| 致谢 | 第1-10页 |
| 摘要 | 第10-13页 |
| 第一章 根瘤菌群体遗传特性研究-综述 | 第13-35页 |
| 一、 以总DNA为对象的研究 | 第14-16页 |
| 1 、 基因组DNA限制性内切酶分析 | 第14页 |
| 2 、 随机引物扩增DNA片段的多态性(RAPD) | 第14-15页 |
| 3 、 扩增片段的长度多态性(AFLP) | 第15页 |
| 4 、 基因外重复回文因子和肠杆菌基因间重复一致序列 | 第15-16页 |
| 二、 以DNA片段为对象的研究 | 第16-22页 |
| 1 、 限制性内切酶酶切片段长度的多态性(RFLP) | 第16-17页 |
| 2 、 以PCR为基础的DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(PCR-RFLP)和DNA序列分析 | 第17-22页 |
| ① 16S rDNA的PCR-RFLP及序列分析 | 第18-20页 |
| ② 16S-23S rDNA的基因间隔区(IGS)的PCR-RFLP(ARDRA)及其序列分析 | 第20-22页 |
| ③ tRNA基因间长度的多态性 | 第22页 |
| 三、 以质粒为对象的研究 | 第22-27页 |
| 1 、 根瘤菌的质粒 | 第22-23页 |
| 2 、 根瘤菌的共生质粒及其功能 | 第23页 |
| 3 、 根瘤菌的非共生质粒及其功能 | 第23-24页 |
| 4 、 根瘤菌质粒与基因重排有关的遗传单位 | 第24-25页 |
| 5 、 根瘤菌质粒类型的多样性 | 第25-26页 |
| 6 、 根瘤菌质粒的可转移性 | 第26页 |
| 7 、 根瘤菌质粒的稳定性 | 第26-27页 |
| 四、 以结瘤基因为对象的研究 | 第27-35页 |
| 1 、 结瘤基因种类的多样性 | 第28-29页 |
| 2 、 结瘤基因组成的多样性 | 第29-30页 |
| 3 、 结瘤基因启动子保守区(nod box)多样性 | 第30-31页 |
| 4 、 结瘤基因与结瘤因子 | 第31-32页 |
| 5 、 结瘤因子的多样性 | 第32-33页 |
| 6 、 植物信号分子的多样性 | 第33-35页 |
| 第二章 材料与方法 | 第35-47页 |
| 一、 材料 | 第35-42页 |
| (一) 供试菌株 | 第35-36页 |
| (二) 培养基 | 第36-38页 |
| (三) 试剂 | 第38-41页 |
| (四) 抗生素 | 第41-42页 |
| (五) 酶 | 第42页 |
| 二、 方法 | 第42-47页 |
| (一) 质粒的快速检测 | 第42页 |
| (二) 总DNA的提取 | 第42-43页 |
| (三) 大肠杆菌质粒DNA的制备 | 第43页 |
| (四) 分子杂交 | 第43-44页 |
| (五) PCR扩增及其限制性内切酶长度多态性分析(PCR--RFLP) | 第44-46页 |
| (六) 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第46页 |
| (七) 质粒的接合转移 | 第46页 |
| (八) 计算机分析 | 第46-47页 |
| 第三章 供试菌株的分离 | 第47-52页 |
| 一、 采集地的分布 | 第47-48页 |
| 二、 土壤的理化特性 | 第48-50页 |
| 三、 供试菌株的分离方法 | 第50页 |
| 四、 供试菌株的选用与命名 | 第50页 |
| 五、 供试菌株的回接与再分离 | 第50-52页 |
| 第四章 16S rDNA PCR扩增及限制性内切酶长度多态性(RFLP)分析 | 第52-66页 |
| 一、 结果 | 第52-63页 |
| 1 、 供试菌株16S rDNA的PCR--RFLP分析 | 第52-54页 |
| 2 、 16S rDNA基因型及其分布特点 | 第54-59页 |
| 3 、 16S rDNA部分序列的测定及其与其它根瘤菌的关系 | 第59-63页 |
| 二、 讨论 | 第63-66页 |
| 1 、 供试菌株的16S rDNA分析及其分类地位 | 第63-65页 |
| 2 、 16S rDNA的RFLP分析与表型的关系 | 第65页 |
| 3 、 16S rDNA的RFLP分析与其序列分析方法的比较 | 第65-66页 |
| 第五章 16S-23S rDNA基因间隔区(IGS)的PCR扩增与RFLP分析 | 第66-75页 |
| 一、 结果 | 第66-72页 |
| 1 、 PCR扩增产物 | 第66-67页 |
| 2 、 酶切片段分析 | 第67-68页 |
| 3 、 IGS基因型及其分布 | 第68-69页 |
| 4 、 IGS基因型与16S rDNA的关系 | 第69-70页 |
| 5 、 应用IGS-RFLP进行菌株的种内分群 | 第70页 |
| 6 、 各大类的分布特点 | 第70-72页 |
| 二、 讨论 | 第72-75页 |
| 1 、 IGS长度 | 第72页 |
| 2 、 16S rDNA的拷贝数 | 第72-73页 |
| 3 、 IGS用于种以下群体分类的评价 | 第73页 |
| 4 、 IGS基因型的分布 | 第73-75页 |
| 第六章 质粒的多样性和7653R菌株质粒的Tn5标记 | 第75-86页 |
| 一、 华癸根瘤菌质粒多样性的研究 | 第75-81页 |
| 1 、 华癸根瘤菌的质粒类型 | 第75-78页 |
| 2 、 共生质粒的鉴定 | 第78-79页 |
| 3 、 质粒类型与染色体基因型的关系 | 第79-80页 |
| 4 、 讨论 | 第80-81页 |
| 二、 华癸根瘤菌7653R菌株质粒的luxAB-Tn5标记 | 第81-86页 |
| 1 、 含luxAB-Tn5质粒的接合转移 | 第81-82页 |
| 2 、 luxAB-Tn5可能插在质粒上菌株的筛选 | 第82页 |
| 3 、 Tn5插在质粒上菌株的确认 | 第82-83页 |
| 4 、 突变株的共生能力 | 第83-84页 |
| 5 、 讨论 | 第84-86页 |
| 第七章 以华癸根瘤菌(Mesorhizobium.huakuii)共生基因片段的RFLP分析 | 第86-103页 |
| 一、 以含华癸根瘤菌的共同结瘤基因nodDBC及部分nodI基因的4.2kb片段为探针的RFLP分析 | 第86-94页 |
| 1 、 总DNA用EcoR I酶切片段的RFLP分析 | 第86-89页 |
| ·、 杂交类型 | 第86-87页 |
| ·、 杂交类型在供试菌林中的分布 | 第87-88页 |
| ·、 与16S-23S rDNA IGS基因型的关系 | 第88-89页 |
| 2 、 总DNA用P(?)酶切片段的RFLP分析 | 第89-94页 |
| ·、 杂交类型 | 第89-90页 |
| ·、 与EcoR I酶切杂交类型的关系 | 第90-91页 |
| ·、 与16S rDNA-RFLP和IGS-RFLP反映的染色体遗传信息的关系 | 第91页 |
| ·、 PstI酶切杂交类型之间的遗传分析 | 第91-94页 |
| 二、 以含nodB与部分nodD.C基因的2.0Kb基因片段PCR--RFLP分析 | 第94-96页 |
| 1 、 引物的设计 | 第94页 |
| 2 、 PCR扩增及RFLP分析 | 第94-96页 |
| 三、 以0.6Kb含部分nodD2、nodA基因片段为探针的RFLP分析 | 第96-98页 |
| 四、 讨论 | 第98-103页 |
| 1 、 EcoRI、PstI酶切的RFLP共同结瘤基因的PCR-RFLP结果的比较分析 | 第98-100页 |
| 2 、 染色体基因与质粒基因的关系 | 第100-101页 |
| 3 、 共生基因与根瘤菌的进化 | 第101-103页 |
| 结论 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-120页 |
| 英文摘要 | 第120-121页 |
