第114-131页 |
课题资助基金 | 第131-132页 |
致谢 | 第132-134页 |
个人简历 | 第134页 |