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奶牛肽聚糖识别蛋白与溶菌酶基因克隆表达及其SNP与SCS关联分析

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-12页
第一章 综述第18-42页
    引言第18-19页
    1.1 肽聚糖识别蛋白研究进展第19-27页
        1.1.1 肽聚糖识别蛋白概述第19-21页
        1.1.2 肽聚糖识别蛋白特点第21-22页
        1.1.3 肽聚糖识别蛋白功能第22-27页
    1.2 哺乳动物溶菌酶研究进展第27-31页
        1.2.1 溶菌酶概述第27-28页
        1.2.2 溶菌酶生物学功能第28-29页
        1.2.3 影响溶菌酶活性的因素第29页
        1.2.5 牛溶菌酶研究进展第29-31页
    1.3 蛋白的生物合成第31-40页
        1.3.1 原核表达系统第31-34页
        1.3.2 酵母表达系统第34-37页
        1.3.3 昆虫表达系统第37-38页
        1.3.4 哺乳动物表达系统第38-39页
        1.3.5 小结第39-40页
    1.4 本研究的目的和意义第40-42页
第二章 PGLYRP1 基因多态性及其与 SCS、产奶性状关联分析第42-56页
    引言第42-43页
    2.1 材料与方法第43-47页
        2.1.1 材料第43-44页
        2.1.2 方法第44-47页
    2.2 结果与分析第47-53页
        2.2.1 PGLYRP1 基因 SNP 位点检测第47-48页
        2.2.2 PGLYRP1 基因 SNP 位点分型第48页
        2.2.3 PGLYRP1 基因 SNP 位点群体遗传分析第48-51页
        2.2.4 PGLYRP1 基因 SNP 位点与 SCS、产奶性状关联分析第51页
        2.2.5 PGLYRP1 基因 SNP 位点连锁不平衡分析第51-52页
        2.2.6 PGLYRP1 基因 SNP 位点单倍型分析第52页
        2.2.7 SNP 位点单倍型组合与 SCS、产奶性状关联分析第52-53页
    2.3 讨论第53-55页
        2.3.1 肽聚糖识别蛋白杀菌机制第53页
        2.3.2 乳房炎与体细胞评分(SCS)第53-54页
        2.3.3 PCR-PIRA 提高 SNP 位点分型效率第54页
        2.3.4 PGLYRP1 基因多态性与性状之间关联第54-55页
    2.4 小结第55-56页
第三章 PGLYRP2 基因多态性及其与 SCS、产奶性状关联分析第56-64页
    引言第56页
    3.1 材料与方法第56-58页
        3.1.1 材料第56-57页
        3.1.2 方法第57-58页
    3.2 结果与分析第58-62页
        3.2.1 PGLYRP2 基因 SNP 位点检测第58-59页
        3.2.2 PGLYRP2 基因 SNP 位点分型第59页
        3.2.3 PGLYRP2 基因 SNP 位点群体遗传分析第59-60页
        3.2.4 PGLYRP2 基因 SNP 位点与 SCS、产奶性状关联分析第60-61页
        3.2.5 PGLYRP2 基因 SNP 位点连锁不平衡分析第61页
        3.2.6 PGLYRP2 基因 SNP 位点单倍型分析第61-62页
        3.2.7 SNP 位点单倍型组合与 SCS、产奶性状关联分析第62页
    3.3 讨论第62-63页
        3.3.1 PGLYRP2 在哺乳动物机体中的功能第62-63页
        3.3.2 PGLYRP2 基因 SNP 与性状之间的关联第63页
    3.4 小结第63-64页
第四章 PGLYRP3、PGLYRP4 基因多态性及其与 SCS、产奶性状关联分析第64-75页
    引言第64-65页
    4.1 材料与方法第65-67页
        4.1.1 材料第65页
        4.1.2 方法第65-67页
    4.2 结果与分析第67-73页
        4.2.1 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点检测第67页
        4.2.2 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点分型第67-68页
        4.2.3 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点群体遗传分析第68-69页
        4.2.4 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点关联分析第69-70页
        4.2.5 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点连锁不平衡分析第70-71页
        4.2.6 PGLYRP3、PGLYRP4 基因 SNP 位点单倍型分析第71-72页
        4.2.7 SNP 位点单倍型组合与 SCS、产奶性状关联分析第72-73页
    4.3 讨论第73-74页
        4.3.1 PGLYRP3 与 PGLYRP4 基因 SNP 位点与性状关联第73-74页
    4.4 小结第74-75页
第五章 PGLYRP1 基因克隆、序列分析与真核表达第75-101页
    引言第75页
    5.1 材料与方法第75-93页
        5.1.1 材料第75-79页
        5.1.2 方法第79-93页
    5.2 结果与分析第93-99页
        5.2.1 cDNA 内参基因扩增检测第93-94页
        5.2.2 PGLYRP1 信号肽预测第94页
        5.2.3 PGLYRP1 目的片段扩增第94页
        5.2.4 pMD-18T-PGLYRP1 重组克隆载体酶切鉴定第94-95页
        5.2.5 pMD-18T-PGLYRP1 重组克隆载体序列测定及序列分析第95页
        5.2.6 pPIC9K-PGLYRP1 重组表达载体酶切鉴定第95-96页
        5.2.7 pPIC9K-PGLYRP1 转化毕赤酵母 GS11557第96页
        5.2.8 Tricine-SDS-PAGE 电泳检测重组 PGLYRP1 表达第96页
        5.2.9 Western Blot 检测重组 PGLYRP1 表达第96-97页
        5.2.10 重组 PGLYRP1 蛋白浓缩第97页
        5.2.11 重组 PGLYRP1 蛋白纯化第97-98页
        5.2.12 重组 PGLYRP1 抑菌活性检测第98-99页
    5.3 讨论第99-100页
        5.3.1 酵母表达系统优势第99页
        5.3.2 PGLYRP1 蛋白对不同致病菌抗菌活性差异第99-100页
    5.4 小结第100-101页
第六章 PGLYRP2、PGLYRP3S、PGLYRP3L、PGLYRP4 基因克隆、序列分析与真核表达第101-130页
    引言第101页
    6.1 材料与方法第101-112页
        6.1.1 材料第101页
        6.1.2 方法第101-112页
    6.2 结果与分析第112-128页
        6.2.1 外层片段扩增第112-114页
        6.2.2 外层扩增片段 TA 克隆与测序验证第114-117页
        6.2.3 编码区生物信息学分析第117-119页
        6.2.4 带有酶切位点、信号肽、His 标签的目的片段扩增第119-121页
        6.2.5 重组克隆载体构建与酶切鉴定第121-122页
        6.2.6 重组表达载体酶切鉴定第122-125页
        6.2.7 重组表达蛋白 SDS-PAGE 检测第125-128页
    6.3 讨论第128-129页
        6.3.1 PGLYRP3 基因克隆与可变剪切第128页
        6.3.2 PGLYRP2、PGLYRP3、PGLYRP4 可能不适于在酵母中表达第128-129页
    6.4 小结第129-130页
第七章 肽聚糖识别蛋白原核表达载体构建与诱导表达第130-151页
    引言第130页
    7.1 材料与方法第130-135页
        7.1.1 材料第130-131页
        7.1.2 方法第131-135页
    7.2 结果与分析第135-149页
        7.2.1 带有酶切位点的目的片段扩增第135-137页
        7.2.2 重组克隆载体构建与酶切鉴定第137-139页
        7.2.3 重组表达载体酶切鉴定第139-142页
        7.2.4 重组目的蛋白诱导表达第142-146页
        7.2.5 重组目的蛋白纯化第146-149页
    7.3 讨论第149-150页
        7.3.1 肽聚糖识别蛋白的包涵体表达第149页
        7.3.2 肽聚糖识别蛋白可溶表达与纯化第149-150页
    7.4 小结第150-151页
第八章 奶牛六个溶菌酶亚型基因克隆、真核表达与抑菌活性分析第151-166页
    引言第151页
    8.1 材料与方法第151-155页
        8.1.1 材料第151-152页
        8.1.2 方法第152-155页
    8.2 结果与分析第155-163页
        8.2.1 溶菌酶基因片段扩增第155-156页
        8.2.2 重组克隆载体酶切鉴定第156-157页
        8.2.3 重组克隆载体测序鉴定第157-158页
        8.2.4 溶菌酶亚型之间 DNA 与氨基酸序列比对第158页
        8.2.5 重组表达载体构建第158-160页
        8.2.6 线性化重组表达载体转化酵母 GS115 菌株及 G418 筛选第160页
        8.2.7 重组溶菌酶诱导表达及 Tricine-SDS-PAGE 检测第160-161页
        8.2.8 重组溶菌酶硫酸铵浓缩第161页
        8.2.9 重组溶菌酶纯化第161-162页
        8.2.10 重组溶菌酶抑菌活性检测第162-163页
    8.3 讨论第163-165页
        8.3.1 不同溶菌酶亚型基因克隆与表达量差异第163页
        8.3.2 不同溶菌酶亚型抑菌活性差异第163-165页
    8.4 小结第165-166页
第九章 研究结论第166-168页
    9.1 研究结论第166页
    9.2 创新点第166页
    9.3 下一步研究内容第166-168页
参考文献第168-178页
附录 1 PGLYRP1 抑菌试验第178-181页
附录 2 肽聚糖识别蛋白信号肽预测第181-183页
附录 3 6 个溶菌酶亚型信号肽预测第183-186页
附录 4 溶菌酶抑菌试验第186-189页
附录 5 肽聚糖识别蛋白基因编码区序列第189-192页
附录 6 5 种溶菌酶亚型 DNA 编码区序列第192-194页
附录 7 主要仪器设备第194-195页
缩略词表第195-196页
致谢第196-197页
作者简介第197页

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