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Armored RNA技术在登革热病毒及白血病BCR-ABL1p210/p190融合基因检测中的应用研究

英文缩略词第11-13页
中文摘要第13-17页
Abstract第17-20页
第一部分 基于Armored RNA技术的登革热病毒核酸检测质控品的研制及室间质量评价第22-82页
    前言第22-24页
    1. 材料和方法第24-44页
        1.1. 实验材料和试剂配制第24-30页
            1.1.1. 实验仪器第24-25页
            1.1.2. 主要实验耗材第25页
            1.1.3. 主要实验试剂第25-27页
            1.1.4. 培养基和溶液的配制第27-29页
            1.1.5. 菌株和质粒第29-30页
        1.2. 方法第30-44页
            1.2.1. 合成DENV-1~4基因片段第30页
            1.2.2. 构建pACYC-MS2-DENV-1~4重组质粒第30-35页
            1.2.3. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第35-38页
            1.2.4. 重组病毒样颗粒的鉴定第38-42页
            1.2.5. 重组病毒样颗粒的性能验证第42-43页
            1.2.6. 制备DENV-1~4质评样本及开展全国室间质量评价第43页
            1.2.7. 统计学分析第43-44页
    2. 结果第44-76页
        2.1. pACYC-MS2-DENV-1~4重组质粒的验证第44-65页
            2.1.1. PCR验证第44页
            2.1.2. 测序验证第44-65页
        2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第65-66页
        2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第66-68页
            2.3.1. 琼脂糖凝胶电泳鉴定第66-67页
            2.3.2. SDS-PAGE鉴定第67-68页
            2.3.3. 电镜观察DENV-1~4 VLPs第68页
            2.3.4. 商品化试剂盒验证VLPs包装片段第68页
        2.4. DENV-1~4 VLPs性能验证第68-70页
            2.4.1. 稳定性试验第68-69页
            2.4.2. 基质效应试验第69页
            2.4.3. 反复冻融试验第69-70页
        2.5. DENV-1~4 VLPs检测的室间质量评价第70-76页
            2.5.1. 参评实验室项目参数统计及评分第70-72页
            2.5.2. DENV-1~4检测的准确度、敏感度和特异度分析第72-76页
            2.5.3. 不同试剂盒DENV-1~4检测结果分析第76页
            2.5.4. 质评小结和证书发放第76页
    3. 讨论第76-79页
    参考文献第79-82页
第二部分 基于Armored RNA技术的白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测质控品的研制及室间质量评价第82-149页
    前言第82-86页
    1. 材料和方法第86-113页
        1.1. 实验材料和试剂配制第86-92页
            1.1.1. 实验仪器第86-87页
            1.1.2. 主要实验耗材第87页
            1.1.3. 主要实验试剂第87-89页
            1.1.4. 培养基和溶液的配制第89-91页
            1.1.5. 菌株和质粒第91-92页
        1.2. 方法第92-113页
            1.2.1. pACYC-MS2质粒、p210 BCR-ABL1以及p190 BCR-ABL1阳性患者总mRNA第92页
            1.2.2. 构建pACYC-MS2-p210、pACYC-MS2-p190以及pACYC-MS2-CG重组质粒第92-102页
            1.2.3. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第102-105页
            1.2.4. 重组病毒样颗粒的鉴定第105-108页
            1.2.5. 重组病毒样颗粒的性能验证第108-110页
            1.2.6. 制备p210、p190质评样本及开展全国室间质量评价第110-113页
            1.2.7. 统计学分析第113页
    2. 结果第113-140页
        2.1. pACYC-MS2-p210、pACYC-MS2-p190、pACYC-MS2-CG重组质粒的验证第113-124页
            2.1.1. PCR验证第113页
            2.1.2. 测序验证第113-124页
        2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第124-125页
        2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第125-126页
            2.3.1. 琼脂糖凝胶电泳鉴定第125页
            2.3.2. SDS-PAGE鉴定第125-126页
            2.3.3. RT-qPCR验证VLPs包装片段第126页
        2.4. p210、p190和CG VLPs性能验证第126-128页
            2.4.1. 稳定性实验第126-127页
            2.4.2. 均一性实验第127页
            2.4.3. 反复冻融实验第127-128页
        2.5. BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测的室间质量评价第128-140页
            2.5.1. 结果回报情况第128页
            2.5.2. 参评实验室项目参数统计第128-129页
            2.5.3. p210和p190 BCR-ABL1检测结果第129-132页
            2.5.4. 质评样本及盲邮样本BCR-ABL1检测结果分布第132页
            2.5.5. 重复样本和阴性样本检测结果分析第132-133页
            2.5.6. 不同项目检测方法BCR-ABL1定量检测结果分析第133-135页
            2.5.7. IS实验室p210 BCR-ABL1检测结果分析第135-137页
            2.5.8. CF随访结果分析第137-138页
            2.5.9. 参评实验室EQA评分第138-140页
            2.5.10. 质评小结和证书发放第140页
    3. 讨论第140-144页
    参考文献第144-149页
第三部分 基于Armored RNA技术的白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测标准品的究制及评估第149-209页
    前言第149-153页
    1. 材料和方法第153-177页
        1.1. 实验材料和试剂配制第153-159页
            1.1.1. 实验仪器第153-154页
            1.1.2. 主要实验耗材第154页
            1.1.3. 主要实验试剂第154-156页
            1.1.4. 培养基和溶液的配制第156-158页
            1.1.5. 菌株和质粒第158-159页
        1.2. 方法第159-177页
            1.2.1. 构建pACYC-MS2-p210FG-CG、pACYC-MS2-p190FG-CG重组质粒第159-166页
            1.2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第166-170页
            1.2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第170-172页
            1.2.4. p210FG-CG、p190FG-CG VLPs的分装与冻干第172页
            1.2.5. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的制备及定值第172-174页
            1.2.6. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的线性分析第174-176页
            1.2.7. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的性能验证第176页
            1.2.8. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的区域性试验第176-177页
            1.2.9. 统计学分析第177页
    2. 结果第177-202页
        2.1. pACYC-MS2-p210FG-CG、pACYC-MS2-p190FG-CG重组质粒的验证第177-189页
            2.1.1. PCR验证第177页
            2.1.2. 测序验证第177-189页
        2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第189-190页
        2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第190-192页
            2.3.1. 琼脂糖凝胶电泳鉴定第190页
            2.3.2. SDS-PAGE鉴定第190-191页
            2.3.3. RT-qPCR验证VLPs包装片段第191-192页
        2.4. p210FG-CG和p190FG-CG标准品性能验证第192-193页
            2.4.1. 稳定性实验第192页
            2.4.2. 均一性实验第192-193页
        2.5. p210FG-CG、p190FG-CG标准品定值第193-195页
            2.5.1. p210FG-CG标准品dPCR检测结果第193-194页
            2.5.2. p190FG-CG标准品dPCR检测结果第194-195页
        2.6. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的线性分析结果第195-196页
        2.7. p210FG-CG、p190FG-CG标准品的区域性验证结果第196-202页
            2.7.1. 结果回报情况第196-197页
            2.7.2. p210和p190模拟样本转化前后结果分析第197-202页
    3. 讨论第202-205页
    参考文献第205-209页
第四部分 基于Armored RNA技术的白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测二级参考物质的制备及标准化研究第209-284页
    前言第209-214页
    1. 材料和方法第214-241页
        1.1. 实验材料和试剂配制第214-220页
            1.1.1. 实验仪器第214-215页
            1.1.2. 主要实验耗材第215页
            1.1.3. 主要实验试剂第215-217页
            1.1.4. 培养基和溶液的配制第217-219页
            1.1.5. 菌株和质粒第219-220页
        1.2. 方法第220-241页
            1.2.1. 构建pACYC-MS2-p210-p190FG、pACYC-MS2-23S重组质粒第220-227页
            1.2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第227-231页
            1.2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第231-233页
            1.2.4. 二级参考物质的制备第233-234页
            1.2.5. 二级参考物质的定值第234-240页
            1.2.6. 二级参考物质的性能验证第240页
            1.2.7. 二级参考物质的区域性试验第240-241页
            1.2.8. 统计学分析第241页
    2. 结果第241-277页
        2.1. pACYC-MS2-23S、pACYC-MS2-p210-p190FG重组质粒的验证第241-250页
            2.1.1. PCR验证第241-242页
            2.1.2. 测序验证第242-250页
        2.2. 重组病毒样颗粒的表达和纯化第250-251页
        2.3. 重组病毒样颗粒的鉴定第251-252页
            2.3.1. 琼脂糖凝胶电泳鉴定第251-252页
            2.3.2. SDS-PAGE鉴定第252页
            2.3.3. RT-qPCR鉴定第252页
        2.4. 二级参考物质定值第252-270页
            2.4.1. 商品化试剂盒定值第252-257页
            2.4.2. 自建方法定值第257-269页
            2.4.3. 商品化试剂盒和LDT对1~(st) WHO国际参考盘和二级参考物质检测结果比较第269-270页
        2.5. 二级参考物质的性能验证第270-271页
            2.5.1. 稳定性实验第270页
            2.5.2. 均一性实验第270-271页
        2.6. 二级参考物质的区域性验证第271-277页
            2.6.1. 结果回报情况第271-272页
            2.6.2. 区域性验证结果分析第272-277页
    3. 讨论第277-280页
    参考文献第280-284页
论文综述 A novel delivery platform based on Bacteriophage MS2 virus-like particles第284-306页
    References第295-306页
附录第306-329页
    附录1: pACYCDuet-1载体详细信息第306-308页
    附录2: 关于开展全国登革热病毒核酸检测室间质量评价预研的通知及回执第308-310页
    附录3: 2016年全国登革热病毒核酸检测室间质量评价活动安排及回报表第310-312页
    附录4: 关于开展全国白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测室间质量评价及一致性研究预研的通知及回执第312-314页
    附录5: 2017年全国白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测室间质量评价及一致性研究活动安排及回报表第314-319页
    附录6: 关于开展全国白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测标准化预研的通知及回执第319-321页
    附录7: 2018年白血病BCR-ABL1~(p210/p190)融合基因检测标准化活动安排及回报表第321-329页
致谢第329-331页
个人简介第331-332页

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