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Nuclear Speckle是调控活性P-TEFb的关键场所

英文缩略对照第11-13页
摘要第13-15页
Abstract第15-16页
第一章 前言第17-40页
    1.1 RNA PolⅡ控制的基因转录调控第17-21页
        1.1.1 RNA Pol Ⅱ的结构第17-18页
        1.1.2 RNA Pol Ⅱ CTD的活性调控第18-19页
        1.1.3 真核基因转录循环第19-21页
    1.2 P-TEFb复合体的发现、结构、功能以及活性调控机制第21-27页
        1.2.1 活性P-TEFb复合体的发现及结构第21-23页
        1.2.2 活性P-TEFb复合体在疾病中的功能第23-24页
        1.2.3 无活性P-TEFb的发现、结构及功能第24-26页
        1.2.4 细胞内调控P-TEFb活化的信号和分子机制第26-27页
    1.3 P-TEFb某些募集通道的发现第27-31页
        1.3.1 BRD4-P-TEFb的发现第27-28页
        1.3.2 BRD4及其家族广泛性研究第28-29页
        1.3.3 BRD4各结构域的功能第29-30页
        1.3.4 BRD4-P-TEFb的调控模式第30-31页
    1.4 SECs的组分、生物学功能及活性调控机制第31-34页
        1.4.1 超级延伸复合物(Super elongation complexs,SECs)的组成成分第31-32页
        1.4.2 超级延伸复合物(SECs)和人类疾病第32-33页
        1.4.3 超级延伸复合物(SECs)转录活性调控第33-34页
    1.5 NuclearSpeckle的发现、探索第34-38页
        1.5.1 Nuclear Speckle的发现第34-35页
        1.5.2 Nuclear Speckle的组成结构第35-36页
        1.5.3 Nuclear Speckle的动态变化和周期第36-37页
        1.5.4 Nuclear Speckle与P-TEFb所调控的转录延伸的关系第37-38页
    1.6 研究内容和意义第38-40页
        1.6.1 研究内容第38页
        1.6.2 研究意义第38-40页
第二章 实验材料和方法第40-58页
    2.1 实验材料、试剂与仪器第40-43页
        2.1.1 实验常用细胞株、菌株和质粒资源第40-41页
        2.1.2 实验常用试剂和材料第41-42页
        2.1.3 实验常用仪器和耗材第42页
        2.1.4 实验常用抗体第42-43页
    2.2 实验常用试剂配方第43-48页
        2.2.1 质粒DNA提取制备相关试剂第43-44页
        2.2.2 常用感受态制备试剂第44页
        2.2.3 细胞培养、转染及感染相关溶液第44-45页
        2.2.4 免疫荧光相关试剂第45-46页
        2.2.5 生化实验相关溶液第46-47页
        2.2.6 Western Blot相关溶液第47-48页
    2.3 实验方法第48-58页
        2.3.1 普通PCR克隆第48页
        2.3.2 琼脂糖胶/Glass Milk回收DNA第48-49页
        2.3.3 基因片段的T4连接第49页
        2.3.4 感受态的制备第49-50页
        2.3.5 基因QuikChange实验第50-51页
        2.3.6 特异性shRNA的构建第51-52页
        2.3.7 质粒DNA小量提取(碱裂解法)第52页
        2.3.8 质粒中量提取第52-53页
        2.3.9 细胞瞬时转染第53-54页
        2.3.10 病毒包装感染第54页
        2.3.11 细胞药物处理第54页
        2.3.12 核分级分离(Nucleic fractionation)第54-55页
        2.3.13 免疫印记实验(Western blot)第55页
        2.3.14 总RNA的提取第55-56页
        2.3.15 逆转录PCR(qRT-PCR)第56-58页
第三章 结果与讨论第58-79页
    3.1 在应激条件下,观察活性P-TEFb相关蛋白质组分的分布第58-61页
        3.1.1 改良核抽提方法观察活性P-TEFb相关蛋白质组分的分布第58-59页
        3.1.2 免疫荧光实验观察活性P-TEFb相关蛋白质组分的分布第59-61页
    3.2 UV照射下,观察活性P-TEFb相关蛋白组分间相互作用的变化第61-64页
        3.2.1 UV照射下,生化实验观察活性P-TEFb相关蛋白组分间相互作用的变化第61-62页
        3.2.2 免疫荧光实验观察活性P-TEFb及相关蛋白组分的分布第62-64页
    3.3 CDK9定位于Speckle机制的研究第64-69页
        3.3.1 敲除实验探索CDK9定位于Speckle的机制第64-67页
        3.3.2 BRD4、AFF1和AFF4是CDK9定位于Speckle的关键蛋白因子第67-69页
    3.4 CyclinT定位于Speckle的机制研究第69-74页
        3.4.1 敲除实验探索CyclinT定位于Speckle的机制第69-70页
        3.4.2 ELL2是CyclinT定位于Speckle的关键因子第70-71页
        3.4.3 CDK9和CyclinT是被不同的蛋白因子分别募集到Speckle的第71-74页
    3.5 7SK snRNP复合物解离的同时P-TEFb组分也发生解离第74-75页
    3.6 总结与讨论第75-79页
参考文献第79-88页
致谢第88页

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