| 前言 | 第1-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-34页 |
| ·超分子体系的非共价相互作用 | 第10-15页 |
| ·范德华作用 | 第10-13页 |
| ·氢键作用 | 第13-14页 |
| ·π堆积作用 | 第14-15页 |
| ·π-π堆积作用的研究 | 第15-19页 |
| ·π-π堆积作用的研究意义 | 第15页 |
| ·π-π堆积作用的研究进展 | 第15-17页 |
| ·π-π堆积作用的研究方法 | 第17-19页 |
| ·膜蛋白分子动力学模拟研究 | 第19-22页 |
| ·膜蛋白与膜脂 | 第19-20页 |
| ·膜蛋白的分子动力学模拟介绍 | 第20-21页 |
| ·分子动力学模拟软件介绍 | 第21-22页 |
| ·研究内容与思路 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-34页 |
| 第二章 基本理论方法介绍 | 第34-65页 |
| ·量子化学理论和方法简介 | 第34-40页 |
| ·半经验方法 | 第34-35页 |
| ·从头算方法 | 第35-37页 |
| ·密度泛函方法 | 第37-38页 |
| ·密度泛函理论中的近似方法 | 第38-40页 |
| ·量子化学中的基组 | 第40-44页 |
| ·斯莱特型基组 | 第40页 |
| ·高斯型基组 | 第40-41页 |
| ·压缩高斯型基组 | 第41-43页 |
| ·基组的选择 | 第43-44页 |
| ·分子间弱相互作用的量化研究方法 | 第44-49页 |
| ·超分子法 | 第45页 |
| ·对称性匹配微扰理论 | 第45-49页 |
| ·定域相关方法 | 第49页 |
| ·非共价相互作用研究中的校正方法 | 第49-53页 |
| ·基组重叠误差的校正 | 第49-50页 |
| ·零点能的校正 | 第50-51页 |
| ·完全基组外推校正法 | 第51-52页 |
| ·色散校正密度泛函方法 | 第52-53页 |
| ·分子动力学模拟介绍 | 第53-59页 |
| ·分子力学 | 第53-54页 |
| ·分子力场 | 第54-55页 |
| ·能量最小化 | 第55-56页 |
| ·分子动力学模拟的基本步骤 | 第56-57页 |
| ·分子动力学模拟结果分析方法 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 第三章 喹吖啶酮衍生物分子间π-π堆积作用的理论研究 | 第65-90页 |
| ·引言 | 第65-67页 |
| ·分子模型与计算细节 | 第67-71页 |
| ·分子模型及堆积构型 | 第67-69页 |
| ·计算方法 | 第69-71页 |
| ·PS 和 PD 构型的研究 | 第71-76页 |
| ·PS 构型的研究 | 第71-72页 |
| ·PD 构型的研究 | 第72-74页 |
| ·取代基效应对 PS 和 PD 构型的影响 | 第74-76页 |
| ·APS 和 APD 构型的研究 | 第76-81页 |
| ·APS 构型的研究 | 第76-78页 |
| ·APD 构型的研究 | 第78-80页 |
| ·取代基对 APS 和 APD 构型的影响 | 第80-81页 |
| ·r-APS、r-APD 和 s-PD 构型的研究 | 第81-85页 |
| ·r-APS 和 r-APD 构型的研究 | 第81-84页 |
| ·s-PD 构型的研究 | 第84-85页 |
| ·理论计算与实验结果比较 | 第85-86页 |
| ·本章小结 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-90页 |
| 第四章 混合型喹吖啶酮衍生物分子间π-π堆积作用的理论研究 | 第90-107页 |
| ·引言 | 第90页 |
| ·分子模型与计算方法 | 第90-92页 |
| ·分子模型及堆积构型 | 第90-92页 |
| ·计算方法 | 第92页 |
| ·四种混合型喹吖啶酮衍生物二聚体π-π堆积作用研究 | 第92-103页 |
| ·PS 和 PD 型二聚体间的π-π堆积作用 | 第93-97页 |
| ·APS 和 APD 型二聚体间的π-π堆积作用 | 第97-99页 |
| ·r-APS 和 r-APD 型二聚体间的π-π堆积作用 | 第99-103页 |
| ·喹吖啶酮衍生物 APD 型二聚体间的π-π堆积作用 | 第103-105页 |
| ·两种含 F 喹吖叮酮二聚体 APD 构型的研究 | 第103-104页 |
| ·APD 构型中的π-π堆积作用规律 | 第104-105页 |
| ·本章小结 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-107页 |
| 第五章 人铜转运蛋白 1 第二跨膜区在磷脂膜中聚集结构的研究101 | 第107-117页 |
| ·引言 | 第107-109页 |
| ·人铜转运蛋白 1 第二跨膜区的分子动力学模拟 | 第109-115页 |
| ·模拟体系的构建 | 第109-111页 |
| ·计算细节 | 第111-112页 |
| ·结果分析 | 第112-115页 |
| ·本章小结 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-117页 |
| 作者简介及科研成果 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119-121页 |
| 中文摘要 | 第121-123页 |
| Abstract | 第123-125页 |
