摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
1 绪论 | 第13-32页 |
1.1 AML概述 | 第13-14页 |
1.2 AML常规治疗及精准基因组学研究 | 第14-16页 |
1.2.1 AML常规治疗方案 | 第14-15页 |
1.2.2 TCGA在 AML精准基因组学的意义 | 第15-16页 |
1.3 AML预后研究进展 | 第16-21页 |
1.3.1 CN-AML单基因预后标志物概述 | 第16-20页 |
1.3.2 AML多基因预后模型概述 | 第20-21页 |
1.4 高通量测序技术及其应用 | 第21-28页 |
1.4.1 RNA-seq测序 | 第22-25页 |
1.4.2 小RNA测序 | 第25-27页 |
1.4.3 测序技术最新研究进展 | 第27-28页 |
1.5 转录因子-miRNA共调控网络 | 第28-31页 |
1.5.1 转录因子概述 | 第28-29页 |
1.5.2 转录因子-miRNA共调控网络研究概况 | 第29页 |
1.5.3 转录因子-miRNA共调控网络分类 | 第29-31页 |
1.6 本课题主要研究内容及意义 | 第31-32页 |
2 CN-AML的预后基因STAB1 的挖掘及其机制研究 | 第32-67页 |
2.1 引言 | 第32页 |
2.2 材料与方法 | 第32-40页 |
2.2.1 细胞 | 第32页 |
2.2.2 主要试剂 | 第32-34页 |
2.2.3 主要仪器 | 第34页 |
2.2.4 主要试剂配制 | 第34-35页 |
2.2.5 研究对象 | 第35-40页 |
2.3 实验方法 | 第40-44页 |
2.3.1 细胞培养 | 第40页 |
2.3.2 实时荧光定量PCR | 第40-42页 |
2.3.3 CCK-8细胞活力检测 | 第42页 |
2.3.4 Annexin V/PI凋亡检测 | 第42页 |
2.3.5 Western Blot | 第42-43页 |
2.3.6 siRNA转染 | 第43-44页 |
2.3.7 实验数据的统计分析 | 第44页 |
2.4 生物信息学研究方法 | 第44-46页 |
2.4.1 整体研究策略 | 第44-45页 |
2.4.2 差异表达分析 | 第45页 |
2.4.3 CN-AML调控网络构建 | 第45页 |
2.4.4 相关性分析 | 第45页 |
2.4.5 生存分析 | 第45-46页 |
2.5 结果 | 第46-65页 |
2.5.1 STAB1是CN-AML潜在预后因子 | 第46-55页 |
2.5.2 STAB1 高低表达组的CN-AML患者临床特征分析 | 第55-57页 |
2.5.3 基于STAB1 高低表达分层的CN-AML患者潜在机制研究 | 第57-59页 |
2.5.4 基于STAB1 表达分层的CN-AML患者潜在药物指示 | 第59-61页 |
2.5.5 抑制STAB1的表达可能抑制白血病生长并诱导细胞凋亡 | 第61-64页 |
2.5.6 KG1a和 NB4 细胞系的STAB1 低表达对Venetoclax更敏感 | 第64-65页 |
2.6 讨论 | 第65-67页 |
3 基于膜蛋白的CN-AML预后模型MPG6 的建立 | 第67-88页 |
3.1 引言 | 第67-68页 |
3.2 方法 | 第68-72页 |
3.2.1 AML患者临床信息和研究数据描述 | 第68-70页 |
3.2.2 生存分析和膜蛋白基因鉴定 | 第70页 |
3.2.3 CN-AML预后特征基因训练 | 第70页 |
3.2.4 CN-AML预后特征基因测试 | 第70-71页 |
3.2.5 MPG6模型的性能评估和预后表现分析 | 第71页 |
3.2.6 MPG6的性能基准测试 | 第71-72页 |
3.3 结果 | 第72-86页 |
3.3.1 MPG6 模型在CN-AML中作为独立预后的鉴定 | 第72-78页 |
3.3.2 高MPG6打分与多个独立数据集中的不良生存相关 | 第78-82页 |
3.3.3 MPG6 打分与CN-AML患者临床特征显著相关 | 第82-83页 |
3.3.4 MPG6打分可以提高预测患者生存时间的性能 | 第83-85页 |
3.3.5 MPG6打分可以作为良好的独立预后因素 | 第85-86页 |
3.4 讨论 | 第86-88页 |
4 不同核型AML的基因差异表达和调控网络分析 | 第88-112页 |
4.1 引言 | 第88-89页 |
4.2 方法 | 第89-97页 |
4.2.1 AML患者临床信息和研究数据描述 | 第89-92页 |
4.2.2 AML不同预后核型的差异基因和差异miRNA分析 | 第92-94页 |
4.2.3 AML不同预后核型的特异TF-miRNA共调控网络构建 | 第94-96页 |
4.2.4 统计学相关分析 | 第96-97页 |
4.3 结果 | 第97-110页 |
4.3.1 不同预后核型AML差异表达基因和miRNA概览 | 第97-102页 |
4.3.2 AML不同预后核型的HOX基因概况及其共调控网络 | 第102-108页 |
4.3.3 良好核型vs.CN-AML组的膜基因和预后基因概览 | 第108-110页 |
4.4 讨论 | 第110-112页 |
5 全文总结及展望 | 第112-115页 |
致谢 | 第115-116页 |
参考文献 | 第116-133页 |
附录 攻读博士期间发表的论文目录 | 第133页 |