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钙离子信号途径依赖性磷酸酶PP2B和PP1α协同激活P-TEFb复合体的分子机制

英文缩略语对照表第1-18页
摘要第18-20页
Abstract第20-22页
第1章 前言第22-48页
   ·真核基因转录的概述第22-27页
     ·真核基因转录循环第22-24页
     ·Pol II的结构第24页
     ·CTD的磷酸化循环第24-26页
     ·多种转录延伸因子及辅助因子参与调控Pol II的催化活性第26-27页
   ·P-TEFb复合体的结构与功能以及活性调控方式第27-36页
     ·P-TEFb复合体的组成简介第27-28页
     ·活化态与非活化态P-TEFb复合体之间高度动态的转换平衡第28-32页
       ·7SK snRNA和HEXIM1蛋白俘获P-TEFb复合体形成抑制态的7SK snRNP复合体第28-29页
       ·Brd4蛋白结合的P-TEFb复合体具备转录活性第29页
       ·P-TEFb复合体活性调控的多层性第29-30页
       ·细胞严密维持活化态与非活化态P-TEFb复合体之间的比例平衡第30-32页
     ·P-TEFb复合体在生理、病理等诸多方面的功能第32-36页
       ·P-TEFb复合体在转录延伸和RNA剪辑过程中的作用第32-34页
       ·P-TEFb复合体是宿主细胞中协同HIV-1转录的关键性因子第34-35页
       ·P-TEFb复合体参与肿瘤发生以及心肌肥大等病理型病变第35-36页
   ·参与心肌肥大信号调控的途径第36-41页
     ·G蛋白耦联受体信号途径第37-38页
     ·MAPK信号途径第38页
     ·P13K-AKT信号途径第38-39页
     ·Calcineur in(PP2B)-NFAT信号途径第39-41页
   ·钙离子信号途径与基因转录的关联第41-43页
     ·Calcineurin-NFAT信号途径调控基因转录的精细特征第41页
     ·CaM依赖性激酶参与基因转录调控第41-43页
     ·PP2B调控的其他转录因子第43页
   ·PP2B的活性调控第43-45页
     ·PP2B天然抑制蛋白第43-44页
     ·调控PP2B活化的分子机制:CaM依赖/非依赖性途径第44-45页
   ·本课题研究的目标、内容和意义第45-48页
     ·研究背景和目标第45-46页
     ·研究内容和意义第46-48页
第2章 实验材料与方法第48-67页
   ·实验药品、试剂与仪器第48-50页
     ·细胞株、菌株和质粒资源第48页
     ·主要试剂和材料第48-49页
     ·主要实验仪器和耗材第49-50页
   ·实验方法第50-67页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒转化第50-52页
       ·感受态细胞的制备第50-51页
       ·质粒转化第51-52页
     ·质粒DNA的制备第52-54页
       ·质粒DNA小量提取第52-53页
       ·质粒大量提取(QIAGEN试剂盒法)第53-54页
     ·质粒DNA亚克隆相关操作第54-58页
       ·DNA限制性内切酶酶切第54页
       ·DNA样品琼脂糖凝胶电泳第54-55页
       ·琼脂糖胶回收DNA片段(QIAGEN试剂盒)第55-56页
       ·DNA连接第56页
       ·特异性ShRNA的构建第56-57页
       ·普通PCR反应第57页
       ·突变PCR反应(改进型QuikChange方案)第57-58页
     ·细胞学相关实验第58-67页
       ·细胞培养第59页
       ·细胞瞬时转染第59-60页
       ·细胞的药物处理第60-61页
       ·全细胞裂解液第61页
       ·细胞核蛋白抽提(NE)第61-62页
       ·免疫共沉淀第62-63页
       ·磷酸酶体外实验第63页
       ·免疫印记实验(Western blot)第63-64页
       ·核酸杂交实验(Northern blot)第64-65页
       ·Luciferase转录活性分析(Promega)第65页
       ·钙离子内流荧光实验第65-67页
第3章 实验结果与讨论第67-114页
   ·结果第67-106页
     ·P-TEFb复合体活性诱导模式以及活性调控的分子信号途径筛选第67-73页
       ·P-TEFb复合体活性诱导模式筛选第67-69页
       ·P-TEFb复合体活性调控分子机制的摸索第69-73页
     ·胞内钙离子信号通路调控P-TEFb复合体的活性第73-84页
       ·UV处理和HMBA辐射能引发的钙离子内流第73页
       ·UV和HMBA处理触发的钙离子内流在7SK snRNP复合体解离及P-TEFb复合体活化上起关键性的作用第73-76页
       ·培养基内含的钙离子是UV和HMBA处理造成7SK snRNP复合体解离的必备条件第76-79页
       ·钙离子信号下游传导因子PP2B和calmodulin也是UV和HMBA处理引发的7SK snRNP复合体解离所必须的第79-84页
     ·PP1 α在PP2B的协助下协同作用引发7SK snRNP复合体的解离并增强Tat激活的HIV-1转录第84-94页
       ·磷酸酶PP1 α也参与了7SK snRNP复合体的解离第84-89页
       ·PP2B与PP1 α在体内协同作用引发7SK snRNP复合体的解离并增强Tat激活的HIV-1转录第89-92页
       ·PP2B协助PP1 α解离7SK snRNP复合体第92-94页
     ·PP1 α去磷酸化CDK9 pT186是UV和HMBA处理引发7SK snRNP复合体解离的核心事件第94-104页
       ·PP2B协助PP1 α去磷酸化CDK9 pT186导致7SK snRNP复合体的解离第95-100页
       ·CDK9 pT186去磷酸化是UV和HMBA处理引发7SK snRNP复合体解离的核心事件第100-104页
     ·补充数据第104-106页
   ·讨论第106-114页
     ·真核基因转录延伸过程调控的新分子机制:CDK9 T186位点磷酸化水平波动式的动态转换以调控P-TEFb复合体活性第106-108页
     ·7SK snRNP复合体解离的分子模式图第108-112页
     ·P-TEFb复合体的活性调控与相关的恶性疾病致病机理再认识第112-114页
参考文献第114-128页
致谢第128-129页
个人简历第129页

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