第一章 引言 | 第1-11页 |
第二章 计算机辅助药物设计 | 第11-21页 |
·计算机辅助药物设计的发展历史和趋势 | 第11-12页 |
·计算机辅助药物设计的策略 | 第12-19页 |
·间接药物分子设计 | 第13-15页 |
·直接药物设计 | 第15-19页 |
·与组合化学相对应的计算机辅助药物设计 | 第19页 |
·本课题药物分子设计方法的选用 | 第19-21页 |
第三章 血管紧张素转换酶及其抑制剂的研究进展 | 第21-29页 |
·确定研究对象 | 第21页 |
·血管紧张素转换酶的生物学作用 | 第21-22页 |
·血管紧张素转换酶的三维结构分析 | 第22-25页 |
·整体结构概述 | 第22-23页 |
·活性位点分析 | 第23-25页 |
·血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)的研究进展 | 第25-29页 |
·卡托普利(Captopril)——第1 代药物 | 第26-27页 |
·依那普利(Enalapril)第2 代药物 | 第27页 |
·苯那普利(Benazepril)——第3 代药物 | 第27-28页 |
·赖诺普利(Lysinopril)——新型的第3 代药物 | 第28-29页 |
第四章 血管紧张素抑制剂的分子设计 | 第29-48页 |
·本课题所要达到的目标 | 第29页 |
·分子设计的软件平台——LigBuilder | 第29-38页 |
·LigBuilder 简介 | 第29-31页 |
·LigBuilder 构建配体分子的几种策略 | 第31-33页 |
·构建分子的中心算法——遗传算法(Genetic Algorithm) | 第33-36页 |
·打分机制 | 第36-38页 |
·分子设计过程 | 第38-48页 |
·分析结合口袋(binding pocket) | 第38-42页 |
·产生新的分子 | 第42-46页 |
·处理新分子库 | 第46-48页 |
第五章 利用 AutoDock 分析得出最终结果 | 第48-58页 |
·AutoDock 简介 | 第48-54页 |
·评价函数 | 第48-49页 |
·模拟退火算法 | 第49-50页 |
·网格图(Grid Maps) | 第50-51页 |
·范德华电位能 | 第51-54页 |
·用 AutoDock 对接配体分子和受体蛋白 ACE | 第54-56页 |
·处理所对接的配体分子和受体ACE | 第54-56页 |
·运行Autodock 对接配体分子和受体靶蛋白 | 第56页 |
·分析对接结果并甄选出最后结果 | 第56-58页 |
第六章 工作总结与评价 | 第58-59页 |
致谢 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-63页 |
个人简历及在学期间的研究成果 | 第63页 |