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日本对虾类甲壳肽(crustin-like)基因在溶藻弧菌和白斑综合征病毒感染过程中的作用机制研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
前言第13-25页
1 日本对虾crustin-like基因全长序列的克隆第25-38页
    1.1 试验材料与仪器第25-27页
        1.1.1 试验动物与毒种第25页
        1.1.2 试验试剂第25-26页
        1.1.3 试验仪器与设备第26-27页
    1.2 试验方法第27-33页
        1.2.1 样品采集第27页
        1.2.2 血淋巴总RNA提取第27页
        1.2.3 cDNA末端快速扩增(RACE)第27-31页
            1.2.3.1 3' RACE第27-29页
            1.2.3.2 5' RACE第29-31页
        1.2.4 PCR扩增全长第31页
        1.2.5 克隆与测序第31-33页
            1.2.5.1 琼脂糖切胶回收第32页
            1.2.5.2 载体连接与转化第32页
            1.2.5.3 菌液PCR与测序第32-33页
            1.2.5.4 测序结果分析第33页
    1.3 试验结果第33-37页
        1.3.1 全长序列拼接与分析第33-35页
        1.3.2 保守性分析第35页
        1.3.3 进化树构建第35-37页
    1.4 讨论第37页
    1.5 小结第37-38页
2 日本对虾crustin-like基因敲低及免疫功能探究第38-51页
    2.1 试验材料与仪器第38页
        2.1.1 试验动物与毒种第38页
        2.1.2 试验试剂第38页
        2.1.3 试验仪器与设备第38页
    2.2 试验方法第38-45页
        2.2.1 组织表达量检测第38-40页
            2.2.1.1 对虾组织总RNA提取第38-39页
            2.2.1.2 cDNA合成第39页
            2.2.1.3 实时荧光定量检测第39-40页
            2.2.1.4 结果分析第40页
        2.2.2 dsRNA质粒构建第40-41页
            2.2.2.1 HT115感受态细胞的制备第40页
            2.2.2.2 引物设计第40-41页
            2.2.2.3 融合表达载体第41页
        2.2.3 CRU-dsRNA的诱导表达第41-42页
            2.2.3.1 dsRNA提取第41页
            2.2.3.2 dsRNA退火第41-42页
            2.2.3.3 dsRNA纯化第42页
            2.2.3.4 dsRNA纯度检测第42页
        2.2.4 CRU-dsRNA干扰效果检测第42页
            2.2.4.1 RNA提取第42页
            2.2.4.2 cDNA合成第42页
            2.2.4.3 实时荧光定量检测第42页
        2.2.5 免疫基因检测第42-43页
            2.2.5.1 引物设计第42-43页
            2.2.5.2 dsRNA注射处理第43页
            2.2.5.3 RNA提取第43页
            2.2.5.4 cDNA合成第43页
            2.2.5.5 实时荧光定量检测第43页
        2.2.6 免疫活性检测第43页
            2.2.6.1 dsRNA注射处理第43页
            2.2.6.2 血细胞总数(THC)检测第43页
            2.2.6.3 PO活性第43页
            2.2.6.4 SOD活性第43页
        2.2.7 数据统计第43-45页
    2.3 试验结果第45-49页
        2.3.1 crustin-like组织表达差异性分析第45页
        2.3.2 dsRNA体外试验干扰crustin-like表达第45-47页
            2.3.2.1 CRU-dsRNA质粒构建第45-46页
            2.3.2.2 dsRNA纯度检测第46页
            2.3.2.3 CRU-dsRNA干扰效果检测第46-47页
            2.3.2.4 干扰时效检测第47页
        2.3.3 重要免疫基因表达量检测第47-48页
        2.3.4 免疫活性检测第48-49页
            2.3.4.1 血细胞总数(THC)检测第48页
            2.3.4.2 酚氧化酶(PO)活性第48-49页
            2.3.4.3 超氧化物歧化酶(SOD)活性第49页
    2.4 讨论第49-50页
    2.5 小结第50-51页
3 日本对虾crustin-like基因抗菌活性的探究第51-61页
    3.1 试验材料与仪器第51页
        3.1.1 试验动物与毒种第51页
        3.1.2 试验试剂第51页
        3.1.3 试验仪器与设备第51页
    3.2 试验方法第51-54页
        3.2.1 病原诱导表达变化分析第51页
            3.2.1.1 对虾攻毒处理第51页
            3.2.1.2 RNA提取第51页
            3.2.1.3 cDNA合成第51页
            3.2.1.4 实时荧光定量检测第51页
            3.2.1.5 结果分析第51页
        3.2.2 Kaplan–Meier生存分析试验第51-52页
            3.2.2.1 dsRNA及攻毒处理第51-52页
            3.2.2.2 分组设计第52页
            3.2.2.3 数据统计第52页
        3.2.3 吞噬试验第52-53页
            3.2.3.1 FITC标记V. alginolyticus第52页
            3.2.3.2 日本对虾血淋巴细胞培养第52-53页
            3.2.3.3 吞噬与制片第53页
            3.2.3.4 流式细胞术计算吞噬百分率第53页
        3.2.4 THC检测第53-54页
        3.2.5 血细胞凋亡第54页
        3.2.6 数据统计第54页
    3.3 试验结果第54-59页
        3.3.1 病原诱导crustin-like表达变化分析第54-55页
        3.3.2 Kaplan–Meier生存分析试验第55-56页
        3.3.3 Crustin-like对细胞吞噬作用的影响第56-57页
            3.3.3.1 Crustin-like对细胞吞噬的影响第56页
            3.3.3.2 Crustin-like对细胞骨架蛋白的影响第56-57页
        3.3.4 THC检测第57-58页
        3.3.5 Crustin-like对细胞凋亡的影响第58-59页
    3.4 讨论第59-60页
    3.5 小结第60-61页
4 日本对虾crustin-like基因促进病毒复制的研究第61-77页
    4.1 试验材料与仪器第61页
        4.1.1 试验动物与毒种第61页
        4.1.2 试验试剂第61页
        4.1.3 试验仪器与设备第61页
    4.2 试验方法第61-68页
        4.2.1 病原诱导crustin-like表达变化分析第61页
            4.2.1.1 实验材料处理第61页
            4.2.1.2 RNA提取第61页
            4.2.1.3 cDNA合成第61页
            4.2.1.4 实时荧光定量检测第61页
            4.2.1.5 结果分析第61页
        4.2.2 WSSV提取与纯化第61-62页
        4.2.3 病毒拷贝数检测第62-64页
            4.2.3.1 标准品制备第62-63页
            4.2.3.2 dsRNA注射处理第63页
            4.2.3.3 基因组DNA提取第63页
            4.2.3.4 检测体系与程序第63-64页
            4.2.3.5 数据分析第64页
        4.2.4 THC检测第64页
        4.2.5 Kaplan–Meier生存分析试验第64-65页
            4.2.5.1 分组设计第64页
            4.2.5.2 数据统计第64-65页
        4.2.6 细胞吞噬试验第65-66页
            4.2.6.1 WSSV病毒灭活第65页
            4.2.6.2 FITC标记病毒第65页
            4.2.6.3 日本对虾血淋巴细胞培养第65页
            4.2.6.4 吞噬与制片第65页
            4.2.6.5 流式细胞术计算吞噬百分率第65-66页
        4.2.7 血细胞凋亡第66页
        4.2.8 WSSV早期基因检测第66-67页
            4.2.8.1 dsRNA注射处理第66页
            4.2.8.2 RNA提取第66页
            4.2.8.3 第一链cDNA合成第66-67页
            4.2.8.4 半定量PCR第67页
        4.2.9 数据统计第67-68页
    4.3 试验结果第68-75页
        4.3.1 病原诱导表达变化分析第68页
        4.3.2 THC检测第68-69页
        4.3.3 WSSV提取第69-70页
        4.3.4 WSSV拷贝数检测第70页
        4.3.5 Kaplan–Meier生存分析试验第70-71页
        4.3.6 Crustin-like对细胞吞噬作用的影响第71-73页
            4.3.6.1 Crustin-like对细胞吞噬的影响第71-72页
            4.3.6.2 Crustin-like对细胞骨架蛋白的影响第72-73页
        4.3.7 Crustin-like对细胞凋亡的影响第73-74页
        4.3.8 WSSV早期基因的检测第74-75页
    4.4 讨论第75-76页
    4.5 小结第76-77页
5. 全文总结第77-78页
参考文献第78-87页
附录第87-88页
个人简介第88-89页
致谢第89页

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