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高温内切纤维素酶突变体晶体结构解析及功能进化关系分析

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
第1章 前言第12-29页
    1.1 木质素生物质转化研究第12-18页
        1.1.1 植物细胞壁的组成第13页
        1.1.2 木质纤维素的主要成分第13-16页
        1.1.3 木质纤维素生物冶炼的前处理第16-17页
        1.1.4 木质素生物质生物冶炼的酶解催化第17页
        1.1.5 嗜热微生物及高温纤维素酶在生物炼制过程中的应用第17-18页
    1.2 木质素生物质降解酶系第18-23页
        1.2.1 产纤维素酶系微生物的多样性第19页
        1.2.2 纤维素酶的组成第19-20页
        1.2.3 纤维素酶的水解机制第20-22页
        1.2.4 纤维素酶的协同降解机制第22-23页
    1.3 纤维素酶结构与生物信息学相关研究进展第23-27页
        1.3.1 纤维素酶序列与功能多样性第24-25页
        1.3.2 纤维素酶三级结构第25-26页
        1.3.3 纤维素酶结构与功能的关系第26-27页
        1.3.4 纤维素酶蛋白的结晶与结构解析第27页
    1.4 论文立题依据第27-29页
第2章 实验材料与方法第29-36页
    2.1 实验材料第29-30页
        2.1.1 实验菌种、质粒及试剂第29页
        2.1.2 实验仪器第29-30页
    2.2 生物信息学及结构生物相关软件及网站第30-31页
    2.3 实验方法第31-36页
        2.3.1 全质粒 PCR 构建 CbCel9A 突变体第31页
        2.3.2 野生型 CbCel9A 及突变体的培养、表达及纯化第31-32页
        2.3.33 , 5-二硝基水杨酸比色法(DNS 法)测定纤维素酶活力第32页
        2.3.4 热稳定性测定及 DSC 扫描实验第32-33页
        2.3.5 蛋白质结晶条件筛选与优化第33页
        2.3.6 晶体 X-ray 衍射与数据收集第33-34页
        2.3.7 分子置换法解析晶体结构及晶体结构精修第34页
        2.3.8 GH9 家族序列和蛋白结构的收集及处理第34页
        2.3.9 GH9 家族糖苷水解酶蛋白序列分析第34-35页
        2.3.10 GH9 家族糖苷水水解酶“活性中心架构”潜在序列谱构建第35页
        2.3.11 全家族序列背景下“活性中心架构”氨基酸频率统计第35-36页
第3章 突变体功能测定与 N8 结构解析第36-64页
    3.1 实验结果与讨论第36-62页
        3.1.1 野生型 CbCel9A 蛋白质序列信息分析及突变体设计第36-37页
        3.1.2 高温纤维素酶 CbCel9A 与突变体的分子克隆、表达、纯化第37-39页
        3.1.3 野生型 CbCel9A 与系列突变体酶学性质对比分析第39-40页
        3.1.4 野生型 CbCel9A 与突变体 N8 的催化动力学与热稳定性第40-42页
        3.1.5 CbCel9A 及突变体 N8 的结晶第42页
        3.1.6 突变体 N8 晶体衍射数据的收集与处理第42-44页
        3.1.7 突变体 N8 结构模型的解析及质量评估第44-45页
        3.1.8 突变体 N8 整体结构描述第45-48页
        3.1.9 突变体 N8 催化结构域(CD)结构特征第48-52页
        3.1.10 突变体 N8 糖类结合模块(CBM)结构概述第52-53页
        3.1.11 突变体 N8 同源结构分析第53-57页
        3.1.12 突变体 N8 结构稳定性因素分析第57-59页
        3.1.13 变体 N8 稳定性机制第59-62页
    3.2 本章小结第62-64页
第4章 糖苷水解酶 GH9 家族活性中心架构构建第64-72页
    4.1 实验结果与讨论第64-71页
        4.1.1 GH9 家族糖苷水解酶系统发育树第64-65页
        4.1.2 GH9 家族糖苷水解酶催化结构域结构表面电势分析第65-66页
        4.1.3 GH9 家族糖苷水解酶活性中心架构潜在位点第66-67页
        4.1.4 活性中心架构潜在位点序列谱的生成第67-71页
    4.2 本章小结第71-72页
参考文献第72-81页
作者简介第81页
硕士期间待发表文章第81-82页
致谢第82页

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