| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 高频词汇中英文对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-28页 |
| 1 动物高海拔的适应 | 第14-22页 |
| 1.1 高海拔适应的生理变化 | 第14-17页 |
| 1.2 高海拔适应的分子机制 | 第17-22页 |
| 2 LncRNA的研究进展 | 第22-27页 |
| 2.1 lncRNA的特征 | 第22-23页 |
| 2.2 lncRNA的分类 | 第23-24页 |
| 2.3 lncRNA的功能和作用机制 | 第24-25页 |
| 2.4 lncRNA的研究方法和数据库 | 第25-27页 |
| 3 低氧对妊娠的影响 | 第27-28页 |
| 第二章 选题背景与目的意义 | 第28-31页 |
| 1 选题背景 | 第28-29页 |
| 2 主要研究内容 | 第29-30页 |
| 3 研究的目的与意义 | 第30-31页 |
| 第三章 材料与方法 | 第31-44页 |
| 1 实验设计和样本收集 | 第31-32页 |
| 2 实验仪器和主要试剂 | 第32-34页 |
| 2.1 主要仪器设备 | 第32-33页 |
| 2.2 主要试剂 | 第33页 |
| 2.3 常用试剂的配制 | 第33-34页 |
| 3 实验方法 | 第34-40页 |
| 3.1 DNA的提取及质检 | 第34页 |
| 3.2 RNA提取及检测 | 第34-37页 |
| 3.3 lncRNA测序文库的构建 | 第37-38页 |
| 3.4 线粒体拷贝数检测 | 第38页 |
| 3.5 荧光定量验证 | 第38-40页 |
| 4 数据分析 | 第40-44页 |
| 4.1 定量数据分析 | 第40页 |
| 4.2 序列比对与组装 | 第40-41页 |
| 4.3 编码RNA (mRNA)的分析 | 第41-42页 |
| 4.4 lncRNA的鉴定和分析 | 第42-44页 |
| 第四章 结果与分析 | 第44-101页 |
| 1 核酸质检结果 | 第44-46页 |
| 1.1 RNA甲醛变性琼脂凝胶质检结果 | 第44页 |
| 1.2 RNA毛细管电泳质检结果 | 第44-46页 |
| 2 线粒体拷贝数差异分析 | 第46-49页 |
| 2.1 线粒体拷贝数的组织差异 | 第46-48页 |
| 2.2 线粒体拷贝数的海拔差异 | 第48-49页 |
| 3 高通量测序数据概述 | 第49-54页 |
| 3.1 测序错误率分布检查结果 | 第49页 |
| 3.2 碱基含量分布检查结果 | 第49-54页 |
| 4 高低海拔妊娠胎儿的mRNA检测与功能分析 | 第54-74页 |
| 4.1 mRNA的表达检测 | 第54-56页 |
| 4.2 高通量测序数据的Q-PCR验证 | 第56-57页 |
| 4.3 mRNA表达量的特征分析 | 第57-60页 |
| 4.4 mRNA表达量的相关性分析 | 第60-62页 |
| 4.5 mRNA表达量的聚类和主成份分析 | 第62-63页 |
| 4.6 差异表达mRNA的鉴定 | 第63-67页 |
| 4.7 差异mRNA的功能富集分析 | 第67-74页 |
| 5 高低海拔妊娠胎儿的lncRNA鉴定与功能分析 | 第74-101页 |
| 5.1 lncRNA的鉴定结果 | 第74-76页 |
| 5.2 lncRNA的分类统计 | 第76-79页 |
| 5.3 lncRNA的基本特征分析 | 第79-82页 |
| 5.4 lncRNA表达量特征分析 | 第82-84页 |
| 5.5 lncRNA表达量的相关性分析 | 第84-86页 |
| 5.6 lncRNA表达量的聚类和主成分分析 | 第86-87页 |
| 5.7 差异表达lncRNA的鉴定 | 第87-89页 |
| 5.8 差异lncRNA的功能预测 | 第89-101页 |
| 第五章 讨论 | 第101-108页 |
| 1 高原妊娠的初生仔猪各组织中线粒体拷贝数显著下降 | 第101-103页 |
| 2 lncRNA的基因组特征 | 第103-104页 |
| 3 lnRNA的功能预测 | 第104-106页 |
| 4 高低海拔环境初生仔猪在转录组水平的差异 | 第106-108页 |
| 第六章 结论与创新点 | 第108-110页 |
| 1 结论 | 第108-109页 |
| 2 本研究创新点 | 第109页 |
| 3 进一步的工作展望 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 附录 | 第119-130页 |
| 附表1 表达量最高的前10个mRNA | 第119-120页 |
| 附表2 脑、心和肺组织中都差异表达的mRNA | 第120-121页 |
| 附表3 表达量最高的前10个lncRNA | 第121-122页 |
| 附表4 高可靠性的组织特异性lncRNA的基因组及表达量信息 | 第122-130页 |
| 博士在读期间发表的论文 | 第130页 |