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PCR引物特异性评估体系及多重PCR引物设计系统的构建与应用

目录第1-7页
英文缩略词表第7-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-12页
前言第12-15页
 1.PCR技术简介第12-13页
 2.PCR中非特异性扩增现象第13页
 3.本研究总体技术路线与论文结构第13-15页
第一章 引物特异性核查系统(PSC)的构建第15-26页
   ·引物特异性核查软件研究现状第15页
   ·PSC所需数据库的建立第15-16页
   ·PSC步骤原理与过程第16-17页
   ·PSC参数的选择第17-20页
     ·NCBI-Blast中参数的选择第17-19页
     ·引物对匹配指数(PPMI)第19-20页
   ·结果与讨论第20-25页
     ·单对引物的常规PCR实验中PSC的应用第20-24页
     ·多重PCR实验中PSC应用第24-25页
   ·结论第25-26页
第二章 基于多因素引物特异性评估系统(MFEprimer)构建第26-34页
   ·主要参数的添加与修订第26-29页
     ·解链温度Tm计算第26-27页
     ·自由能△G计算第27-29页
     ·引物对覆盖参数PPC的计算第29页
   ·高级选项设定第29-30页
     ·一价离子浓度设定第29页
     ·二价离子浓度设定第29页
     ·脱氧核糖核酸浓度(dNTP)设定第29页
     ·寡核苷酸浓度设定第29-30页
   ·PCR实验成败的三个主要因素第30页
   ·MFEprimer的web界面第30-32页
   ·MFEprimer应用举例第32-33页
   ·结论第33-34页
第三章 基于MFEprimer和Primer3的多重PCR引物设计系统(MPprimer)的构建第34-49页
   ·多重PCR引物设计研究现状第34-35页
   ·MPprimer的原理与实现过程第35页
   ·引物对特异组合PPSC算法的原理与实现过程第35-37页
   ·参数的选择与设定第37-38页
     ·引物长度第37页
     ·解链温度(Tm)值第37页
     ·GC含量第37页
     ·Max 3'stability第37页
     ·Max self complementarity第37-38页
     ·Max 3'self complementarity第38页
     ·引物对特异组合总罚分(TPC)第38页
     ·最小条带间距(MinBS)第38页
   ·引物二聚体核查模块PriDimerCheck第38-40页
     ·PriDimerCheck的web界面第39-40页
   ·虚拟PCR电泳模拟第40-45页
   ·MPprimer性能的实验验证第45-48页
   ·结果与讨论第48页
   ·结论第48-49页
总结第49-50页
参考文献第50-52页
附录第52-66页
 附录1第52-55页
 附录2第55-56页
 附录3第56-57页
 附录4第57-62页
 附录5第62-65页
 附录6第65-66页
综述与论文第66-75页
个人简历第75-77页
致谢第77页

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