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鹅SREBP-2基因的克隆及禽HLH转录因子的分类和进化分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 文献综述第11-20页
   ·SREBPs对脂质合成的调节第11-12页
   ·SREBPs的结构、功能以及组织表达特异性第12-13页
   ·SREBPs的活化和加工第13-15页
   ·螺旋─环─螺旋(HLH)基序的基本特征第15-17页
     ·螺旋─环─螺旋(HLH)基序的结构和功能第15-16页
     ·二聚体形成的作用力第16-17页
   ·HLH转录因子的功能和分类第17-18页
   ·SREBP-2相关结构域的进化第18页
   ·实验的目的和意义第18-20页
2 材料与方法第20-28页
   ·实验材料第20页
   ·仪器和试剂第20-22页
     ·主要仪器第20页
     ·主要试剂第20-21页
     ·注意事项第21-22页
   ·实验方法第22-26页
     ·引物设计第22页
     ·肝脏总RNA的抽提第22-23页
     ·RNA质量和浓度检测第23-24页
     ·cDNA第一条链的合成(RT)第24页
     ·进行PCR反应第24-25页
     ·克隆测序第25-26页
   ·数据处理与统计分析第26-28页
     ·用到的数据库第26页
     ·用到的检索工具第26页
     ·用到的预测分析工具第26-27页
     ·用到的分析软件第27页
     ·数据的冗余与偏差第27-28页
3 结果分析第28-46页
   ·测序结果及分析第28-29页
   ·bHLH-zip基序的高级结构分析第29-33页
     ·二级结构预测第29-30页
     ·鹅SREBP-2 bHLH-zip基序理化性质与结构特征第30-32页
     ·三级结构预测第32-33页
   ·SREBP-2 bHLH-zip基序核苷酸序列在物种间的进化关系第33-34页
     ·SREBP-2 bHLH-zip基序核酸序列相似性及变异分析第33-34页
     ·SREBP-2 bHLH-zip基序核酸序列的进化关系第34页
   ·SREBP-2 bHLH-zip基序的多态性及理化性质差异第34-37页
     ·SREBP-2 bHLH-zip基序的多态性第34-35页
     ·物种间bHLH-zip基序理化性质差异第35-37页
   ·bHLH-zip基序相关结构域的多样性第37-38页
   ·鹅SREBP-2与禽类基因组中HLH蛋白的关系第38-46页
     ·禽类HLH蛋白基因家族间的分类关系第39-44页
     ·禽类HLH蛋白基因家族间的遗传距离第44-46页
4 讨论第46-55页
   ·SREBP-2 bHLH-zip基序序列与结构分析第46-47页
     ·SREBP-2基序的序列变异分析第46页
     ·SREBP-2 bHLH-zip基序氨基酸多态性对其理化性质的影响第46-47页
   ·SREBP-2 bHLH-zip基序进化的保守性分析第47-49页
   ·HLH转录因子的分类与比较第49-51页
     ·HLH蛋白相关结构域在基因组中进化的保守性第49页
     ·HLH转录因子的分类第49-51页
   ·HLH转录因子在基因组中的分类比较第51-54页
     ·禽基因组中HLH转录因子的分类第51页
     ·不同基因组间HLH转录因子分类比较第51-54页
   ·HLH蛋白分类时的数据处理与偏差第54-55页
5 结论第55-56页
参考文献第56-63页
致谢第63-64页
附录一 SREBP-2物种间核酸序列比对第64-66页
附录二 PSI-BLAST搜索结果第66-67页
附录三 HLH蛋白比对结果第67-70页
附录四 攻读学位期间参与的科研项目和发表的学术论文目录第70页

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