| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-19页 |
| ·课题研究的背景、目的和意义 | 第12-14页 |
| ·选择性剪接调控机制的研究背景 | 第12-13页 |
| ·选择性剪接调控机制的研究意义 | 第13-14页 |
| ·选择性剪接调控机制的研究现状 | 第14-17页 |
| ·基于剪接差异的选择性剪接模型的框架流程图 | 第17-18页 |
| ·本文的主要工作 | 第18页 |
| ·本文的内容安排 | 第18-19页 |
| 第2章 选择性剪接机制与研究技术 | 第19-28页 |
| ·mRNA前体选择性剪接综述 | 第19-23页 |
| ·基因表达与选择性剪接 | 第19页 |
| ·mRNA前体剪接的分子生物学机理 | 第19-21页 |
| ·选择性剪接的种类 | 第21-22页 |
| ·选择性剪接的调控机制 | 第22页 |
| ·选择性剪接调控因子 | 第22-23页 |
| ·全基因组范围内选择性剪接的研究方法和技术简介 | 第23-27页 |
| ·基于高通量基因芯片的全基因组选择性剪接研究技术 | 第24-25页 |
| ·基于高通量测序的全基因组选择性剪接研究技术 | 第25-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 外显子芯片数据统计分析与处理 | 第28-43页 |
| ·生物芯片技术简介 | 第28-30页 |
| ·基因芯片技术简介 | 第28-29页 |
| ·外显子芯片技术简介 | 第29-30页 |
| ·外显子芯片数据处理流程 | 第30-32页 |
| ·外显子芯片数据校正与标准化 | 第32-33页 |
| ·PSR和基因表达量估计 | 第33-38页 |
| ·PLIER算法 | 第34-37页 |
| ·基因表达量估计 | 第37-38页 |
| ·外显子芯片数据过滤 | 第38-40页 |
| ·外显子选择性剪接分析 | 第40-41页 |
| ·外显子芯片数据的处理结果 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第4章 线性选择性剪接模型与调控因子的预报 | 第43-58页 |
| ·选择性剪接机制的线性模型 | 第43-46页 |
| ·选择调控区域与搜索候选模体 | 第44-45页 |
| ·最小二乘法估计 | 第45-46页 |
| ·结合模体的选择 | 第46页 |
| ·基于蚁群算法的改进搜索算法 | 第46-50页 |
| ·蚁群算法 | 第47页 |
| ·基于蚁群算法的模体搜索方法 | 第47-49页 |
| ·算法的再现性和选择性评价 | 第49-50页 |
| ·实验结果分析 | 第50-57页 |
| ·基于递归最小二乘法的选择性剪接模型结果分析 | 第50-53页 |
| ·基于蚁群改进搜索算法的搜索结果分析 | 第53-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 第5章 基于模糊理论与支持向量机的调控因子功能预报模型 | 第58-68页 |
| ·模糊理论与支持向量机简介 | 第58-61页 |
| ·模糊理论简介 | 第58-59页 |
| ·支持向量机简介 | 第59-61页 |
| ·模型的整体设计与训练 | 第61-64页 |
| ·调控因子作用能力的评价 | 第61-63页 |
| ·支持向量机分类器的设计与训练 | 第63-64页 |
| ·基于模型的调控因子功能的预报 | 第64-67页 |
| ·单个调控因子在选择性剪接过程中的功能预报 | 第64-66页 |
| ·单个调控因子调控功能受其他调控因子的影响 | 第66-67页 |
| ·多个调控因子在选择性剪接过程中的综合调控功能预报 | 第67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-79页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80页 |