基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-8页 |
第1章 绪论 | 第8-13页 |
·研究背景及意义 | 第8-9页 |
·研究现状 | 第9-11页 |
·单体型推导模型与算法 | 第9-10页 |
·补缺模型与算法 | 第10-11页 |
·本文工作 | 第11-12页 |
·论文组织 | 第12-13页 |
第2章 相关技术与知识 | 第13-22页 |
·基因组学的相关概念 | 第13-17页 |
·染色体和DNA | 第13-14页 |
·SNP 位点与基因变异 | 第14-15页 |
·单体型与基因型 | 第15-17页 |
·连锁不平衡与不完全连锁 | 第17-18页 |
·基因数据集的分类 | 第18-20页 |
·基因测序的工具——基因芯片 | 第20-21页 |
·本章小结 | 第21-22页 |
第3章 群体数据集单体型推导 | 第22-37页 |
·问题定义 | 第22-23页 |
·已有工作介绍 | 第23-28页 |
·完美进化单体分型算法 | 第23-24页 |
·期望最大算法(EM) | 第24-26页 |
·加入分块的EM 算法 | 第26-28页 |
·多位点分块单体型推导算法EPLEM 算法 | 第28-35页 |
·研究思路 | 第28-29页 |
·基因型在多位点关联下的分块 | 第29-31页 |
·基因型分块下的推导与合并 | 第31-32页 |
·实验结果及性能分析 | 第32-35页 |
·本章小结 | 第35-37页 |
第4章 基于分块的非参考单体型补缺 | 第37-48页 |
·问题描述 | 第37页 |
·已有相关工作介绍 | 第37-41页 |
·IMPUTE—基因型补缺下的多位点方法 | 第37-38页 |
·EMINIM—可调参数的补缺算法 | 第38-40页 |
·连锁不平衡下的非参考单体型补缺 | 第40-41页 |
·基于分块的非参考单体型补缺 | 第41-47页 |
·研究思路 | 第41-42页 |
·非参考单体型下的单体型补缺 | 第42-43页 |
·非参考单体型下的基因型补缺 | 第43-45页 |
·实验结果及性能评价 | 第45-47页 |
·本章小结 | 第47-48页 |
第5章 总结 | 第48-51页 |
·本文工作 | 第48页 |
·本文贡献与创新之处 | 第48-49页 |
·进一步工作 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-54页 |
附录 1 插图索引 | 第54-55页 |
附录 2 表格索引 | 第55-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
在读期间发表的学术论文 | 第57-58页 |
攻读学位期间参加的科研项目 | 第58页 |