| 缩略语表 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 1 引言 | 第14-16页 |
| 2 文献综述 | 第16-32页 |
| 2．1 核心种质的概念 | 第16-17页 |
| 2．1．1 核心种质概念的提出 | 第16页 |
| 2．1．2 核心种质概念的发展 | 第16-17页 |
| 2．1．2．1 合成核心种质 | 第16-17页 |
| 2．1．2．2 分级核心种质 | 第17页 |
| 2．1．2．3 微型核心种质 | 第17页 |
| 2．2 构建核心种质的数据 | 第17-21页 |
| 2．2．1 使用农艺、形态等性状数据构建核心种质 | 第18-19页 |
| 2．2．2 使用分子标记数据构建核心种质 | 第19-20页 |
| 2．2．3 使用农艺、形态等性状结合分子标记数据构建核心种质 | 第20-21页 |
| 2．3 核心种质的构建 | 第21-25页 |
| 2．3．1 种质材料原始群体的分组 | 第21-22页 |
| 2．3．2 组内核心子集的构建 | 第22-25页 |
| 2．4 核心种质的评价 | 第25-27页 |
| 2．4．1 连续性数据的评价 | 第25-26页 |
| 2．4．1．1 连续性数据 | 第25页 |
| 2．4．1．2 连续性数据评价的研究进展 | 第25-26页 |
| 2．4．2 间断性数据的评价 | 第26-27页 |
| 2．4．2．1 间断性数据 | 第26页 |
| 2．4．2．2 间断性数据评价的研究进展 | 第26-27页 |
| 2．5 核心种质的应用 | 第27-29页 |
| 2．5．1 利用核心种质进行种质资源评价 | 第27-28页 |
| 2．5．2 利用核心种质进行育种研究 | 第28-29页 |
| 2．6 种质资源研究中的蒙特卡洛模拟研究 | 第29-32页 |
| 2．6．1 蒙特卡洛方法概述 | 第29页 |
| 2．6．2 蒙特卡洛模拟的一般原理 | 第29-30页 |
| 2．6．3 蒙特卡洛模拟在种质资源研究中的应用 | 第30-32页 |
| 2．6．3．1 种质资源保存 | 第30页 |
| 2．6．3．2 统计检验 | 第30-31页 |
| 2．6．3．3 方法评价 | 第31-32页 |
| 3 植物种质资源材料基因型值的预测 | 第32-35页 |
| 3．1 模型与方法 | 第32-34页 |
| 3．1．1 种质资源遗传试验的模型 | 第32-33页 |
| 3．1．2 基于混合线性模型的基因型值无偏预测方法 | 第33-34页 |
| 3．2 种质资源材料基因型值的无偏预测 | 第34-35页 |
| 3．2．1 90个水稻材料基因型值的无偏预测 | 第34页 |
| 3．2．2 168个棉花材料基因型值的无偏预测 | 第34-35页 |
| 4 最小距离逐步取样法构建核心种质 | 第35-46页 |
| 4．1 材料与方法 | 第35-37页 |
| 4．1．1 材料 | 第35页 |
| 4．1．2 核心子集的构建方法 | 第35-36页 |
| 4．1．2．1 最小距离逐步取样法 | 第35-36页 |
| 4．1．2．2 逐步聚类随机取样法 | 第36页 |
| 4．1．3 遗传距离的计算和聚类方法 | 第36页 |
| 4．1．4 核心子集的评价 | 第36-37页 |
| 4．1．5 数据处理 | 第37页 |
| 4．2 结果与分析 | 第37-44页 |
| 4．2．1 相同取样比例下 LDSS法与 SCR法的比较 | 第37-39页 |
| 4．2．2 不同聚类方法对 LDSS法构建核心子集的影响 | 第39-44页 |
| 4．3 讨论 | 第44-46页 |
| 5 核心种质评价参数及取样比例的研究 | 第46-58页 |
| 5．1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 5．1．1 种质资源群体的蒙特卡洛模拟 | 第46-47页 |
| 5．1．2 核心子集的评价参数 | 第47-48页 |
| 5．1．3 核心子集的构建方法 | 第48页 |
| 5．1．4 核心子集的构建 | 第48页 |
| 5．1．5 数据处理 | 第48页 |
| 5．2 结果与分析 | 第48-56页 |
| 5．2．1 各个评价参数的有效性分析 | 第48-55页 |
| 5．2．2 各个评价参数的稳定性分析 | 第55页 |
| 5．2．3 各个评价参数的敏感性分析 | 第55-56页 |
| 5．3 讨论 | 第56-58页 |
| 6 不同遗传距离构建核心种质的效果 | 第58-66页 |
| 6．1 材料与方法 | 第58-59页 |
| 6．1．1 材料 | 第58页 |
| 6．1．2 核心子集的构建 | 第58-59页 |
| 6．1．3 核心子集评价参数的筛选 | 第59页 |
| 6．1．4 各个遗传距离有效性的比较 | 第59页 |
| 6．1．5 数据处理 | 第59页 |
| 6．2 结果与分析 | 第59-64页 |
| 6．2．1 核心子集评价参数的有效性分析 | 第59-60页 |
| 6．2．2 不同取样比例下不同遗传距离构建核心子集的代表性比较 | 第60-61页 |
| 6．2．3 不同遗传距离构建核心子集的代表性随取样比例升高的变化趋势 | 第61-63页 |
| 6．2．4 不同系统聚类方法结合不同遗传距离构建核心子集的研究 | 第63-64页 |
| 6．3 讨论 | 第64-66页 |
| 7 不同遗传距离构建核心种质的蒙特卡洛模拟及性状数目与构建核心种质的关系 | 第66-75页 |
| 7．1 材料与方法 | 第66-67页 |
| 7．1．1 材料 | 第66页 |
| 7．1．2 核心子集的构建 | 第66页 |
| 7．1．3 蒙特卡洛模拟研究 | 第66-67页 |
| 7．1．4 核心子集的主成分分析和聚类分析 | 第67页 |
| 7．1．5 性状数目与核心子集构建关系的研究 | 第67页 |
| 7．1．6 数据处理 | 第67页 |
| 7．2 结果与分析 | 第67-73页 |
| 7．2．1 蒙特卡洛模拟分析 | 第67-68页 |
| 7．2．2 基于 Seuclid距离的LDSS法构建核心子集有效性的验证 | 第68-69页 |
| 7．2．3 评价参数随性状数目和取样比例逐渐增大的变化趋势 | 第69-73页 |
| 7．3 讨论 | 第73-75页 |
| 8 整合基因型值和分子标记信息构建核心种质的研究 | 第75-84页 |
| 8．1 材料与方法 | 第75-77页 |
| 8．1．1 材料 | 第75页 |
| 8．1．2 混合遗传距离的计算 | 第75-76页 |
| 8．1．3 核心子集的构建 | 第76-77页 |
| 8．1．3．1 逐步聚类随机取样(SCR)法 | 第76页 |
| 8．1．3．2 最小距离逐步取样(LDSS)法 | 第76-77页 |
| 8．1．4 核心子集的评价参数 | 第77页 |
| 8．1．5 数据处理 | 第77页 |
| 8．2 结果与分析 | 第77-82页 |
| 8．2．1 整合基因型值和分子标记信息用于 SCR方法构建核心子集 | 第77-78页 |
| 8．2．1．1 SCR方法构建的核心子集 | 第77页 |
| 8．2．1．2 SCR方法构建的核心子集在基因型值评价参数上的比较 | 第77-78页 |
| 8．2．1．3 SCR方法构建的核心子集在分子标记信息评价参数上的比较 | 第78页 |
| 8．2．2 整合基因型值和分子标记信息用于 LDSS方法构建核心子集 | 第78-82页 |
| 8．2．2．1 基因型值遗传距离与常用遗传距离的比较 | 第78-80页 |
| 8．2．2．2 分子标记信息遗传距离与常用遗传距离的比较 | 第80页 |
| 8．2．2．3 基因型值遗传距离、分子标记信息遗传距离和混合遗传距离的比较 | 第80-82页 |
| 8．3 讨论 | 第82-84页 |
| 9 参考文献 | 第84-97页 |
| 10 附录:攻读博士期间完成的主要论著及科研成果 | 第97页 |
