目录 | 第1-7页 |
英文缩略词表 | 第7-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
前言 | 第12-15页 |
1.PCR技术简介 | 第12-13页 |
2.PCR中非特异性扩增现象 | 第13页 |
3.本研究总体技术路线与论文结构 | 第13-15页 |
第一章 引物特异性核查系统(PSC)的构建 | 第15-26页 |
·引物特异性核查软件研究现状 | 第15页 |
·PSC所需数据库的建立 | 第15-16页 |
·PSC步骤原理与过程 | 第16-17页 |
·PSC参数的选择 | 第17-20页 |
·NCBI-Blast中参数的选择 | 第17-19页 |
·引物对匹配指数(PPMI) | 第19-20页 |
·结果与讨论 | 第20-25页 |
·单对引物的常规PCR实验中PSC的应用 | 第20-24页 |
·多重PCR实验中PSC应用 | 第24-25页 |
·结论 | 第25-26页 |
第二章 基于多因素引物特异性评估系统(MFEprimer)构建 | 第26-34页 |
·主要参数的添加与修订 | 第26-29页 |
·解链温度Tm计算 | 第26-27页 |
·自由能△G计算 | 第27-29页 |
·引物对覆盖参数PPC的计算 | 第29页 |
·高级选项设定 | 第29-30页 |
·一价离子浓度设定 | 第29页 |
·二价离子浓度设定 | 第29页 |
·脱氧核糖核酸浓度(dNTP)设定 | 第29页 |
·寡核苷酸浓度设定 | 第29-30页 |
·PCR实验成败的三个主要因素 | 第30页 |
·MFEprimer的web界面 | 第30-32页 |
·MFEprimer应用举例 | 第32-33页 |
·结论 | 第33-34页 |
第三章 基于MFEprimer和Primer3的多重PCR引物设计系统(MPprimer)的构建 | 第34-49页 |
·多重PCR引物设计研究现状 | 第34-35页 |
·MPprimer的原理与实现过程 | 第35页 |
·引物对特异组合PPSC算法的原理与实现过程 | 第35-37页 |
·参数的选择与设定 | 第37-38页 |
·引物长度 | 第37页 |
·解链温度(Tm)值 | 第37页 |
·GC含量 | 第37页 |
·Max 3'stability | 第37页 |
·Max self complementarity | 第37-38页 |
·Max 3'self complementarity | 第38页 |
·引物对特异组合总罚分(TPC) | 第38页 |
·最小条带间距(MinBS) | 第38页 |
·引物二聚体核查模块PriDimerCheck | 第38-40页 |
·PriDimerCheck的web界面 | 第39-40页 |
·虚拟PCR电泳模拟 | 第40-45页 |
·MPprimer性能的实验验证 | 第45-48页 |
·结果与讨论 | 第48页 |
·结论 | 第48-49页 |
总结 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-52页 |
附录 | 第52-66页 |
附录1 | 第52-55页 |
附录2 | 第55-56页 |
附录3 | 第56-57页 |
附录4 | 第57-62页 |
附录5 | 第62-65页 |
附录6 | 第65-66页 |
综述与论文 | 第66-75页 |
个人简历 | 第75-77页 |
致谢 | 第77页 |