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鲆鲽类DEAD box RNA解旋酶家族基因的研究

摘要第5-8页
Abstract第8-10页
第一章 文献综述第17-40页
    第一节 DEAD box RNA解旋酶的研究进展第17-23页
        1 DEAD box解旋酶的结构特征第17-19页
        2 DEAD box解旋酶的功能特征第19-23页
            2.1 基本的生物化学特征:与核苷酸、RNA和蛋白质的结合第19-21页
            2.2 DEAD box解旋酶的功能第21-23页
    第二节 vasa基因的研究进展第23-27页
        1 vasa是生殖系标记基因第23-25页
            1.1 线虫glh1~4第23页
            1.2 海胆vasa第23-24页
            1.3 非洲爪蟾XVLG1第24页
            1.4 斑马鱼vasa第24页
            1.5 鸡Cvh第24-25页
            1.6 人vasa第25页
        2 vasa在硬骨鱼中的研究进展第25页
        3 vasa在硬骨鱼中的应用第25-27页
    第三节 Ddx3基因的研究进展第27-33页
        1 人类Ddx3基因的研究进展第27-31页
            1.1 Ddx3Y基因的研究进展第27页
            1.2 Ddx3X基因的研究进展第27-31页
        2 Ddx3基因与无性生殖第31页
        3 Ddx3基因与再生第31-32页
        4 Dax3基因与胚胎发育第32-33页
    第四节 p68基因的研究进展第33-39页
        1 p68和p72的共激活功能第33-35页
            1.1 生长调控:共激活细胞核激素受体第33-34页
            1.2 细胞周期停滞和凋亡:共激活肿瘤抑制因子p53第34页
            1.3 调控发育及分化:共激活MyoD和Runx2第34-35页
        2 p68和p72蛋白的翻译后修饰第35-36页
            2.1 p68的磷酸化第35-36页
            2.2 p68/p72的SUMO化和乙酰化第36页
        3 p68与转录隔离第36页
        4 p68与RNA清除第36-37页
        5 p68和p72的转录后加工功能第37-38页
            5.1 可变剪切第37页
            5.2 pri-mRNA的加工第37页
            5.3 核糖体RNA(rRNA)的加工第37-38页
        6 研究展望第38-39页
            6.1 p68/p72的RNA解旋酶活性起何作用?第38页
            6.2 p68和p72的各自的作用是什么?第38-39页
    第五节 本研究的目的和意义第39-40页
第二章 半滑舌鳎vasa基因的克隆及功能分析第40-77页
    第一节 半滑舌鳎vasa基因的克隆及序列分析第40-58页
        1 材料和方法第40-50页
            1.1 实验材料第40-41页
            1.2 实验用到的引物第41-42页
            1.3 半滑舌鳎cDNA文库的构建第42-44页
            1.4 肌肉组织DNA的提取第44页
            1.5 卵巢RACE文库的构建第44-45页
            1.6 半滑舌鳎vasa基因序列的获得第45-49页
            1.7 半滑舌vasa基因的巧列分析第49-50页
        2 结果第50-56页
            2.1 半滑舌鳎vasa基因mRNA序列分析第50页
            2.2 半滑舌鳎vasa基因组序列分析第50页
            2.3 半滑舌鳎vasa基因氨基酸序列分析第50-54页
            2.4 半滑舌鳎vasa基因拷贝数分析第54-55页
            2.5 半滑舌鳎vasa基因的系统进化分析第55-56页
        3 讨论第56-58页
            3.1 氨基酸序列分析第56-57页
            3.2 系统发生分析第57页
            3.3 可变剪切分析第57-58页
    第二节 半滑舌鳎vasa基因的表达分析第58-71页
        1 材料和方法第58-63页
            1.1 实验材料第58页
            1.2 实验方法第58页
            1.3 实时荧光定量PCR(qPCR)第58-60页
            1.4 组织原位杂交(ISH)第60-62页
            1.5 组织学观察(HE染色)第62-63页
        2 结果第63-68页
            2.1 组织特异性表达模式第63-64页
            2.2 vasa mRNA在性腺的细胞定位第64-65页
            2.3 vasa在胚胎发育不同时期的表达模式第65-66页
            2.4 vasa在幼鱼性腺分化时期的表达模式第66-68页
        3 讨论第68-71页
            3.1 半滑舌鳎vasa是生殖系标记基因第68-69页
            3.2 胚胎发育时期表达模式分析第69-70页
            3.3 vasa在性腺分化时期的表达模式第70-71页
    第三节 半滑舌鳎vasa启动子-EGFP表达载体的构建第71-77页
        1 材料和方法第71-74页
            1.1 实验材料第71页
            1.2 实验用到的引物第71页
            1.3 Pvas-EGFP-3'flank载体的构建第71-74页
        2 结果第74-76页
            2.1 启动子片段及3’侧翼区的克隆第74-75页
            2.2 构建Pvas-EGFP-3'flank载体的流程第75-76页
            2.3 Pvas-EGFP-3'flank质粒PCR鉴定第76页
        3 讨论第76-77页
第三章 牙鲆Ddx3基因的进化研究第77-104页
    第一节 脊椎动物Ddx3基因的序列分析第77-89页
        1 材料和方法第77-78页
            1.1 数据收集第77页
            1.2 牙鲆Ddx3基因的性别特异性克隆第77-78页
            1.3 系统发生分析第78页
            1.4 共线性分析第78页
        2 结果第78-84页
            2.1 序列比对查找脊椎动物Ddx3基因第78-80页
            2.2 牙鲆Ddx3基因的性别特异性扩增第80-81页
            2.3 系统发生分析第81页
            2.4 共线性分析第81-84页
        3 讨论第84-89页
            3.1 牙鲆Ddx3基因的性别特异性分析第84-85页
            3.2 人类Ddx3X/Y的起源第85-86页
            3.3 硬骨鱼类Ddx3a和Ddx3b的起源第86-87页
            3.4 硬骨鱼进化中发生的染色体易位第87-89页
    第二节 硬骨鱼类Ddx3基因的基因结构分析第89-92页
        1 材料和方法第89页
            1.1 基因结构分析第89页
            1.2 氨基酸序列分析第89页
        2 结果第89-90页
        3 讨论第90-92页
    第三节 硬骨鱼类Ddx3基因的选择压力分析第92-99页
        1 材料和方法第92页
            1.1 进化树的构建第92页
            1.2 选择压力分析第92页
        2 结果第92-98页
            2.1 进化树的构建第92-94页
            2.2 CODEML分析第94-97页
            2.3 正选择位点分析第97-98页
        3 讨论第98-99页
    第四节 牙鲆Ddx3基因的表达模式分析第99-104页
        1 材料和方法第99-100页
            1.1 实验材料第99页
            1.2 实验用到的引物第99页
            1.3 实验方法第99页
            1.4 实时荧光定量PCR(qPCR)第99-100页
            1.5 性腺组织原位杂交(ISH)第100页
        2 结果第100-103页
            2.1 牙鲆Ddx3基因在雌鱼各组织的表达模式第100-101页
            2.2 牙鲆Ddx3基因在雄鱼各组织的表达模式第101页
            2.3 卵巢原位杂交第101-102页
            2.4 精巢原位杂交第102-103页
        3 讨论第103-104页
第四章 牙鲆p68基因的克隆及进化分析第104-121页
    第一节 牙鲆p68基因的序列分析第104-108页
        1 材料和方法第104页
            1.1 序列比对第104页
            1.2 牙鲆p68基因的序列分析第104页
        2 结果第104-106页
            2.1 牙鲆p68基因结构分析第104-105页
            2.2 氨基酸序列分析第105-106页
        3 计论第106-108页
    第二节 牙鲆p68基因的表达模式分析第108-114页
        1 材料和方法第108-109页
            1.1 实验材料第108页
            1.2 实验用到的引物第108-109页
            1.3 实验方法第109页
            1.4 实时荧光定量PCR(qPCR)第109页
            1.5 性腺组织原位杂交(ISH)第109页
        2 结果第109-112页
            2.1 牙鲆p68基因在各组织的表达分析第109-111页
            2.2 牙鲆p68b基因在卵巢的组织原位杂交第111-112页
        3 讨论第112-114页
    第三节 牙鲆p68基因的进化分析第114-121页
        1 材料和方法第114页
            1.1 数据收集第114页
            1.2 系统发生分析第114页
            1.3 共线性分析第114页
        2 结果第114-119页
            2.1 序列比对查找脊椎动物p68基因第114-116页
            2.2 系统发生分析第116-118页
            2.3 基因共线性分析第118-119页
            2.4 染色体共线性分析第119页
        3 讨论第119-121页
总结第121-123页
    1 半滑舌鳎vasa基因的克隆,表达分析及标记载体的构建第121页
    2 牙鲆Ddx3基因的进化研究第121-122页
    3 牙鲆p68基因的克隆及进化分析第122-123页
参考文献第123-145页
致谢第145-146页
个人简历第146页
发表的学术论文第146页

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