| 摘要 | 第3-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 英文缩略词表 | 第26-28页 |
| 前言 | 第28-30页 |
| 第一章 DSS诱导的UC模型小鼠肠道内容物菌群变化特征 | 第30-99页 |
| 第一节 实验材料 | 第32-34页 |
| 一、实验动物 | 第32页 |
| 二、实验药品及试剂 | 第32页 |
| 三、实验仪器 | 第32-34页 |
| 第二节 实验方法 | 第34-42页 |
| 一、DSS诱导的UC小鼠模型复制 | 第34-35页 |
| 二、结肠组织病理学检查 | 第35-36页 |
| 三、肠道内容物的分离 | 第36页 |
| 四、肠道内容物总DNA提取 | 第36-37页 |
| 五、16SrRNA序列扩增 | 第37-38页 |
| 六、PCR产物纯化 | 第38页 |
| 七、文库构建及高通量测序 | 第38页 |
| 八、生物信息及生物统计分析 | 第38-42页 |
| 第三节 实验结果 | 第42-96页 |
| 一、小鼠体重变化 | 第42-44页 |
| 二、DAI评分 | 第44-46页 |
| 三、病理检测 | 第46-48页 |
| 四、数据质控 | 第48-55页 |
| 五、OTU分析和物种注释 | 第55-60页 |
| 六、多样性分析 | 第60-66页 |
| 七、差异菌群分析 | 第66-96页 |
| 第四节 小结与讨论 | 第96-99页 |
| 第二章 嘎日迪散对DSS诱导的UC模型小鼠肠道内容物菌群失衡的调节研究 | 第99-159页 |
| 第一节 实验材料 | 第100-102页 |
| 一、实验动物 | 第100页 |
| 二、实验药品及试剂 | 第100页 |
| 三、实验仪器 | 第100-102页 |
| 第二节 实验方法 | 第102-105页 |
| 一、DSS诱导的UC小鼠模型复制 | 第102页 |
| 二、分组与给药 | 第102-103页 |
| 三、结肠组织采集 | 第103页 |
| 四、结肠组织病理学检查 | 第103页 |
| 五、分离肠道内容物 | 第103页 |
| 六、肠道内容物总DNA提取 | 第103页 |
| 七、16SrRNA序列扩增 | 第103-104页 |
| 八、PCR产物纯化 | 第104页 |
| 九、构建文库及高通量测序 | 第104页 |
| 十、生物信息及生物统计分析 | 第104-105页 |
| 第三节 实验结果 | 第105-157页 |
| 一、小鼠体重变化 | 第105-107页 |
| 二、DAI评分 | 第107-109页 |
| 三、病理检测 | 第109-110页 |
| 四、数据质控 | 第110-119页 |
| 五、OTU分析和物种注释 | 第119-125页 |
| 六、多样性分析 | 第125-131页 |
| 七、差异菌群分析 | 第131-157页 |
| 第四节 小结与讨论 | 第157-159页 |
| 第三章 UC模型小鼠肠道内容物,外黏液层,内黏液层菌群变化分析 | 第159-184页 |
| 第一节 实验材料 | 第160-162页 |
| 一、实验动物 | 第160页 |
| 二、实验药品及试剂 | 第160页 |
| 三、实验仪器 | 第160-162页 |
| 第二节 实验方法 | 第162-164页 |
| 一、DSS诱导的UC小鼠模型复制 | 第162页 |
| 二、结肠组织病理学检查 | 第162页 |
| 三、分离结肠内容物、外黏液层、内黏液层 | 第162页 |
| 四、样本总DNA提取 | 第162页 |
| 五、16SrRNA序列扩增及高通量测序 | 第162-163页 |
| 六、生物信息及生物统计分析 | 第163-164页 |
| 第三节 结果 | 第164-180页 |
| 一、模型评价 | 第164页 |
| 二、菌群多样性分析 | 第164-165页 |
| 三、差异菌群分析 | 第165-180页 |
| 第四节 小结与讨论 | 第180-184页 |
| 第四章 嘎日迪散对UC模型小鼠肠道外黏液层,内黏液层菌群失衡的调节研究 | 第184-241页 |
| 第一节 实验材料 | 第184-186页 |
| 一、实验药品及试剂 | 第184页 |
| 二、实验药品及试剂 | 第184-185页 |
| 三、实验仪器 | 第185-186页 |
| 第二节 实验方法 | 第186-188页 |
| 一、DSS诱导的UC小鼠模型复制 | 第186页 |
| 二、分组与给药 | 第186页 |
| 三、结肠组织病理学检查 | 第186页 |
| 四、分离结肠内容物、外黏液层、内黏液层 | 第186页 |
| 五、样本总DNA提取 | 第186-187页 |
| 六、16SrRNA序列扩增 | 第187页 |
| 七、PCR产物纯化 | 第187页 |
| 八、构建文库及高通量测序 | 第187页 |
| 九、生物信息及生物统计分析 | 第187-188页 |
| 第三节 结果 | 第188-239页 |
| 一、数据质控 | 第188-190页 |
| 二、OTU分析和物种注释 | 第190-198页 |
| 三、差异菌群分析 | 第198-239页 |
| 第四节 小结与讨论 | 第239-241页 |
| 第五章 总结 | 第241-242页 |
| 综述: 肠道菌群与炎症性肠病的关系 | 第242-250页 |
| 参考文献 | 第250-261页 |
| 致谢 | 第261-263页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第263-264页 |
