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水稻感光基因dth2的精细定位及感温基因LTG1的图位克隆与功能分析

全文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第12-26页
    1 水稻生育期与抽穗期的概念第12-13页
        1.1 基本营养生长性第12-13页
        1.2 感光性第13页
        1.3 感温性第13页
    2 水稻抽穗期QTL定位与互作研究第13-14页
    3 水稻抽穗期基因的克隆和功能分析第14-21页
        3.1 水稻抽穗期感光基因Se-5的克隆第14页
        3.2 Hd1的克隆及功能分析第14-15页
        3.3 Hd6的克隆及功能分析第15-16页
        3.4 Hd3a的克隆及功能分析第16-17页
        3.5 RFT1的克隆与功能分析第17-18页
        3.6 MADS-box转录因子第18-19页
        3.7 Ehd1的克隆及功能分析第19页
        3.8 OsGI的克隆与功能分析第19-20页
        3.9 RID1/OsID1/Ehd2的克隆与功能分析第20页
        3.10 Ghd7的克隆及其对水稻抽穗期的影响第20-21页
    4 水稻抽穗期基因与拟南芥成花基因的比较第21-23页
        4.1 水稻和拟南芥具有保守的光周期调控开花途径第21-23页
        4.2 水稻抽穗期基因与拟南芥成花基因又各有其自身特点第23页
    5 水稻抽穗期研究尚存在的主要问题第23-25页
        5.1 水稻抽穗期QTL的分离和克隆第23-24页
        5.2 水稻抽穗期QTL的感光性与上位性鉴定第24页
        5.3 控制水稻抽穗期的感温基因的发掘与克隆第24页
        5.4 水稻抽穗期遗传网络的完善第24页
        5.5 水稻抽穗期基因/QTL的育种应用第24-25页
    6 本研究的主要内容第25-26页
第二章 水稻抽穗期QTL定位及感光QTL dth2的单基因分解与精细定位第26-42页
    摘要第26-28页
    1 材料和方法第28-31页
        1.1 供试材料第28页
        1.2 田间试验第28-29页
        1.3 抽穗期鉴定标准第29页
        1.4 DNA提取,PCR程序以及DNA分子标记分析第29-30页
        1.5 QTL定位和统计分析第30-31页
        1.6 dth2的精细定位第31页
        1.7 候选基因预测、测序以及BLAST分析第31页
    2 结果第31-39页
        2.1 利用Asominori×IR24 RIL群体检测水稻抽穗期QTLs第31-32页
        2.2 染色体片段置换系CSSL23同时含有抽穗期QTL dth2和dth3第32-33页
        2.3 CSSL23超亲迟熟的遗传基础第33页
        2.4 抽穗期QTL dth2的精细定位第33-37页
        2.5 精细定位区间内可能的候选基因第37-39页
    3 讨论第39-42页
        3.1 利用两个遗传作图群体均检测到的抽穗期QTL dth2是一个尚待克隆的基因第39页
        3.2 抽穗期QTL dth2和dth3具有相互独立的晚熟效应第39-40页
        3.3 dth2基因的精细定位第40页
        3.4 抽穗期QTL dth2候选基因预测第40-42页
第三章 控制水稻低温生长的感温基因LTG1的图位克隆与功能分析第42-74页
    摘要第42-43页
    1 材料和方法第43-51页
        1.1 供试材料第43页
        1.2 田间材料种植第43页
        1.3 抽穗期和产量性状调查第43页
        1.4 扫描电镜观察第43-45页
        1.5 基因LTG1的精细定位第45页
        1.6 转基因载体构建第45页
        1.7 农杆菌介导的水稻遗传转化第45-46页
        1.8 生物信息学分析第46页
        1.9 亚细胞定位第46页
        1.10 原核表达第46-49页
        1.11 重组蛋白定量和酶活分析第49页
        1.12 RNA的提取,RT-PCR和Real-time PCR第49-50页
            1.12.1 总RNA提取第49-50页
            1.12.2 RT-PCR第50页
            1.12.3 Real-time PCR第50页
        1.13 GUS活性的组织化学染色分析第50页
        1.14 基因芯片分析第50-51页
        1.15 节律表达材料种植及取样第51页
    2 结果与分析第51-69页
        2.1 LTG1的遗传分析与初步定位第51页
        2.2 近等基因系构建与表型描述第51-54页
        2.3 LTG1的图位克隆与转基因分析第54-58页
        2.4 LTG1编码一个Casein kinase Ⅰ蛋白第58-61页
        2.5 LTG1的表达模式分析第61-62页
        2.6 LTG1可能参与ABA调控途径第62-65页
        2.7 LTG1与已克隆的抽穗期基因的关系第65-66页
        2.8 LTG1是一个驯化相关基因第66页
        2.9 LTG1在北方温带地区种植时控制着水稻的株高和产量第66-68页
        2.10 LTG1在两系杂交稻杂交制种中的潜在应用第68-69页
    3 讨论第69-74页
        3.1 LTG1的图位克隆第69-70页
        3.2 LTG1编码一个酪蛋白激酶(Casein kinase Ⅰ)亚家族蛋白第70页
        3.3 LTG1中的突变位点位于COOH—端非催化结构域第70-71页
        3.4 LTG1控制低温生长的作用机理初探第71页
        3.5 LTG1可能的驯化过程第71-72页
        3.6 LTG1对水稻株高、产量的影响第72-73页
        3.7 LTG1潜在的育种价值第73-74页
第四章 全文结论第74-80页
    4.1 dth2被最终限定在56.8kb的区间范围内第74-75页
    4.2 dth2可能是一个编码Zn-finger家族蛋白的基因第75页
    4.3 dth2是一个仅在长日照下延迟抽穗的感光基因第75页
    4.4 感光性相同的抽穗期基因/QTLs的效应积累可能是导致水稻超亲晚熟的主要原因第75-76页
    4.5 LTG1是一个控制低温生长的温敏基因第76页
    4.6 LTG1被成功的分离和克隆第76页
    4.7 LTG1在Asominori和NIL(ltg1)之间的突变可能导致识别底物的改变第76页
    4.8 LTG1是组成性表达基因并且可能控制细胞分裂第76-77页
    4.9 LTG1可能参与的调控途径第77页
    4.10 LTG1可能是人们经过长期自然选择而保存下来的第77页
    4.11 LTG1的育种价值第77-78页
    4.12 本研究的主要创新点第78-80页
参考文献第80-94页
附录第94-110页
在读期间发表论文第110-112页
致谢第112页

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