基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-13页 |
| ·研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·研究现状 | 第9-11页 |
| ·单体型推导模型与算法 | 第9-10页 |
| ·补缺模型与算法 | 第10-11页 |
| ·本文工作 | 第11-12页 |
| ·论文组织 | 第12-13页 |
| 第2章 相关技术与知识 | 第13-22页 |
| ·基因组学的相关概念 | 第13-17页 |
| ·染色体和DNA | 第13-14页 |
| ·SNP 位点与基因变异 | 第14-15页 |
| ·单体型与基因型 | 第15-17页 |
| ·连锁不平衡与不完全连锁 | 第17-18页 |
| ·基因数据集的分类 | 第18-20页 |
| ·基因测序的工具——基因芯片 | 第20-21页 |
| ·本章小结 | 第21-22页 |
| 第3章 群体数据集单体型推导 | 第22-37页 |
| ·问题定义 | 第22-23页 |
| ·已有工作介绍 | 第23-28页 |
| ·完美进化单体分型算法 | 第23-24页 |
| ·期望最大算法(EM) | 第24-26页 |
| ·加入分块的EM 算法 | 第26-28页 |
| ·多位点分块单体型推导算法EPLEM 算法 | 第28-35页 |
| ·研究思路 | 第28-29页 |
| ·基因型在多位点关联下的分块 | 第29-31页 |
| ·基因型分块下的推导与合并 | 第31-32页 |
| ·实验结果及性能分析 | 第32-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第4章 基于分块的非参考单体型补缺 | 第37-48页 |
| ·问题描述 | 第37页 |
| ·已有相关工作介绍 | 第37-41页 |
| ·IMPUTE—基因型补缺下的多位点方法 | 第37-38页 |
| ·EMINIM—可调参数的补缺算法 | 第38-40页 |
| ·连锁不平衡下的非参考单体型补缺 | 第40-41页 |
| ·基于分块的非参考单体型补缺 | 第41-47页 |
| ·研究思路 | 第41-42页 |
| ·非参考单体型下的单体型补缺 | 第42-43页 |
| ·非参考单体型下的基因型补缺 | 第43-45页 |
| ·实验结果及性能评价 | 第45-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第5章 总结 | 第48-51页 |
| ·本文工作 | 第48页 |
| ·本文贡献与创新之处 | 第48-49页 |
| ·进一步工作 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 附录 1 插图索引 | 第54-55页 |
| 附录 2 表格索引 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第57-58页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目 | 第58页 |