面向微生物代谢网络的分析设计方法研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·课题背景 | 第10-11页 |
| ·本文的研究内容及主要工作 | 第11-13页 |
| ·本文的研究内容 | 第11-12页 |
| ·本文的特色工作 | 第12-13页 |
| ·本文的内容安排 | 第13-14页 |
| ·本章小结 | 第14-16页 |
| 第二章 多源数据库的数据整合 | 第16-28页 |
| ·引言 | 第16-19页 |
| ·存在问题 | 第17页 |
| ·本文的方法 | 第17-19页 |
| ·算法流程 | 第19-23页 |
| ·HPA算法 | 第19-21页 |
| ·GPM算法 | 第21-22页 |
| ·改进算法 | 第22-23页 |
| ·算法比较 | 第23-25页 |
| ·数据源 | 第23页 |
| ·实验框架 | 第23-25页 |
| ·实验结果 | 第25页 |
| ·数据整合结果统计 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-28页 |
| 第三章 微生物代谢路径的搜索与设计 | 第28-56页 |
| ·引言 | 第28-30页 |
| ·相关工作介绍 | 第28-30页 |
| ·特色工作 | 第30页 |
| ·问题分析 | 第30-35页 |
| ·代谢网络的表示 | 第30-31页 |
| ·查找算法设计 | 第31-33页 |
| ·算法改进 | 第33-35页 |
| ·方法 | 第35-43页 |
| ·数据源使用 | 第35页 |
| ·物质转换图的构建 | 第35-38页 |
| ·物质转换图的存储 | 第38-40页 |
| ·查找算法 | 第40页 |
| ·物质转换图的权重及权重的转换 | 第40-42页 |
| ·约束的满足 | 第42-43页 |
| ·系统架构与功能实现 | 第43-52页 |
| ·代谢路径搜索与设计(MRSD) | 第43页 |
| ·代谢路径搜索(MRS) | 第43-49页 |
| ·代谢路径设计(MRD) | 第49-51页 |
| ·MRS与MRD功能互补的实现 | 第51-52页 |
| ·应用 | 第52-55页 |
| ·MRSD功能 | 第52-53页 |
| ·代谢路径搜索(MRS) | 第53-54页 |
| ·代谢路径设计(MRD) | 第54页 |
| ·MRS与MRD的功能互补 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 一种微生物种群预测方法的研究 | 第56-65页 |
| ·引言 | 第56-58页 |
| ·元基因组研究 | 第56页 |
| ·研究现状 | 第56-57页 |
| ·本章的研究内容 | 第57-58页 |
| ·方法 | 第58-62页 |
| ·Set Cover问题 | 第58页 |
| ·微生物群落预测归约为Set Cover问题 | 第58-59页 |
| ·算法流程 | 第59-60页 |
| ·算法分析 | 第60-61页 |
| ·方法改进 | 第61-62页 |
| ·应用 | 第62-64页 |
| ·数据源及预处理 | 第63页 |
| ·预测结果 | 第63-64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第五章 结论 | 第65-69页 |
| ·工作总结 | 第65-66页 |
| ·后续的主要工作 | 第66-69页 |
| 参考文献 | 第69-75页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第75页 |
