| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 1.文献综述 | 第12-28页 |
| 1.1 植物中硼的生理功能研究进展 | 第12-16页 |
| 1.1.1 硼在植物细胞壁、细胞膜中的作用 | 第12-15页 |
| 1.1.1.1 植物细胞壁的结构 | 第12页 |
| 1.1.1.2 硼在植物细胞壁中的作用 | 第12-14页 |
| 1.1.1.3 硼在植物细胞膜中的作用 | 第14-15页 |
| 1.1.2 硼在植物代谢过程中的作用 | 第15-16页 |
| 1.1.2.1 硼与碳水化合物的代谢 | 第15页 |
| 1.1.2.2 硼与酚类物质的代谢 | 第15页 |
| 1.1.2.3 硼与激素的代谢 | 第15-16页 |
| 1.2 拟南芥中硼的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.1 拟南芥中硼转运子的克隆 | 第16-17页 |
| 1.2.2 拟南芥中硼转录因子的鉴定 | 第17页 |
| 1.2.3 拟南芥缺硼胁迫时生长激素转运子的功能 | 第17-18页 |
| 1.3 甘蓝型油菜中硼的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.3.1 甘蓝型油菜硼高、低效品种细胞壁组分差异 | 第18-19页 |
| 1.3.2 甘蓝型油菜中硼高效基因的定位 | 第19页 |
| 1.3.3 甘蓝型油菜中硼转运子的克隆 | 第19-20页 |
| 1.3.4 甘蓝型油菜在低硼处理时根系蛋白质谱 | 第20-21页 |
| 1.3.5 甘蓝型油菜中植物激素对缺硼胁迫的响应 | 第21页 |
| 1.4 可变剪接 | 第21-28页 |
| 1.4.1 可变剪接的分子机制 | 第21-23页 |
| 1.4.2 可变剪接的功能 | 第23-24页 |
| 1.4.3 可变剪接的调控 | 第24-26页 |
| 1.4.3.1 SR剪接因子与可变剪接的调控 | 第24-25页 |
| 1.4.3.2 RNA二级结构与可变剪接的调控 | 第25页 |
| 1.4.3.3 表观遗传与可变剪接的调控 | 第25页 |
| 1.4.3.4 RNA聚合酶II与可变剪接的调控 | 第25-26页 |
| 1.4.4 可变剪接在植物非生物胁迫领域中的应用 | 第26-28页 |
| 2.研究内容、目的和技术路线 | 第28-29页 |
| 2.1 研究内容 | 第28页 |
| 2.2 研究目的 | 第28页 |
| 2.3 技术路线 | 第28-29页 |
| 3 材料与方法 | 第29-34页 |
| 3.1 试验材料、方法及转录组测序数据前处理 | 第29页 |
| 3.2 转录组测序数据的分析 | 第29-30页 |
| 3.2.1 甘蓝型油菜转录本的拼接 | 第29页 |
| 3.2.2 可变剪切基因的鉴定 | 第29页 |
| 3.2.3 差异剪切基因的鉴定 | 第29页 |
| 3.2.4 可变剪切基因和差异剪切基因的GO富集性分析 | 第29-30页 |
| 3.2.5 差异剪切基因的KEGG富集性分析 | 第30页 |
| 3.3 差异剪切基因的鉴定 | 第30-33页 |
| 3.3.1 候选基因引物的设计 | 第30-31页 |
| 3.3.2 RT-PCR验证 | 第31-33页 |
| 3.3.2.1 RNA浓度检测 | 第31页 |
| 3.3.2.2 RNA质量检测 | 第31页 |
| 3.3.2.3 RNA的反转录与cDNA的合成 | 第31-32页 |
| 3.3.2.4 RT-PCR反应 | 第32-33页 |
| 3.4 基因网络及种子基因预测 | 第33-34页 |
| 3.4.1 种子基因（Seed gene）预测 | 第33页 |
| 3.4.2 Cytoscape软件 | 第33-34页 |
| 4 结果 | 第34-77页 |
| 4.1 甘蓝型油菜硼高、低效品种转录本的拼接 | 第34-38页 |
| 4.1.1 转录组测序结果与参考基因组比对 | 第34页 |
| 4.1.2 新转录本和新基因的预测 | 第34-38页 |
| 4.2 甘蓝型油菜硼高、低效品种转录组可变剪接事件 | 第38-46页 |
| 4.2.1 可变剪接事件的鉴定 | 第38-39页 |
| 4.2.2 硼高、低效品种可变剪接事件的分布 | 第39-41页 |
| 4.2.3 硼高、低效品种发生可变剪接基因的剪接类型 | 第41-44页 |
| 4.2.4 硼高、低效品种发生可变剪接及非可变剪接基因的功能分析 | 第44-46页 |
| 4.3 甘蓝型油菜硼高、低效品种差异可变剪接基因 | 第46-71页 |
| 4.3.1 差异可变剪接基因的鉴定 | 第46-52页 |
| 4.3.2 硼高、低效品种差异剪接基因四种剪接类型的数目 | 第52-54页 |
| 4.3.3 低硼胁迫硼高、低效品种差异剪接基因的KEGG代谢通络 | 第54-58页 |
| 4.3.4 低硼胁迫硼高、低效品种差异剪接基因的鉴定 | 第58-60页 |
| 4.3.5 低硼胁迫硼高、低效品种差异剪接基因和差异表达基因 | 第60-69页 |
| 4.3.6 低硼胁迫硼高、低效品种同时发生差异剪接和差异表达基因验证 | 第69-71页 |
| 4.4 低硼胁迫甘蓝型油菜硼高、低效品种剪接调控因子的分析 | 第71-77页 |
| 4.4.1 低硼胁迫青油10号和Westar10剪接调控因子鉴定及其靶基因预测 | 第71-74页 |
| 4.4.2 低硼胁迫青油10号和Westar10中剪接调控因子的验证 | 第74-77页 |
| 5 讨论 | 第77-82页 |
| 5.1 不同硼水平甘蓝型油菜硼高、低效品种转录本 | 第77页 |
| 5.2 不同硼水平甘蓝型油菜硼高、低效品种发生的可变剪接事件 | 第77-78页 |
| 5.3 不同硼水平甘蓝型油菜硼高、低效品种发生的差异可变剪接事件 | 第78-79页 |
| 5.4 低硼胁迫甘蓝型油菜中差异表达和差异剪接基因 | 第79页 |
| 5.5 低硼胁迫甘蓝型油菜SR剪接调控因子 | 第79-80页 |
| 5.6 甘蓝型油菜响应低硼胁迫差异剪接基因 | 第80-82页 |
| 5.6.1 甘蓝型油菜响应低硼胁迫重要的差异剪接基因 | 第80页 |
| 5.6.2 低硼胁迫甘蓝型油菜同时发生差异剪接和差异表达的基因 | 第80-81页 |
| 5.6.3 低硼胁迫甘蓝型油菜SR剪接调控因子 | 第81-82页 |
| 6.结论与展望 | 第82-85页 |
| 6.1 结论 | 第82-83页 |
| 6.2 展望 | 第83-85页 |
| 6.2.1 甘蓝型油菜低硼胁迫相关可变剪接基因转录本的研究 | 第83-84页 |
| 6.2.2 低硼胁迫甘蓝型油菜SR剪接调控因子及其下游基因的研究 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
