| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-16页 |
| 第一章 前言 | 第16-37页 |
| ·牙鲆变态发育 | 第16-20页 |
| ·牙鲆仔稚鱼发育阶段划分 | 第16-17页 |
| ·牙鲆变态发育中的形态学变化 | 第17-18页 |
| ·牙鲆变态发育机制的研究 | 第18-20页 |
| ·microRNA 研究概述 | 第20-36页 |
| ·miRNA 的生物形成和作用机制 | 第20-22页 |
| ·miRNAs 的特征 | 第22-23页 |
| ·miRNA 的鉴定及研究方法 | 第23-31页 |
| ·miRNA 的靶基因研究 | 第31-33页 |
| ·miRNA 的功能 | 第33-36页 |
| ·miRNA 的研究展望 | 第36页 |
| ·研究目的和意义 | 第36-37页 |
| 第二章 牙鲆变态发育中miRNA 的鉴定 | 第37-59页 |
| ·材料与方法 | 第37-48页 |
| ·牙鲆仔鱼实验和样品采集 | 第37页 |
| ·RNA 提取 | 第37-38页 |
| ·Solexa 测序样品准备 | 第38-41页 |
| ·Small RNA 的Solexa 测序及数据分析 | 第41-43页 |
| ·miRNA precursors（pre-miRNAs）的PCR 扩增及测序分析 | 第43-45页 |
| ·miRNA 的定量 PCR 检测 | 第45-47页 |
| ·Northern blot 检测miRNA | 第47-48页 |
| ·miRNA targets 的生物信息学预测 | 第48页 |
| ·结果 | 第48-57页 |
| ·牙鲆变态发育中总RNA 的提取 | 第48-49页 |
| ·牙鲆变态发育中小RNA 的Solexa 测序 | 第49页 |
| ·牙鲆变态发育中miRNA 的鉴定 | 第49-50页 |
| ·牙鲆miRNAs 前体的扩增 | 第50-53页 |
| ·牙鲆miRNAs 在仔稚鱼发育过程中的表达检测 | 第53-54页 |
| ·牙鲆miRNAs 的系统进化 | 第54-56页 |
| ·牙鲆miRNAs 的靶位点预测 | 第56-57页 |
| ·讨论 | 第57-59页 |
| 第三章 牙鲆变态发育中miRNA 的差异表达分析 | 第59-68页 |
| ·材料与方法 | 第59-61页 |
| ·动物实验和RNA 提取 | 第59页 |
| ·microRNA 芯片实验 | 第59-61页 |
| ·荧光定量PCR 检测 | 第61页 |
| ·结果 | 第61-66页 |
| ·miRNA 芯片结果分析 | 第61-63页 |
| ·牙鲆变态发育中miRNA 的差异表达筛选 | 第63-66页 |
| ·讨论 | 第66-68页 |
| 第四章 牙鲆变态过程中muscle-specific miRNAs 和MRFs 的表达及作用分析 | 第68-88页 |
| ·材料与方法 | 第69-71页 |
| ·动物实验和样品采集 | 第69页 |
| ·牙鲆变态期仔鱼的形态学观察 | 第69页 |
| ·RNA 提取 | 第69页 |
| ·反转录及荧光定量PCR | 第69-71页 |
| ·牙鲆miR-1、miR-133a 和miR-206a 的靶基因预测 | 第71页 |
| ·结果 | 第71-84页 |
| ·牙鲆变态发育中的形态学变化 | 第71-72页 |
| ·牙鲆变态发育中总RNA 的提取 | 第72-73页 |
| ·miR-1、miR-133a 和miR-206a 在牙鲆变态过程中的表达 | 第73-75页 |
| ·牙鲆变态中TH 对miR-1、miR-133a 和miR-206a 的表达调控 | 第75-77页 |
| ·miR-1、miR-133a 和miR-206a 在牙鲆成鱼不同组织中的表达 | 第77-79页 |
| ·MRFs 在牙鲆变态发育过程中的表达 | 第79页 |
| ·牙鲆变态中TH 对MRFs 的表达调控 | 第79-82页 |
| ·牙鲆miR-1、miR-133a 和miR-206a 的靶基因预测 | 第82-84页 |
| ·讨论 | 第84-88页 |
| 总结 | 第88-90页 |
| 主要结论 | 第88-89页 |
| 主要创新点 | 第89页 |
| 需要进一步解决的问题 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-100页 |
| 附录 | 第100-109页 |
| 附录一 牙鲆变态过程中miRNA 的鉴定及差异表达miRNA 筛选简表 | 第100-107页 |
| 附录二 试剂、仪器 | 第107-108页 |
| 1. 主要仪器设备 | 第107页 |
| 2. 主要试剂及工具酶 | 第107-108页 |
| 附录三 中英文缩略表（Abbreviations） | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 作者简介 | 第110页 |
