| 第一部分 一个调控拟南芥花药发育基因的精细定位 | 第1-50页 |
| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 一. 前 言 | 第12-25页 |
| 1. 花药及花粉的形态发育 | 第12-16页 |
| 2. 减数分裂 | 第16-17页 |
| ·小孢子母细胞的减数分裂 | 第16页 |
| ·减数分裂相关基因 | 第16-17页 |
| 3. 绒毡层 | 第17-19页 |
| ·绒毡层的形态发育和功能 | 第17页 |
| ·拟南芥绒毡层发育相关基因 | 第17-19页 |
| 4. 胼胝质 | 第19-20页 |
| ·胼胝质的合成与降解 | 第19页 |
| ·胼胝质发育的相关基因 | 第19-20页 |
| 5. 花粉壁 | 第20-22页 |
| ·拟南芥花粉壁的形成和分化 | 第20-21页 |
| ·与花粉壁合成相关的基因 | 第21-22页 |
| 6. 花药的开裂 | 第22页 |
| 7. 图位克隆 | 第22-24页 |
| ·分子标记 | 第22-23页 |
| ·拟南芥中目的基因的定位 | 第23-24页 |
| 8. 本研究的意义 | 第24-25页 |
| 二.材料与方法 | 第25-39页 |
| 1. 实验材料 | 第25-27页 |
| ·植物材料 | 第25页 |
| ·质粒和菌株 | 第25页 |
| ·工具酶和试剂 | 第25-26页 |
| ·主要仪器 | 第26-27页 |
| 2. 实验方法 | 第27-39页 |
| ·植物培养 | 第27页 |
| ·定位群体的建立 | 第27-28页 |
| ·植物组织DNA 的提取 | 第28页 |
| ·研磨法 | 第28页 |
| ·高通量PCR 模板DNA 提取法 | 第28页 |
| ·基因定位中PCR 反应 | 第28-29页 |
| ·PCR 混合液 | 第28-29页 |
| ·PCR 反应程序 | 第29页 |
| ·PCR 产物的检测 | 第29页 |
| ·分子标记的引物设计 | 第29页 |
| ·载体的构建和转化 | 第29-33页 |
| ·酶切鉴定体系 | 第29-30页 |
| ·连接体系的建立 | 第30页 |
| ·热击感受态E.coli 的制备 | 第30-31页 |
| ·大肠杆菌DH5α的转化 | 第31页 |
| ·农杆菌感受态细胞的制备 | 第31-32页 |
| ·农杆菌的转化 | 第32页 |
| ·克隆载体的鉴定 | 第32页 |
| ·质粒DNA 的少量制备(碱裂解法) | 第32-33页 |
| ·植物组织RNA 提取及反转录 | 第33-34页 |
| ·RNA 提取 | 第33页 |
| ·RNA 反转录 | 第33-34页 |
| ·切片 | 第34-38页 |
| ·石蜡切片 | 第34-36页 |
| ·树脂切片 | 第36-37页 |
| ·透射电镜样品制作方法 | 第37-38页 |
| ·拟南芥的转化与筛选 | 第38页 |
| ·亚历山大染色 | 第38-39页 |
| 三. 结果与讨论 | 第39-50页 |
| 1. 1502 突变体的表型及遗传学分析 | 第39-42页 |
| ·1502 突变体植株表型 | 第39-40页 |
| ·树脂切片观察 | 第40-41页 |
| ·透射电镜观察 | 第41-42页 |
| 2. 突变体1502 基因的精细定位 | 第42-45页 |
| 3. 定位区间内候选基因的筛选 | 第45-46页 |
| 4. 候选基因的互补载体构建及转化 | 第46-48页 |
| 5. 部分花药发育相关基因在1502 突变体中的表达情况 | 第48页 |
| 6. 讨论 | 第48-50页 |
| 第二部分 拟南芥 PHD-finger 蛋白家族的全基因组分析 | 第50-88页 |
| 摘要 | 第50-51页 |
| Abstract | 第51-53页 |
| 一. 前言 | 第53-64页 |
| 1. 生物信息学 | 第53-55页 |
| ·生物信息学的定义 | 第53页 |
| ·方法和技术 | 第53-55页 |
| ·概率统计方法 | 第53页 |
| ·数据库技术和数据挖掘 | 第53页 |
| ·模式识别技术 | 第53-54页 |
| ·动态规划方法 | 第54页 |
| ·分子模型化技术 | 第54页 |
| ·人工神经网络 | 第54页 |
| ·Internet 技术 | 第54-55页 |
| 2. 分子生物学基础 | 第55页 |
| 3. 分子系统发生分析 | 第55-56页 |
| 4. 系统进化树 | 第56-60页 |
| ·构建系统进化树的依据 | 第56页 |
| ·序列进化树 | 第56-59页 |
| ·序列比对 | 第57页 |
| ·决定取代模型 | 第57页 |
| ·建树方法 | 第57-58页 |
| ·最优进化树的搜索 | 第58-59页 |
| ·确定树根 | 第59页 |
| ·评估进化树和数据 | 第59页 |
| ·结构进化树 | 第59-60页 |
| 5. 基因家族 | 第60-63页 |
| ·锌指蛋白家族 | 第60-61页 |
| ·PHD-finger 蛋白家族 | 第61-63页 |
| 6. 本文的意义 | 第63-64页 |
| 二. 材料与方法 | 第64-68页 |
| 1. 材料 | 第64-66页 |
| ·植物材料 | 第64页 |
| ·生化试剂 | 第64页 |
| ·实验中所用引物 | 第64页 |
| ·生物软件和网络资源 | 第64-66页 |
| 2. 实验操作 | 第66-68页 |
| ·拟南芥中PHD-finger 蛋白序列数据获得 | 第66页 |
| ·结构域序列分析及进化树构建 | 第66页 |
| ·基因在染色体上的位置及倍增关系分析 | 第66-67页 |
| ·基因结构分析 | 第67页 |
| ·基因的表达分析 | 第67页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第67-68页 |
| 三. 结果与讨论 | 第68-88页 |
| 1. 拟南芥中PHD-finger 蛋白的确定 | 第68-70页 |
| 2. 拟南芥PHD-finger 蛋白系统进化分析 | 第70-74页 |
| 3. 拟南芥中PHD-finger 结构域序列分析 | 第74-77页 |
| 4. PHD-finger 家族基因的定位和倍增分析 | 第77-79页 |
| 5. 基因结构和蛋白结构域分析 | 第79-80页 |
| 6. PHD-finger 家族基因表达分析 | 第80-81页 |
| 7. PHD-finger 结构域建模 | 第81-85页 |
| 8. 讨论 | 第85-88页 |
| 参考文献 | 第88-97页 |
| 硕士在读期间文章发表情况 | 第97-98页 |
| 致谢 | 第98页 |
