中文摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 新抗生素的筛选 | 第10-30页 |
1.1 引言 | 第10-14页 |
1.1.1 极端环境微生物研究进展 | 第10-12页 |
1.1.2 结合生物信息学预测微生物的应用 | 第12页 |
1.1.3 极端环境微生物的应用 | 第12-13页 |
1.1.4 研究目的和意义 | 第13-14页 |
1.2 实验材料 | 第14-15页 |
1.2.1 菌株 | 第14页 |
1.2.2 主要仪器和设备 | 第14页 |
1.2.3 培养基配方 | 第14-15页 |
1.3 实验方法 | 第15-17页 |
1.3.1 样品采集及菌株分离 | 第15页 |
1.3.2 拮抗MRSA的菌株筛选 | 第15页 |
1.3.3 菌株的16SrRNA基因测序及其系统发育树的构建 | 第15页 |
1.3.4 扫描电镜观察 | 第15页 |
1.3.5 菌丝体制备 | 第15-16页 |
1.3.6 菌株5-1-3的全基因组测序 | 第16页 |
1.3.7 菌株5-1-3的基因组注释 | 第16页 |
1.3.8 菌株5-1-3的COGs功能聚类和antiSMASH分析 | 第16页 |
1.3.9 新抗生素的提取和分离纯化 | 第16-17页 |
1.3.10 抗生素化学结构式的解析与鉴定 | 第17页 |
1.4 结果与分析 | 第17-28页 |
1.4.1 菌株的分离筛选 | 第17-18页 |
1.4.2 菌株5-1-3的鉴定 | 第18-19页 |
1.4.2.1 菌株5-1-3形态特征及生理特性 | 第18-19页 |
1.4.2.2 16SrRNA序列分析 | 第19页 |
1.4.3 Streptomycessp.5-1-3的全基因组序列分析 | 第19-20页 |
1.4.4 Streptomycessp.5-1-3全基因组序列信息 | 第20-21页 |
1.4.5 Streptomycessp.5-1-3相关COG聚类功能分析 | 第21-22页 |
1.4.6 Streptomycessp.5-1-3次级代谢产物基因簇的挖掘 | 第22-25页 |
1.4.7 新抗生素的分离纯化 | 第25-27页 |
1.4.8 新抗生素化学结构式解析和鉴定 | 第27页 |
1.4.9 新抗生素的化学结构式比对 | 第27-28页 |
1.5 讨论和展望 | 第28-30页 |
1.5.1 讨论 | 第28页 |
1.5.2 展望 | 第28-30页 |
第二章 抗菌肽PSI的异源表达 | 第30-59页 |
2.1 引言 | 第30-33页 |
2.1.1 来源于植物中抗菌肽PSI的研究进展 | 第30-31页 |
2.1.2 乳酸克鲁维酵母的研究进展 | 第31-32页 |
2.1.3 抗菌肽的生物信息学分析 | 第32页 |
2.1.4 研究目的和意义 | 第32-33页 |
2.2 实验材料 | 第33-34页 |
2.2.1 菌株和载体 | 第33页 |
2.2.2 酶和生化试剂 | 第33页 |
2.2.3 主要仪器和设备 | 第33-34页 |
2.2.4 培养基配方 | 第34页 |
2.3 实验方法 | 第34-41页 |
2.3.1 PSI基因的重组质粒构建 | 第34-38页 |
2.3.2 重组质粒的电击转化和筛选 | 第38页 |
2.3.3 乳酸克鲁维酵母阳性转化子的诱导 | 第38-39页 |
2.3.4 重组pKLACPSI菌株的诱变 | 第39页 |
2.3.5 10-100L双联发酵罐高密度发酵 | 第39-40页 |
2.3.6 抗菌肽PSI生物效价的检测 | 第40页 |
2.3.7 SDS-PAGE | 第40页 |
2.3.8 抗菌肽PSI的分离纯化 | 第40-41页 |
2.4 结果与分析 | 第41-56页 |
2.4.1 酵母表达载体的构建 | 第41-45页 |
2.4.1.1 三种抗菌肽PSI核酸序列合成 | 第41-43页 |
2.4.1.2 三种抗菌肽PSI的PCR扩增 | 第43-44页 |
2.4.1.3 三种抗菌肽PSI的重组质粒构建 | 第44页 |
2.4.1.4 三种重组质粒的酶切鉴定 | 第44-45页 |
2.4.2 三种抗菌肽诱导表达 | 第45-54页 |
2.4.2.1 抗菌肽PSI-PP诱导表达 | 第45-48页 |
2.4.2.2 抗菌肽PSI-VV诱导表达 | 第48-51页 |
2.4.2.3 抗菌肽PSI-CS诱导表达 | 第51-54页 |
2.4.3 三种抗菌肽PSI的抗菌谱 | 第54-56页 |
2.4.3.1 抗菌肽PSI-PP的抗菌谱 | 第55页 |
2.4.3.2 抗菌肽PSI-VV的抗菌谱 | 第55-56页 |
2.4.3.3 抗菌肽PSI-CS的抗菌谱 | 第56页 |
2.5 讨论和展望 | 第56-59页 |
2.5.1 讨论 | 第56-57页 |
2.5.2 展望 | 第57-59页 |
参考文献 | 第59-63页 |
在校期间科研成果 | 第63-64页 |
致谢 | 第64页 |