| 中文摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-19页 |
| ·冷泉及其形成原因 | 第10页 |
| ·什么是冷泉 | 第10页 |
| ·冷泉形成的原因 | 第10页 |
| ·地下水微生物多样性的研究意义 | 第10-12页 |
| ·冷泉沉积物中微生物多样性研究意义及现状 | 第11-12页 |
| ·地下水微生物研究概况 | 第12-17页 |
| ·地下水微生物研究发展简史 | 第12页 |
| ·培养法对被污染地下水微生物的研究 | 第12-14页 |
| ·免培养法对地下水微生物群落及功能多样性研究 | 第14-17页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第17-19页 |
| 第二章 新疆沙湾冷泉沉积物中细菌的系统发育多样性 | 第19-33页 |
| ·材料与方法 | 第19-23页 |
| ·样品采集及理化性质分析 | 第19-20页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第20页 |
| ·环境总DNA 提取及纯化 | 第20页 |
| ·细菌16S rRNA 基因扩增及克隆文库构建 | 第20-21页 |
| ·阳性克隆筛选 | 第21-22页 |
| ·限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism , RFLP)分型 | 第22页 |
| ·稀有度及覆盖率分析 | 第22页 |
| ·嵌合子检测及系统发育分析 | 第22页 |
| ·核酸序列收录号 | 第22-23页 |
| ·结果与分析 | 第23-31页 |
| ·沙湾冷泉水理化性质 | 第23页 |
| ·冷泉沉积物总DNA 的提取 | 第23-24页 |
| ·冷泉沉积物细菌16S rRNA 基因的扩增 | 第24页 |
| ·阳性转化子的筛选 | 第24-25页 |
| ·RFLP 酶切分析 | 第25页 |
| ·稀有度分析结果 | 第25-26页 |
| ·细菌16S rRNA 基因克隆文库组成及系统发育分析 | 第26-31页 |
| ·讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 新疆沙湾冷泉沉积物中古菌系统发育多样性 | 第33-40页 |
| ·材料与方法 | 第33-35页 |
| ·样品采集及理化性质分析 | 第33页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第33页 |
| ·环境总DNA 提取及纯化 | 第33页 |
| ·古菌16S rRNA 基因扩增及克隆文库构建 | 第33-34页 |
| ·阳性克隆筛选 | 第34页 |
| ·RFLP 分型 | 第34页 |
| ·稀有度及覆盖率分析 | 第34页 |
| ·系统发育分析 | 第34-35页 |
| ·核酸序列收录号 | 第35页 |
| ·结果与分析 | 第35-38页 |
| ·冷泉沉积物古菌16S rRNA 基因的扩增 | 第35页 |
| ·阳性转化子的筛选 | 第35-36页 |
| ·RFLP 酶切分型 | 第36页 |
| ·稀有度分析结果 | 第36-37页 |
| ·古菌16S rRNA 基因克隆文库组成及系统发育分析 | 第37-38页 |
| ·讨论 | 第38-40页 |
| 第四章 新疆沙湾冷泉沉积物中免培养与可培养放线菌多样性 | 第40-53页 |
| ·材料与方法 | 第40-43页 |
| ·样品采集及理化性质分析 | 第40页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第40页 |
| ·环境总DNA 提取及纯化 | 第40-41页 |
| ·免培养放线菌多样性 | 第41-42页 |
| ·可培养放线菌多样性 | 第42-43页 |
| ·系统发育和聚类分析 | 第43页 |
| ·序列提交及Genbank 收录号 | 第43页 |
| ·结果与分析 | 第43-50页 |
| ·免培养放线菌16S rRNA 基因的扩增 | 第43-44页 |
| ·阳性转化子的筛选 | 第44页 |
| ·RFLP 酶切分型 | 第44-45页 |
| ·稀有度分析 | 第45页 |
| ·冷泉沉积物中免培养放线菌的组成及多样性 | 第45-48页 |
| ·沉积物中可培养放线菌的组成及其多样性 | 第48-50页 |
| ·讨论 | 第50-53页 |
| 结论与展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| 附录1 感受态细胞的制备及转化 | 第64-66页 |
| 附录2 分离培养基及主要试剂和仪器 | 第66-68页 |
| 附录3 实验照片 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简介 | 第70页 |
