| 摘要 | 第7-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第16-17页 |
| 第一部分 文献综述 | 第17-43页 |
| 第一章 棉属的起源与进化 | 第17-29页 |
| 1 棉属基因库及种质资源 | 第18-24页 |
| 1.1 二倍体棉种的遗传多样性 | 第19-20页 |
| 1.2 四倍体棉种的遗传多样性与驯化 | 第20-24页 |
| 2 植物基因组的进化 | 第24-29页 |
| 2.1 植物的多倍化与基因组进化 | 第24页 |
| 2.2 多倍体化之后基因的命运 | 第24-29页 |
| 第二章 全基因组重测序的研究进展及应用 | 第29-37页 |
| 1 二代测序技术的发展 | 第29-33页 |
| 1.1 Sanger测序法 | 第30页 |
| 1.2 深度DNA测序法 | 第30-33页 |
| 2 全基因组重测序技术的应用 | 第33-37页 |
| 2.1 WGR在分子标记开发中的应用 | 第33-34页 |
| 2.2 WGR在QTL精细定位中的应用 | 第34页 |
| 2.3 WGR在全基因组关联分析中的应用 | 第34-37页 |
| 第三章 ERF转录因子的研究进展 | 第37-43页 |
| 1 植物转录因子的研究进展 | 第37-38页 |
| 2 植物AP2/EREBP转录因子的研究进展 | 第38-42页 |
| 2.1 能够被ERF调控的顺式作用元件 | 第40页 |
| 2.2 AP2/EREBP基因在植物发育过程中的功能 | 第40-41页 |
| 2.3 AP2/EREBP基因在植物激素和信号转导中的作用 | 第41页 |
| 2.4 AP2/EREBP基因是植物抗性的良好候选基因 | 第41-42页 |
| 3 棉花AP2/EREBP基因的研究进展 | 第42-43页 |
| 本研究的目的和意义 | 第43-45页 |
| 第二部分 研究报告 | 第45-109页 |
| 第四章 四倍体栽培棉种的分化与双向驯化 | 第45-67页 |
| 1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 1.1 研究材料 | 第46页 |
| 1.2 研究方法 | 第46-48页 |
| 2 研究结果 | 第48-61页 |
| 2.1 遗传多样性和群体结构 | 第48-51页 |
| 2.2 四倍体栽培棉的独立驯化 | 第51-56页 |
| 2.3 海岛棉和陆地棉的不对称渐渗 | 第56-58页 |
| 2.4 陆地棉适应性性状的选择 | 第58-61页 |
| 3 讨论 | 第61-67页 |
| 3.1 海岛棉和陆地棉的独立驯化 | 第61-62页 |
| 3.2 海岛棉和陆地棉之间有广泛的基因交流 | 第62-64页 |
| 3.3 全基因组重测序为研究植物驯化提供了分子证据 | 第64-65页 |
| 3.4 全基因组重测序为棉花育种提供了丰富的基因资源 | 第65-67页 |
| 第五章 四倍体棉花ERF1基因对的功能分化及AP2/EREBP基因家族分析 | 第67-109页 |
| 1 材料与方法 | 第68-75页 |
| 1.1 研究材料 | 第68-69页 |
| 1.2 菌株和质粒 | 第69页 |
| 1.3 培养基 | 第69页 |
| 1.4 基因的克隆、电泳、回收、连接 | 第69页 |
| 1.5 大肠杆菌感受态的制备、连接产物的转化及阳性单克隆的检测 | 第69页 |
| 1.6 棉花不同组织RNA的提取 | 第69页 |
| 1.7 亚细胞定位 | 第69-70页 |
| 1.8 植物表达载体的构建 | 第70页 |
| 1.9 酵母双杂交实验 | 第70-71页 |
| 1.10 植物表达载体的农杆菌转化 | 第71页 |
| 1.11 农杆菌介导的拟南芥遗传转化 | 第71页 |
| 1.12 转基因植株的表达分析 | 第71-72页 |
| 1.13 棉花幼苗的逆境诱导处理方法 | 第72页 |
| 1.14 家族基因数据与分析方法 | 第72-75页 |
| 2 结果与分析 | 第75-104页 |
| 2.1 GhERF1-7D/7A基因的克隆、亚细胞定位及表达分析 | 第75-91页 |
| 2.2 GhERF1-7A的新功能化-提高果实的产量 | 第91-94页 |
| 2.3 GhERF1-7A基因的进化分析 | 第94-95页 |
| 2.4 棉花AP2/EREBP基因家族的扩张和逆境响应分析 | 第95-104页 |
| 3 讨论 | 第104-109页 |
| 3.1 多倍体化后,四倍体棉花部分同源基因的分化 | 第104-106页 |
| 3.2 部分同源基因的功能分化有利于揭示棉花的驯化 | 第106-109页 |
| 全文结论 | 第109-111页 |
| 创新点 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-125页 |
| 附录 | 第125-223页 |
| 攻读学位期间论文发表情况 | 第223-225页 |
| 致谢 | 第225页 |
