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基于转录组学解析半胱氨酸抑制艰难梭菌(Clostridium difficile)产毒的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
中英文对照和缩略词表第13-14页
第一章 绪论第14-34页
    1.1 引言第14页
    1.2 艰难梭菌与艰难梭菌感染第14-18页
        1.2.1 艰难梭菌第14-15页
        1.2.2 艰难梭菌感染及临床症状第15-16页
        1.2.3 艰难梭菌感染的流行病学特征第16-17页
        1.2.4 艰难梭菌感染的诊断与治疗第17-18页
    1.3 艰难梭菌的致病因子及其作用机制第18-20页
        1.3.1 TcdA和TcdB第18-19页
        1.3.2 二元毒素第19页
        1.3.3 其它致病因子第19-20页
    1.4 PaLoc区基因对艰难梭菌毒素基因表达的调控作用第20-22页
        1.4.1 TcdD第21页
        1.4.2 TcdC第21页
        1.4.3 TcdE第21-22页
    1.5 外环境变化对艰难梭菌毒素基因表达的调控作用第22-25页
        1.5.1 葡萄糖第22-23页
        1.5.2 氨基酸第23-25页
        1.5.3 其他物质第25页
        1.5.4 培养温度第25页
    1.6 其他基因对艰难梭菌毒素基因表达的调控作用第25-28页
        1.6.1 鞭毛合成相关基因第25-26页
        1.6.2 群体感应系统相关基因第26-27页
        1.6.3 产孢相关基因第27页
        1.6.4 前噬菌体及应激蛋白相关基因第27-28页
    1.7 转录组测序技术及其在艰难梭菌中的应用第28-31页
        1.7.1 转录组测序技术第28-29页
        1.7.2 转录组测序技术在艰难梭菌中的应用第29-31页
    1.8 本论文的研究意义及主要内容第31-34页
        1.8.1 研究目的及意义第31-32页
        1.8.2 主要研究内容第32-33页
        1.8.3 技术路线第33-34页
第二章 半胱氨酸对艰难梭菌全局基因表达调控的分析第34-60页
    2.1 引言第34-35页
    2.2 材料与方法第35-44页
        2.2.1 菌株和细胞株第35页
        2.2.2 试剂与溶液配制第35-38页
        2.2.3 实验仪器第38页
        2.2.4 实验方法第38-44页
    2.3 结果与讨论第44-58页
        2.3.1 不同氨基酸对艰难梭菌产毒水平的影响第44-46页
        2.3.2 半胱氨酸对艰难梭菌不同菌株产毒水平的影响第46-47页
        2.3.3 半胱氨酸对艰难梭菌生长及产毒的影响第47-48页
        2.3.4 半胱氨酸对艰难梭菌全局基因表达调控总体分析第48-51页
        2.3.5 半胱氨酸对艰难梭菌膜转运相关基因表达的影响第51-52页
        2.3.6 半胱氨酸对艰难梭菌代谢相关基因表达的影响第52-56页
        2.3.7 半胱氨酸对艰难梭菌027型菌株特有基因表达的影响第56-57页
        2.3.8 半胱氨酸对艰难梭菌鞭毛及核糖体合成基因表达的影响第57-58页
    2.4 本章小结第58-60页
第三章 艰难梭菌突变菌株构建及其产毒水平分析第60-72页
    3.1 引言第60-62页
    3.2 材料与方法第62-66页
        3.2.1 菌株和质粒第62页
        3.2.2 试剂与溶液配制第62-63页
        3.2.3 实验仪器第63页
        3.2.4 实验方法第63-66页
    3.3 结果与讨论第66-70页
        3.3.1 内含子序列设计第66-67页
        3.3.2 重组靶向质粒的构建第67-68页
        3.3.3 艰难梭菌突变菌株的构建、筛选及鉴定第68-70页
        3.3.4 艰难梭菌突变菌株产毒水平分析第70页
    3.4 本章小结第70-72页
第四章 艰难梭菌CdsB功能鉴定及其在产毒调控中的作用第72-90页
    4.1 引言第72-73页
    4.2 材料与方法第73-76页
        4.2.1 菌株和质粒第73页
        4.2.2 试剂与溶液配制第73页
        4.2.3 实验仪器第73-74页
        4.2.4 实验方法第74-76页
    4.3 结果与讨论第76-88页
        4.3.1 CdsB蛋白生物信息学分析第76-77页
        4.3.2 半胱氨酸对艰难梭菌cdsB基因转录水平的影响第77-78页
        4.3.3 cdsB基因灭活对半胱氨酸降解酶表达和硫化氢产生的影响第78-79页
        4.3.4 cdsB基因灭活对艰难梭菌生长的影响第79-80页
        4.3.5 cdsB基因灭活对艰难梭菌毒素基因表达的影响第80-81页
        4.3.6 半胱氨酸代谢产物对艰难梭菌产毒水平的影响第81-82页
        4.3.7 cdsB基因的转录调控第82-88页
    4.4 本章小结第88-90页
第五章 碳存储调控因子CsrA对艰难梭菌毒力的调控作用第90-102页
    5.1 引言第90-91页
    5.2 材料与方法第91-93页
        5.2.1 菌株、质粒和细胞株第91页
        5.2.2 试剂与溶液配制第91页
        5.2.3 实验仪器第91-92页
        5.2.4 实验方法第92-93页
    5.3 结果与讨论第93-101页
        5.3.1 CsrA蛋白生物信息学分析第93-95页
        5.3.2 艰难梭菌csrA基因过表达菌株构建及鉴定第95-96页
        5.3.3 艰难梭菌csrA基因过表达菌株生长曲线绘制第96页
        5.3.4 csrA基因过表达对艰难梭菌鞭毛及运动性的影响第96-98页
        5.3.5 csrA基因过表达对艰难梭菌产毒水平的影响第98-99页
        5.3.6 csrA基因过表达对艰难梭菌粘附能力的影响第99-100页
        5.3.7 csrA基因过表达对艰难梭菌代谢产物的影响第100-101页
    5.4 本章小结第101-102页
结论与展望第102-105页
    结论第102-103页
    创新点第103页
    展望第103-105页
参考文献第105-130页
附录第130-147页
攻读博士学位期间取得的研究成果第147-149页
致谢第149-150页
附件第150页

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