| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 英文缩略表 | 第7-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-26页 |
| 1.1 分子标记技术 | 第10-11页 |
| 1.1.1 早期分子标记技术 | 第10页 |
| 1.1.2 SNP标记 | 第10-11页 |
| 1.2.3 SNP芯片 | 第11页 |
| 1.2 选择相关理论 | 第11-15页 |
| 1.2.1 选择 | 第11-12页 |
| 1.2.2 选择相关理论 | 第12-14页 |
| 1.2.3 选择性清除与搭载效应 | 第14-15页 |
| 1.3 选择信号 | 第15-25页 |
| 1.3.1 基本概念 | 第15页 |
| 1.3.2 选择信号研究意义 | 第15-16页 |
| 1.3.3 选择信号的检测方法 | 第16-20页 |
| 1.3.4 选择信号在畜禽中的研究进展 | 第20-23页 |
| 1.3.5 X染色体选择信号研究的意义 | 第23页 |
| 1.3.6 选择信号存在的问题 | 第23-25页 |
| 1.3.7 选择信号研究展望 | 第25页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-32页 |
| 2.1 试验动物与样品采集 | 第26页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第26页 |
| 2.1.2 血样采集 | 第26页 |
| 2.2 主要试验仪器与试剂 | 第26-27页 |
| 2.2.1 主要试验仪器及来源 | 第26-27页 |
| 2.2.2 主要试剂及来源 | 第27页 |
| 2.3 实验方法与步骤 | 第27-30页 |
| 2.3.1 生长发育性状的测定和方法 | 第27-28页 |
| 2.3.2 绵羊基因组DNA提取与检测 | 第28-29页 |
| 2.3.3 SNP分型 | 第29-30页 |
| 2.4 数据处理与统计分析 | 第30-32页 |
| 2.4.1 SNP芯片数据的质量控制 | 第30-31页 |
| 2.4.2 F_(ST)检验 | 第31页 |
| 2.4.3 F_(ST)离群值的确定 | 第31-32页 |
| 2.4.4 候选基因的检测和注释 | 第32页 |
| 2.4.5 候选基因的富集分析 | 第32页 |
| 3. 结果与分析 | 第32-46页 |
| 3.1 生长发育性状的统计 | 第32-33页 |
| 3.2 绵羊基因组DNA检测结果 | 第33页 |
| 3.3 SNP分型及质量控制 | 第33-37页 |
| 3.4 全基因组FST值的分布 | 第37-43页 |
| 3.4.1 常染色体F_(ST)值的分布 | 第37-42页 |
| 3.4.2 X染色体F_(ST)值的分布 | 第42-43页 |
| 3.5 候选基因的确定及检测 | 第43-44页 |
| 3.5.1 常染色体选择信号候选基因 | 第43页 |
| 3.5.2 与全基因组CNV和GWAS所检测到的基因比对结果 | 第43-44页 |
| 3.5.3 X染色体选择信号候选基因 | 第44页 |
| 3.6 候选基因的富集分析 | 第44-46页 |
| 3.6.1 常染色体候选基因的富集分析 | 第44-45页 |
| 3.6.2 X染色体候选基因的富集分析和通路分析 | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-52页 |
| 4.1 关于本研究使用的绵羊品种及其群体结构 | 第46-47页 |
| 4.2 统计方法影响FST值估计准确度 | 第47-48页 |
| 4.3 鉴定离群值的方法 | 第48-49页 |
| 4.4 常染色体与X染色体选择信号检测结果的联系与区别 | 第49页 |
| 4.5 选择对基因组产生的影响 | 第49-52页 |
| 4.6 本研究的局限性 | 第52页 |
| 5 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第63页 |