| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第9-12页 |
| 1.1.1 组蛋白修饰 | 第9-11页 |
| 1.1.2 模式生物小鼠 | 第11-12页 |
| 1.1.3 基因功能及注释 | 第12页 |
| 1.2 论文结构 | 第12-14页 |
| 第二章 数据和研究方法 | 第14-18页 |
| 2.1 数据介绍 | 第14-15页 |
| 2.1.1 数据来源 | 第14页 |
| 2.1.2 数据预处理 | 第14-15页 |
| 2.2 相关计算方法 | 第15-16页 |
| 2.2.1 基因表达值RPKM | 第15页 |
| 2.2.2 组蛋白修饰值 | 第15-16页 |
| 2.3 相关性分析 | 第16-17页 |
| 2.3.1 RPKM与组蛋白修饰之间的Pearson相关系数 | 第16页 |
| 2.3.2 组蛋白修饰之间的Spearman相关系数 | 第16-17页 |
| 2.4 小结 | 第17-18页 |
| 第三章 人类和小鼠同源基因组蛋白修饰差异分析 | 第18-25页 |
| 3.1 同源基因四个细胞系全基因组组蛋白修饰差异分析 | 第18-20页 |
| 3.2 同源基因六个功能区域高低表达基因差异倍数 | 第20-22页 |
| 3.3 同源基因在TSS附近的组蛋白修饰分布差异分析 | 第22-23页 |
| 3.4 同源基因高低表达基因组蛋白修饰之间Spearman相关性 | 第23-24页 |
| 3.5 讨论和小结 | 第24-25页 |
| 第四章 组蛋白修饰和RPKM的Pearson相关性分析 | 第25-29页 |
| 4.1 同源基因在TSS附近组蛋白修饰和RPKM的Pearson相关性分析 | 第25-26页 |
| 4.2 编码蛋白基因组蛋白修饰和RPKM的Pearson相关性分析 | 第26-27页 |
| 4.3 非共有基因蛋白修饰和RPKM的相关系数分析 | 第27页 |
| 4.4 讨论和小结 | 第27-29页 |
| 第五章 基因功能和通路分析 | 第29-36页 |
| 5.1 人类和小鼠非共有基因的GO分析 | 第29-30页 |
| 5.2 人类和小鼠非共有基因的KEGG分析 | 第30-31页 |
| 5.3 癌症通路中的基因组蛋白修饰和RPKM的Pearson系数分析 | 第31-32页 |
| 5.4 CML通路里致癌基因和抑癌基因的组蛋白修饰分布 | 第32-34页 |
| 5.5 同源基因的组蛋白修饰的信号强度 | 第34-35页 |
| 5.6 讨论和小结 | 第35-36页 |
| 第六章 总结与展望 | 第36-38页 |
| 6.1 全文总结 | 第36-37页 |
| 6.2 工作展望 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-42页 |
| 致谢 | 第42-43页 |
| 作者在硕士学位期间内发表和完成的论文 | 第43页 |
