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山新杨生长素关键基因响应木霉和链格孢菌诱导的转录组分析

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第10-18页
    1.1 课题背景第10页
    1.2 山新杨简介第10页
    1.3 木霉菌生防作用第10-13页
        1.3.1 促生作用第10-11页
        1.3.2 防病机制第11-13页
    1.4 链格孢菌研究第13-14页
        1.4.1 链格孢菌生物学特性第13页
        1.4.2 杨树叶枯病的危害及防治第13-14页
    1.5 生长素合成及信号转导研究进展第14-16页
        1.5.1 生长素合成第14页
        1.5.2 生长素信号转导第14-16页
    1.6 转录组测序技术第16-17页
    1.7 课题来源及研究的目的与意义第17-18页
        1.7.1 课题来源第17页
        1.7.2 研究的目的与意义第17-18页
2 转录组测序及cDNA文库构建第18-27页
    2.1 实验材料第18页
        2.1.1 供试培养基第18页
        2.1.2 供试植物第18页
        2.1.3 供试菌株第18页
    2.2 实验方法第18-20页
        2.2.1 山新杨组培苗处理方法第18-19页
        2.2.2 转录组测序及cDNA文库构建第19-20页
    2.3 结果与分析第20-25页
        2.3.1 RNA质量第20-21页
        2.3.2 测序数据产出统计第21-22页
        2.3.3 功能注释第22-23页
        2.3.4 基因表达水平分析第23页
        2.3.5 差异基因筛选第23-25页
    2.4 讨论第25页
        2.4.1 转录组cDNA文库构建第25页
        2.4.2 转录组测序技术第25页
    2.5 本章小结第25-27页
3 山新杨生长素合成关键基因应答机制第27-33页
    3.1 实验材料第27页
    3.2 实验方法第27页
        3.2.1 差异基因筛选第27页
        3.2.2 差异基因表达水平分析第27页
    3.3 结果与分析第27-31页
        3.3.1 差异基因筛选第27-28页
        3.3.2 差异基因表达聚类分析第28-29页
        3.3.3 差异基因表达模式分析第29-31页
    3.4 讨论第31-32页
    3.5 本章小结第32-33页
4 山新杨生长素信号转导关键基因应答机制第33-45页
    4.1 实验材料第33页
    4.2 实验方法第33页
        4.2.1 差异基因筛选第33页
        4.2.2 差异基因表达水平分析第33页
    4.3 结果与分析第33-43页
        4.3.1 差异基因筛选第33-34页
        4.3.2 差异基因表达聚类分析第34-35页
        4.3.3 不同样品中差异基因数目第35-37页
        4.3.4 差异基因表达模式分析第37-43页
    4.4 讨论第43-44页
    4.5 本章小结第44-45页
5 ARF基因家族差异表达模式分析及RT-qPCR验证第45-55页
    5.1 实验材料第45页
    5.2 实验方法第45-47页
        5.2.1 ARF基因挖掘第45页
        5.2.2 系统进化分析第45页
        5.2.3 差异基因表达模式分析第45页
        5.2.4 RT-qPCR验证第45-47页
    5.3 结果与分析第47-53页
        5.3.1 ARF基因氨基酸生物学信息分析第47-48页
        5.3.2 系统进化分析第48-49页
        5.3.3 差异基因表达模式分析第49-52页
        5.3.4 RT-qPCR验证第52-53页
    5.4 讨论第53-54页
    5.5 本章小结第54-55页
结论第55-56页
参考文献第56-61页
攻读学位期间发表的学术论文第61-62页
致谢第62-63页

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