基于机器学习的细菌sRNA基因预测研究
英文缩略语词表 | 第1-7页 |
中文摘要 | 第7-10页 |
ABSTRACT | 第10-14页 |
前言 | 第14-16页 |
第一部分 大肠杆菌SRNA 基因预测研究 | 第16-25页 |
1 材料与方法 | 第16-22页 |
·基因组和sRNA 序列数据 | 第16-18页 |
·特征的提取 | 第18-19页 |
·基于t-检验的特征集选择 | 第19-21页 |
·分类器的构建 | 第21-22页 |
2 结果 | 第22-24页 |
·分类器构建与性能评价 | 第22-23页 |
·与其它细菌sRNA 预测模型比较 | 第23-24页 |
3 在基因组中预测新SRNA | 第24-25页 |
第二部分 金黄色葡萄球菌SRNA 基因预测研究 | 第25-36页 |
1 材料与方法 | 第25-31页 |
·基因组和sRNA 序列数据 | 第25-26页 |
·特征的提取 | 第26-27页 |
·分类器的构建 | 第27-28页 |
·金葡菌总RNA 提取 | 第28页 |
·免疫共沉淀 | 第28-29页 |
·RT-PCR 和qPCR | 第29页 |
·Northern blot 杂交 | 第29-30页 |
·RACE | 第30-31页 |
·凝胶阻滞实验 | 第31页 |
2 结果 | 第31-36页 |
·分类器的构建与评价 | 第31页 |
·在基因组中预测新sRNA | 第31-32页 |
·实验结果 | 第32-36页 |
讨论 | 第36-38页 |
结论 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-42页 |
附录 | 第42-73页 |
论文发表情况 | 第73-74页 |
个人简历 | 第74-75页 |
致谢 | 第75页 |