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正常核型急性髓系白血病预后标志物的生物信息学研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 绪论第13-32页
    1.1 AML概述第13-14页
    1.2 AML常规治疗及精准基因组学研究第14-16页
        1.2.1 AML常规治疗方案第14-15页
        1.2.2 TCGA在 AML精准基因组学的意义第15-16页
    1.3 AML预后研究进展第16-21页
        1.3.1 CN-AML单基因预后标志物概述第16-20页
        1.3.2 AML多基因预后模型概述第20-21页
    1.4 高通量测序技术及其应用第21-28页
        1.4.1 RNA-seq测序第22-25页
        1.4.2 小RNA测序第25-27页
        1.4.3 测序技术最新研究进展第27-28页
    1.5 转录因子-miRNA共调控网络第28-31页
        1.5.1 转录因子概述第28-29页
        1.5.2 转录因子-miRNA共调控网络研究概况第29页
        1.5.3 转录因子-miRNA共调控网络分类第29-31页
    1.6 本课题主要研究内容及意义第31-32页
2 CN-AML的预后基因STAB1 的挖掘及其机制研究第32-67页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料与方法第32-40页
        2.2.1 细胞第32页
        2.2.2 主要试剂第32-34页
        2.2.3 主要仪器第34页
        2.2.4 主要试剂配制第34-35页
        2.2.5 研究对象第35-40页
    2.3 实验方法第40-44页
        2.3.1 细胞培养第40页
        2.3.2 实时荧光定量PCR第40-42页
        2.3.3 CCK-8细胞活力检测第42页
        2.3.4 Annexin V/PI凋亡检测第42页
        2.3.5 Western Blot第42-43页
        2.3.6 siRNA转染第43-44页
        2.3.7 实验数据的统计分析第44页
    2.4 生物信息学研究方法第44-46页
        2.4.1 整体研究策略第44-45页
        2.4.2 差异表达分析第45页
        2.4.3 CN-AML调控网络构建第45页
        2.4.4 相关性分析第45页
        2.4.5 生存分析第45-46页
    2.5 结果第46-65页
        2.5.1 STAB1是CN-AML潜在预后因子第46-55页
        2.5.2 STAB1 高低表达组的CN-AML患者临床特征分析第55-57页
        2.5.3 基于STAB1 高低表达分层的CN-AML患者潜在机制研究第57-59页
        2.5.4 基于STAB1 表达分层的CN-AML患者潜在药物指示第59-61页
        2.5.5 抑制STAB1的表达可能抑制白血病生长并诱导细胞凋亡第61-64页
        2.5.6 KG1a和 NB4 细胞系的STAB1 低表达对Venetoclax更敏感第64-65页
    2.6 讨论第65-67页
3 基于膜蛋白的CN-AML预后模型MPG6 的建立第67-88页
    3.1 引言第67-68页
    3.2 方法第68-72页
        3.2.1 AML患者临床信息和研究数据描述第68-70页
        3.2.2 生存分析和膜蛋白基因鉴定第70页
        3.2.3 CN-AML预后特征基因训练第70页
        3.2.4 CN-AML预后特征基因测试第70-71页
        3.2.5 MPG6模型的性能评估和预后表现分析第71页
        3.2.6 MPG6的性能基准测试第71-72页
    3.3 结果第72-86页
        3.3.1 MPG6 模型在CN-AML中作为独立预后的鉴定第72-78页
        3.3.2 高MPG6打分与多个独立数据集中的不良生存相关第78-82页
        3.3.3 MPG6 打分与CN-AML患者临床特征显著相关第82-83页
        3.3.4 MPG6打分可以提高预测患者生存时间的性能第83-85页
        3.3.5 MPG6打分可以作为良好的独立预后因素第85-86页
    3.4 讨论第86-88页
4 不同核型AML的基因差异表达和调控网络分析第88-112页
    4.1 引言第88-89页
    4.2 方法第89-97页
        4.2.1 AML患者临床信息和研究数据描述第89-92页
        4.2.2 AML不同预后核型的差异基因和差异miRNA分析第92-94页
        4.2.3 AML不同预后核型的特异TF-miRNA共调控网络构建第94-96页
        4.2.4 统计学相关分析第96-97页
    4.3 结果第97-110页
        4.3.1 不同预后核型AML差异表达基因和miRNA概览第97-102页
        4.3.2 AML不同预后核型的HOX基因概况及其共调控网络第102-108页
        4.3.3 良好核型vs.CN-AML组的膜基因和预后基因概览第108-110页
    4.4 讨论第110-112页
5 全文总结及展望第112-115页
致谢第115-116页
参考文献第116-133页
附录 攻读博士期间发表的论文目录第133页

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