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基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
第1章 绪论第8-13页
   ·研究背景及意义第8-9页
   ·研究现状第9-11页
     ·单体型推导模型与算法第9-10页
     ·补缺模型与算法第10-11页
   ·本文工作第11-12页
   ·论文组织第12-13页
第2章 相关技术与知识第13-22页
   ·基因组学的相关概念第13-17页
     ·染色体和DNA第13-14页
     ·SNP 位点与基因变异第14-15页
     ·单体型与基因型第15-17页
   ·连锁不平衡与不完全连锁第17-18页
   ·基因数据集的分类第18-20页
   ·基因测序的工具——基因芯片第20-21页
   ·本章小结第21-22页
第3章 群体数据集单体型推导第22-37页
   ·问题定义第22-23页
   ·已有工作介绍第23-28页
     ·完美进化单体分型算法第23-24页
     ·期望最大算法(EM)第24-26页
     ·加入分块的EM 算法第26-28页
   ·多位点分块单体型推导算法EPLEM 算法第28-35页
     ·研究思路第28-29页
     ·基因型在多位点关联下的分块第29-31页
     ·基因型分块下的推导与合并第31-32页
     ·实验结果及性能分析第32-35页
   ·本章小结第35-37页
第4章 基于分块的非参考单体型补缺第37-48页
   ·问题描述第37页
   ·已有相关工作介绍第37-41页
     ·IMPUTE—基因型补缺下的多位点方法第37-38页
     ·EMINIM—可调参数的补缺算法第38-40页
     ·连锁不平衡下的非参考单体型补缺第40-41页
   ·基于分块的非参考单体型补缺第41-47页
     ·研究思路第41-42页
     ·非参考单体型下的单体型补缺第42-43页
     ·非参考单体型下的基因型补缺第43-45页
     ·实验结果及性能评价第45-47页
   ·本章小结第47-48页
第5章 总结第48-51页
   ·本文工作第48页
   ·本文贡献与创新之处第48-49页
   ·进一步工作第49-51页
参考文献第51-54页
附录 1 插图索引第54-55页
附录 2 表格索引第55-56页
致谢第56-57页
在读期间发表的学术论文第57-58页
攻读学位期间参加的科研项目第58页

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