| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-35页 |
| 1 基于DNA的主要物种鉴定技术概述 | 第11-15页 |
| ·DNA杂交 | 第12页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLPs)分析 | 第12-13页 |
| ·扩增片段长度多态性分析(AFLPs) | 第13页 |
| ·随机扩增多态性DNA(RAPD) | 第13-14页 |
| ·常规PCR | 第14页 |
| ·实时定量PCR | 第14页 |
| ·PCR产物测序 | 第14-15页 |
| ·DNA微阵列(DNA芯片) | 第15页 |
| 2 DNA条形码编码 | 第15-25页 |
| ·DNA条形编码的概念与原理 | 第15-16页 |
| ·DNA条形编码产生的背景和意义 | 第16-17页 |
| ·DNA条形编码研究现状 | 第17-23页 |
| ·CBOL的主要计划 | 第18-19页 |
| ·DNA条形编码在真菌和细菌鉴定中的应用 | 第19-20页 |
| ·DNA条形编码在动物鉴定中的应用 | 第20-22页 |
| ·DNA条形编码在植物鉴定中的应用 | 第22-23页 |
| ·DNA条形编码的分析方法 | 第23-25页 |
| ·相似性方法(Similarity approaches) | 第23-24页 |
| ·系统发育的方法(Phylogenetic approaches) | 第24页 |
| ·基于性状的方法(Character-based approaches) | 第24-25页 |
| ·谱系方法(Genealogical methods) | 第25页 |
| 3 谱系芯片 | 第25-30页 |
| ·基因芯片概念及分类 | 第25-26页 |
| ·基因芯片技术在物种鉴定中的研究现状 | 第26-30页 |
| ·基因芯片技术在微生物检测中的应用 | 第26-28页 |
| ·基因芯片技术在动物物种鉴定中的应用 | 第28-30页 |
| 4 研究类群概述 | 第30-34页 |
| ·直翅目昆虫的起源 | 第30-31页 |
| ·直翅目高级阶元分类系统 | 第31-34页 |
| ·蝗亚目的分类研究 | 第31-33页 |
| ·螽亚目的分类研究 | 第33-34页 |
| 5 研究的目的及意义 | 第34-35页 |
| 第2章 材料与方法 | 第35-43页 |
| 1 实验材料 | 第35-36页 |
| ·标本的采集、保存与鉴定 | 第35页 |
| ·实验试剂及仪器 | 第35-36页 |
| ·实验试剂 | 第35页 |
| ·实验仪器 | 第35-36页 |
| ·生物学软件 | 第36页 |
| 2 实验流程及方法 | 第36-39页 |
| ·基因组DNA提取方法 | 第37-39页 |
| ·组织消化液的配制 | 第37-38页 |
| ·基因组DNA提取方案及操作步骤 | 第38-39页 |
| ·CO Ⅰ条形码片段的PCR扩增、纯化和测序 | 第39页 |
| ·CO Ⅰ条形码片段的PCR扩增 | 第39页 |
| ·PCR产物的分离纯化和测序 | 第39页 |
| 3 数据处理方法 | 第39-43页 |
| ·数据准备 | 第39-40页 |
| ·CO Ⅰ条形码分析 | 第40页 |
| ·探针的筛选与虚拟杂交 | 第40-43页 |
| ·物种特异性探针的筛选 | 第40-42页 |
| ·探针与条形码序列的虚拟杂交 | 第42-43页 |
| 第3章 DNA条形编码的结果与分析 | 第43-71页 |
| 1 基因组DNA的提取与CO Ⅰ条形码序列的扩增测序 | 第43-44页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第43页 |
| ·CO Ⅰ条形码序列的PCR扩增测序 | 第43-44页 |
| 2 DNA序列组成及变异分析 | 第44-45页 |
| 3 氨基酸序列位点变异分析 | 第45-47页 |
| 4 蝗总科Acridoidea物种的条形码分析 | 第47-57页 |
| ·斑腿蝗科Catantopidae的条形码分析 | 第47-54页 |
| ·斑翅蝗科Oedipodidae的条形码分析 | 第54-57页 |
| 5 螽斯总科Tettigonioidea物种的条形码分析 | 第57-63页 |
| ·蛩螽科Meconematidae的条形码分析 | 第57-58页 |
| ·草螽科Conocephalidae的条形码分析 | 第58-60页 |
| ·螽斯科Tettigoniidae的条形码分析 | 第60-61页 |
| ·露螽科Phaneropteridae的条形码分析 | 第61-63页 |
| 6 种内和种间成对遗传距离的分布频率及每个阈值的累积误差 | 第63-65页 |
| 7 Blast相似性搜索的结果与分析 | 第65-67页 |
| ·Blast本地数据库的构建 | 第65-66页 |
| ·Blast相似性搜索结果 | 第66-67页 |
| 8 直翅目部分物种的CO Ⅰ条形编码的可行性评估 | 第67-71页 |
| 第4章 物种特异性探针筛选及虚拟杂交结果分析 | 第71-111页 |
| 1 物种特异性探针筛选结果 | 第71-79页 |
| 2 探针序列在条形码序列上的分布 | 第79-84页 |
| 3 条形码序列与探针的虚拟杂交 | 第84-109页 |
| ·露螽科物种的虚拟杂交结果与分析 | 第84-88页 |
| ·草螽科虚拟杂交结果与分析 | 第88-91页 |
| ·蛩螽科的虚拟杂交结果与分析 | 第91页 |
| ·螽斯科的虚拟杂交结果与分析 | 第91-96页 |
| ·纺织娘科、似织螽科、拟叶螽科、硕螽科和迟螽科的虚拟杂交结果与分析 | 第96页 |
| ·斑腿蝗科的虚拟杂交结果与分析 | 第96-102页 |
| ·斑翅蝗科的虚拟杂交结果与分析 | 第102-106页 |
| ·网翅蝗科的虚拟杂交结果与分析 | 第106-108页 |
| ·剑角蝗科、锥头蝗科、槌角蝗科和癞蝗科的虚拟杂交结果与分析 | 第108-109页 |
| 4 影响直翅目物种鉴定谱系芯片构建的因素分析 | 第109-111页 |
| 第5章 总结与结论 | 第111-114页 |
| 参考文献 | 第114-133页 |
| 附录Ⅰ:蝗总科实验材料及从NCBI中下载的序列 | 第133-148页 |
| 附录Ⅱ:螽斯总科实验材料及从NCBI中下载的序列 | 第148-158页 |
| 致谢 | 第158-159页 |
| 攻读博士学位期间科研成果 | 第159页 |
